MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020536	TTA	2	6	2729250	2729255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_020536	TTTC	2	8	2729267	2729274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16003	NC_020536	TTA	2	6	2729282	2729287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_020536	TAT	2	6	2730440	2730445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_020536	TAT	2	6	2730464	2730469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_020536	ATTTTA	2	12	2730501	2730512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_020536	T	6	6	2730513	2730518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_020536	CTATTT	2	12	2731049	2731060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16009	NC_020536	TAA	2	6	2731828	2731833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_020536	TGA	2	6	2731862	2731867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_020536	TAT	2	6	2731899	2731904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_020536	AT	3	6	2733616	2733621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_020536	CATT	2	8	2733635	2733642	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16014	NC_020536	CAA	2	6	2733656	2733661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_020536	A	6	6	2734240	2734245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_020536	CCT	2	6	2735105	2735110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16017	NC_020536	T	6	6	2735110	2735115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_020536	A	7	7	2735124	2735130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_020536	TAG	2	6	2735213	2735218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_020536	ATA	3	9	2735233	2735241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_020536	CTT	2	6	2735285	2735290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_020536	AATT	2	8	2735299	2735306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_020536	GTG	2	6	2735327	2735332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_020536	ATTCGA	2	12	2735369	2735380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16025	NC_020536	T	6	6	2735402	2735407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_020536	GGT	2	6	2735409	2735414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_020536	TGTA	2	8	2735417	2735424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_020536	A	6	6	2735435	2735440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_020536	AT	5	10	2736020	2736029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_020536	ATC	2	6	2736046	2736051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_020536	AGGT	2	8	2736134	2736141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_020536	ATG	2	6	2737272	2737277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_020536	TTAA	2	8	2738317	2738324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_020536	T	6	6	2738379	2738384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_020536	CATA	2	8	2738390	2738397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16036	NC_020536	TAAAT	2	10	2738432	2738441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_020536	CAAA	2	8	2739116	2739123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16038	NC_020536	GAT	2	6	2739169	2739174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_020536	ATG	2	6	2739195	2739200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_020536	ATC	2	6	2740014	2740019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_020536	GCC	2	6	2740106	2740111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16042	NC_020536	T	7	7	2740121	2740127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_020536	T	6	6	2740148	2740153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_020536	TAC	2	6	2740180	2740185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_020536	ATCTG	2	10	2740299	2740308	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16046	NC_020536	CTA	2	6	2740328	2740333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_020536	ATA	2	6	2740340	2740345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_020536	GTT	2	6	2740394	2740399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_020536	AAC	2	6	2740421	2740426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_020536	TTA	2	6	2740958	2740963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_020536	AAC	2	6	2740970	2740975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_020536	T	6	6	2740987	2740992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_020536	T	6	6	2741011	2741016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_020536	TAA	2	6	2741022	2741027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_020536	TTC	2	6	2741044	2741049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_020536	AAT	2	6	2741064	2741069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_020536	TTAAT	2	10	2741086	2741095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_020536	ATT	2	6	2741106	2741111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_020536	AGAA	2	8	2741167	2741174	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_020536	A	7	7	2742844	2742850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_020536	ATTT	2	8	2742895	2742902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_020536	CA	3	6	2742945	2742950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16063	NC_020536	CCT	2	6	2743935	2743940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16064	NC_020536	TAA	2	6	2744001	2744006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_020536	ACCA	2	8	2744053	2744060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16066	NC_020536	AAT	2	6	2744082	2744087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_020536	ACA	2	6	2744127	2744132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16068	NC_020536	GGAT	2	8	2744137	2744144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_020536	AT	4	8	2744764	2744771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_020536	TAA	2	6	2744774	2744779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_020536	AAT	2	6	2744784	2744789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_020536	ATA	2	6	2744795	2744800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_020536	TTG	2	6	2745931	2745936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_020536	CTT	2	6	2745958	2745963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_020536	AGT	2	6	2745982	2745987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_020536	AGG	2	6	2746129	2746134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_020536	CTTA	2	8	2746967	2746974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16078	NC_020536	GTAG	2	8	2746977	2746984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_020536	T	6	6	2746991	2746996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_020536	ACA	2	6	2747010	2747015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_020536	CTT	2	6	2747048	2747053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16082	NC_020536	CAAT	2	8	2747588	2747595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16083	NC_020536	A	6	6	2747629	2747634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_020536	TAT	2	6	2747637	2747642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_020536	AAT	2	6	2747645	2747650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_020536	CAT	2	6	2747679	2747684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_020536	CTCA	2	8	2747736	2747743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16088	NC_020536	CTA	2	6	2747749	2747754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_020536	TTCA	2	8	2747783	2747790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16090	NC_020536	CTA	2	6	2747815	2747820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16091	NC_020536	ATT	2	6	2747829	2747834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_020536	GATTTT	2	12	2750525	2750536	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_020536	GA	3	6	2750575	2750580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_020536	ACA	2	6	2750699	2750704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_020536	TTA	2	6	2750729	2750734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_020536	TTA	2	6	2750743	2750748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_020536	CGT	2	6	2750756	2750761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_020536	GAA	2	6	2750762	2750767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_020536	CAA	2	6	2750835	2750840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_020536	GCT	2	6	2750853	2750858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_020536	T	6	6	2750861	2750866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_020536	T	6	6	2750943	2750948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_020536	ATTT	2	8	2751004	2751011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_020536	A	6	6	2751014	2751019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_020536	TAA	2	6	2751062	2751067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_020536	T	6	6	2751112	2751117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_020536	AGA	2	6	2751293	2751298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_020536	CAA	2	6	2751418	2751423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_020536	TTG	2	6	2751435	2751440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_020536	T	7	7	2751444	2751450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_020536	ATA	2	6	2751463	2751468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_020536	GAT	3	9	2751480	2751488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_020536	ACA	2	6	2752160	2752165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_020536	AGAC	2	8	2752188	2752195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16115	NC_020536	TTA	2	6	2752245	2752250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_020536	ATG	2	6	2752251	2752256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_020536	T	6	6	2752365	2752370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_020536	ATAC	2	8	2752397	2752404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16119	NC_020536	TGA	2	6	2752410	2752415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_020536	CAA	2	6	2752431	2752436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_020536	CAT	2	6	2752471	2752476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_020536	TAA	2	6	2752572	2752577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_020536	TAA	2	6	2752663	2752668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_020536	C	6	6	2752679	2752684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16125	NC_020536	A	6	6	2752687	2752692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_020536	ATG	2	6	2752712	2752717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_020536	TAA	2	6	2752742	2752747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_020536	CAA	2	6	2752824	2752829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_020536	AG	3	6	2752876	2752881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_020536	GAT	2	6	2752972	2752977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16131	NC_020536	ATA	2	6	2752992	2752997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16132	NC_020536	AAGA	2	8	2753003	2753010	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_020536	TAG	2	6	2753020	2753025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16134	NC_020536	CCT	2	6	2753034	2753039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16135	NC_020536	ACC	2	6	2753045	2753050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16136	NC_020536	AAT	2	6	2753063	2753068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_020536	ACC	2	6	2753090	2753095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16138	NC_020536	GAA	2	6	2753107	2753112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16139	NC_020536	TAAT	2	8	2753153	2753160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16140	NC_020536	CA	3	6	2753181	2753186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16141	NC_020536	ATTT	2	8	2753338	2753345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16142	NC_020536	CGT	2	6	2753346	2753351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16143	NC_020536	A	6	6	2753380	2753385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16144	NC_020536	ACT	2	6	2753416	2753421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16145	NC_020536	ATATAA	2	12	2753477	2753488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16146	NC_020536	A	7	7	2753511	2753517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16147	NC_020536	TCA	2	6	2753560	2753565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16149	NC_020536	CTT	2	6	2757097	2757102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16150	NC_020536	CCT	2	6	2758521	2758526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16152	NC_020536	TTCC	2	8	2758628	2758635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16153	NC_020536	CTTA	2	8	2758647	2758654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16154	NC_020536	TTA	2	6	2758661	2758666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16156	NC_020536	GCTG	2	8	2758733	2758740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16157	NC_020536	AAT	2	6	2758753	2758758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16159	NC_020536	T	6	6	2758846	2758851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16160	NC_020536	TAT	2	6	2758890	2758895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16162	NC_020536	T	6	6	2758939	2758944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16163	NC_020536	AT	3	6	2758945	2758950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16164	NC_020536	TTAT	2	8	2759009	2759016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16165	NC_020536	TATT	2	8	2759071	2759078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16166	NC_020536	A	8	8	2759092	2759099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16169	NC_020536	GC	3	6	2759158	2759163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16173	NC_020536	T	7	7	2759459	2759465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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