MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020536	TTTGAC	2	12	2538991	2539002	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15002	NC_020536	AT	3	6	2539023	2539028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_020536	ATC	2	6	2539037	2539042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_020536	ACA	2	6	2539089	2539094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_020536	TGC	2	6	2539102	2539107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_020536	TAT	2	6	2539159	2539164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_020536	TCT	2	6	2539218	2539223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15008	NC_020536	ATTC	2	8	2539256	2539263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15009	NC_020536	TTCG	2	8	2539287	2539294	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15010	NC_020536	ATC	2	6	2539301	2539306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_020536	ATTT	2	8	2539319	2539326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_020536	TA	3	6	2539343	2539348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_020536	TAA	2	6	2539404	2539409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_020536	GTC	2	6	2539434	2539439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_020536	AATAG	2	10	2539478	2539487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_020536	TGA	3	9	2539573	2539581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_020536	AAT	2	6	2539583	2539588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_020536	ATA	2	6	2539620	2539625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_020536	TGA	2	6	2539657	2539662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_020536	TGG	2	6	2539666	2539671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_020536	A	6	6	2539685	2539690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_020536	GTT	2	6	2539703	2539708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_020536	ATT	2	6	2539736	2539741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_020536	AGA	2	6	2539777	2539782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_020536	TAAA	2	8	2539808	2539815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_020536	T	6	6	2539844	2539849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_020536	TTTTC	2	10	2539918	2539927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15028	NC_020536	TTA	2	6	2540799	2540804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_020536	T	6	6	2540811	2540816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_020536	T	7	7	2540855	2540861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_020536	TA	3	6	2540881	2540886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_020536	AC	3	6	2541706	2541711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15033	NC_020536	AT	3	6	2541741	2541746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_020536	TTTAT	2	10	2542927	2542936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_020536	ATT	2	6	2542978	2542983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_020536	AT	3	6	2543000	2543005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_020536	TGA	2	6	2543013	2543018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_020536	TGA	2	6	2543074	2543079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_020536	AT	3	6	2544000	2544005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_020536	AT	3	6	2544077	2544082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_020536	A	6	6	2544142	2544147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_020536	TAA	2	6	2544175	2544180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_020536	A	6	6	2545586	2545591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_020536	TAT	2	6	2545618	2545623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_020536	CCA	2	6	2545639	2545644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15046	NC_020536	CGT	2	6	2545651	2545656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_020536	CAAA	2	8	2545673	2545680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15048	NC_020536	A	7	7	2545678	2545684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_020536	AT	3	6	2545716	2545721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_020536	ATTA	2	8	2546421	2546428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_020536	TAT	2	6	2546456	2546461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_020536	AT	3	6	2546473	2546478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_020536	TAA	2	6	2546531	2546536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_020536	ATT	2	6	2546550	2546555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_020536	ATA	2	6	2547063	2547068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_020536	TAACA	2	10	2547096	2547105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15057	NC_020536	T	6	6	2547155	2547160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_020536	TAG	2	6	2547222	2547227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_020536	ATA	2	6	2547268	2547273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15060	NC_020536	ATG	2	6	2547324	2547329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_020536	GAT	2	6	2547341	2547346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_020536	ATC	2	6	2547362	2547367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_020536	AAG	2	6	2547464	2547469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_020536	ATCT	2	8	2547471	2547478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15065	NC_020536	CAGA	2	8	2547492	2547499	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15066	NC_020536	CTT	2	6	2547502	2547507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_020536	T	6	6	2547506	2547511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_020536	CT	4	8	2550186	2550193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15069	NC_020536	TTTAT	2	10	2550197	2550206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_020536	ATCAA	2	10	2550263	2550272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15071	NC_020536	ACT	2	6	2550331	2550336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_020536	TGT	2	6	2550339	2550344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_020536	TG	3	6	2550390	2550395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_020536	T	6	6	2550400	2550405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_020536	T	6	6	2550412	2550417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_020536	TATT	2	8	2550480	2550487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_020536	TTTTGT	2	12	2550488	2550499	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_020536	TTA	2	6	2550539	2550544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_020536	AT	3	6	2550548	2550553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_020536	ATT	2	6	2550580	2550585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_020536	ATG	2	6	2550604	2550609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_020536	T	7	7	2550634	2550640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_020536	TCTA	2	8	2550757	2550764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15084	NC_020536	CTT	2	6	2550791	2550796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15085	NC_020536	ATT	2	6	2550805	2550810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_020536	TA	3	6	2550812	2550817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_020536	ATG	2	6	2550833	2550838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_020536	TCA	2	6	2550870	2550875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_020536	CATT	2	8	2550947	2550954	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15090	NC_020536	TATC	2	8	2550972	2550979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15091	NC_020536	GAT	2	6	2551000	2551005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_020536	T	7	7	2551005	2551011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_020536	AAC	2	6	2552084	2552089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_020536	T	6	6	2552117	2552122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_020536	GTC	2	6	2553097	2553102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_020536	CTC	2	6	2553104	2553109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15097	NC_020536	TGA	2	6	2553112	2553117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_020536	CTA	2	6	2553121	2553126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_020536	TTA	2	6	2553152	2553157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_020536	ATG	2	6	2553185	2553190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_020536	TCAT	2	8	2553258	2553265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15102	NC_020536	GAT	2	6	2553274	2553279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_020536	AC	3	6	2553473	2553478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15104	NC_020536	TGA	2	6	2553522	2553527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_020536	CTT	2	6	2553581	2553586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_020536	ATT	2	6	2553612	2553617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_020536	TTG	2	6	2553618	2553623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_020536	TCT	2	6	2553660	2553665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_020536	CTGT	2	8	2553690	2553697	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15110	NC_020536	CTTG	2	8	2553757	2553764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15111	NC_020536	TTGA	2	8	2553859	2553866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_020536	TTG	2	6	2553870	2553875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_020536	TAA	2	6	2553894	2553899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_020536	TTTC	2	8	2553987	2553994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15115	NC_020536	TGT	2	6	2554015	2554020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_020536	ATTT	2	8	2554069	2554076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_020536	TTA	2	6	2554077	2554082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_020536	TTA	2	6	2554114	2554119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_020536	TTA	2	6	2554235	2554240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_020536	TCA	2	6	2554241	2554246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_020536	AC	3	6	2554247	2554252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15122	NC_020536	CAT	2	6	2554261	2554266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_020536	TTCA	2	8	2554368	2554375	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15124	NC_020536	TAT	2	6	2556606	2556611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_020536	CAA	2	6	2556633	2556638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15126	NC_020536	ATC	2	6	2556654	2556659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15127	NC_020536	ATAA	2	8	2556681	2556688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_020536	TTG	2	6	2556709	2556714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_020536	TTCAA	2	10	2556739	2556748	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15130	NC_020536	ATGTTT	2	12	2559269	2559280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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15132	NC_020536	TAA	2	6	2559337	2559342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15265	NC_020536	ATA	2	6	2579913	2579918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15391	NC_020536	TAA	2	6	2606261	2606266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15393	NC_020536	ATGA	2	8	2606416	2606423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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