MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020536	TGT	2	6	2619360	2619365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15502	NC_020536	T	7	7	2621231	2621237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_020536	TAA	2	6	2621255	2621260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_020536	ACT	2	6	2622394	2622399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15505	NC_020536	TTTA	2	8	2622423	2622430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_020536	CTC	2	6	2622453	2622458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15507	NC_020536	ACT	2	6	2622463	2622468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_020536	ACT	2	6	2622472	2622477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15509	NC_020536	ATT	2	6	2622478	2622483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020536	TCC	2	6	2622999	2623004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15511	NC_020536	TAT	2	6	2623014	2623019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_020536	TAT	2	6	2623042	2623047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_020536	TCAAT	2	10	2623058	2623067	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15514	NC_020536	ACA	2	6	2623089	2623094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15515	NC_020536	GTTAA	2	10	2623112	2623121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_020536	AAAT	2	8	2623139	2623146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_020536	CAT	2	6	2623202	2623207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15518	NC_020536	ATA	2	6	2623231	2623236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_020536	ATAAAA	2	12	2623268	2623279	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_020536	CTA	2	6	2623307	2623312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15521	NC_020536	AAT	2	6	2623374	2623379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_020536	TTCA	2	8	2623389	2623396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15523	NC_020536	TCT	2	6	2623429	2623434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_020536	CAA	2	6	2623481	2623486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15525	NC_020536	TGC	2	6	2623494	2623499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_020536	CAAA	2	8	2623506	2623513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15527	NC_020536	ATT	4	12	2623566	2623577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_020536	AATC	2	8	2623631	2623638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15529	NC_020536	TAC	2	6	2623643	2623648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15530	NC_020536	TCA	2	6	2623700	2623705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15531	NC_020536	GTA	2	6	2624552	2624557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_020536	TAT	2	6	2625406	2625411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_020536	GAAAG	2	10	2625439	2625448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_020536	AAG	3	9	2625446	2625454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_020536	AT	3	6	2626320	2626325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_020536	ACC	2	6	2626357	2626362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15537	NC_020536	ACT	2	6	2627168	2627173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_020536	ATA	2	6	2627234	2627239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_020536	ATT	3	9	2627249	2627257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_020536	TGCT	2	8	2627284	2627291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15541	NC_020536	A	7	7	2627292	2627298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_020536	AT	3	6	2627353	2627358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_020536	TAAT	2	8	2627362	2627369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_020536	CCTAA	2	10	2628353	2628362	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15545	NC_020536	ATTT	2	8	2628367	2628374	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_020536	ATTTT	2	10	2628424	2628433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_020536	AATA	2	8	2628507	2628514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_020536	T	7	7	2628624	2628630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_020536	TA	3	6	2628670	2628675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_020536	CCT	2	6	2628677	2628682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15551	NC_020536	TCA	2	6	2628699	2628704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_020536	CAT	2	6	2628714	2628719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15553	NC_020536	A	6	6	2628870	2628875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15554	NC_020536	ATT	2	6	2628954	2628959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15555	NC_020536	A	6	6	2628981	2628986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_020536	GGA	2	6	2629016	2629021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_020536	A	7	7	2630483	2630489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_020536	T	6	6	2630528	2630533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_020536	GCAA	2	8	2631927	2631934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15560	NC_020536	CT	3	6	2631941	2631946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15561	NC_020536	TAA	2	6	2632021	2632026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_020536	AT	3	6	2632042	2632047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_020536	TGC	2	6	2632181	2632186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_020536	TCAT	2	8	2632197	2632204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15565	NC_020536	TGT	2	6	2632222	2632227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_020536	TAA	2	6	2632234	2632239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_020536	CAAT	2	8	2632241	2632248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15568	NC_020536	TAT	2	6	2632264	2632269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15569	NC_020536	AT	3	6	2632307	2632312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_020536	ATA	2	6	2632320	2632325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_020536	ATTT	2	8	2632350	2632357	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_020536	CTAT	2	8	2632397	2632404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15573	NC_020536	TTAT	2	8	2632425	2632432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_020536	TATT	2	8	2632453	2632460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_020536	ATT	2	6	2632509	2632514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_020536	AATAA	2	10	2632559	2632568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_020536	TTAA	2	8	2632574	2632581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_020536	ATT	2	6	2632589	2632594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_020536	T	6	6	2633599	2633604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_020536	ACT	2	6	2633612	2633617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15581	NC_020536	T	6	6	2633662	2633667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_020536	GTAT	2	8	2633687	2633694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_020536	A	7	7	2633705	2633711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15584	NC_020536	ATC	2	6	2635304	2635309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15585	NC_020536	TAGT	2	8	2635404	2635411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_020536	AGCA	2	8	2635431	2635438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15587	NC_020536	GTAAAT	2	12	2635442	2635453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_020536	ATT	2	6	2635458	2635463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_020536	AT	3	6	2635477	2635482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_020536	AGA	2	6	2635499	2635504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_020536	ATCAA	2	10	2635510	2635519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15592	NC_020536	ATT	2	6	2635525	2635530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_020536	ACA	2	6	2635533	2635538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15594	NC_020536	ATCA	2	8	2635621	2635628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15595	NC_020536	ATT	2	6	2635690	2635695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_020536	TTA	2	6	2635780	2635785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_020536	GAC	2	6	2635877	2635882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15598	NC_020536	CAT	2	6	2635889	2635894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15599	NC_020536	ATC	2	6	2635919	2635924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_020536	TGA	2	6	2637588	2637593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_020536	TA	4	8	2637617	2637624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_020536	ATTC	2	8	2638249	2638256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15603	NC_020536	TATT	2	8	2638260	2638267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15604	NC_020536	CTT	2	6	2638287	2638292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15605	NC_020536	ATT	2	6	2638385	2638390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_020536	TTTTA	2	10	2638442	2638451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_020536	TGA	2	6	2638547	2638552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_020536	GAAT	2	8	2638594	2638601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_020536	TCT	2	6	2638604	2638609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15610	NC_020536	ATC	2	6	2638645	2638650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15611	NC_020536	TA	3	6	2638663	2638668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_020536	TC	3	6	2638693	2638698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15613	NC_020536	TA	3	6	2638707	2638712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_020536	ATC	2	6	2638814	2638819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_020536	CA	3	6	2638857	2638862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15616	NC_020536	ACA	2	6	2638873	2638878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_020536	A	6	6	2638906	2638911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15618	NC_020536	CAATA	2	10	2638921	2638930	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15619	NC_020536	CTA	2	6	2638948	2638953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15620	NC_020536	TA	3	6	2638952	2638957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_020536	AAT	2	6	2640816	2640821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_020536	ATCA	2	8	2640852	2640859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15623	NC_020536	ACAAA	2	10	2640876	2640885	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15624	NC_020536	CAA	2	6	2642423	2642428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15625	NC_020536	TTTA	2	8	2642451	2642458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_020536	AAC	2	6	2642513	2642518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15627	NC_020536	TTTA	2	8	2642551	2642558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_020536	T	7	7	2642600	2642606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_020536	TATT	2	8	2642631	2642638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15630	NC_020536	ATG	2	6	2643259	2643264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15631	NC_020536	ATG	2	6	2643272	2643277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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