MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020536	T	6	6	2379995	2380000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020536	TCA	2	6	2380008	2380013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_020536	CAA	2	6	2380055	2380060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_020536	TG	3	6	2380079	2380084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020536	GAA	2	6	2380142	2380147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_020536	CAT	2	6	2380160	2380165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_020536	TA	3	6	2380192	2380197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_020536	AGA	2	6	2380201	2380206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_020536	AGT	2	6	2380219	2380224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_020536	TAA	2	6	2380256	2380261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_020536	AAACAT	2	12	2380268	2380279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14012	NC_020536	TG	4	8	2380296	2380303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_020536	TGT	2	6	2380319	2380324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_020536	CT	3	6	2380352	2380357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_020536	TAAA	2	8	2380372	2380379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_020536	A	6	6	2380393	2380398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_020536	ATA	2	6	2380408	2380413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_020536	TCC	2	6	2380430	2380435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_020536	TAT	2	6	2380465	2380470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_020536	A	6	6	2380480	2380485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_020536	AAATA	2	10	2380562	2380571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_020536	CGCT	2	8	2380584	2380591	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14023	NC_020536	TAT	2	6	2380610	2380615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_020536	TATT	2	8	2380619	2380626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_020536	ATTA	2	8	2381911	2381918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_020536	CCT	2	6	2381919	2381924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14027	NC_020536	TGT	2	6	2381953	2381958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_020536	TAT	2	6	2381960	2381965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_020536	TCA	2	6	2381999	2382004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_020536	AGG	2	6	2382051	2382056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_020536	ATTT	2	8	2382060	2382067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_020536	TA	3	6	2382729	2382734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_020536	CCT	2	6	2385217	2385222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14034	NC_020536	TAT	2	6	2385287	2385292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_020536	TA	3	6	2385298	2385303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_020536	CATT	2	8	2385329	2385336	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14037	NC_020536	CTATA	2	10	2385344	2385353	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14038	NC_020536	ATTA	2	8	2385369	2385376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_020536	TAG	2	6	2385802	2385807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_020536	ATCT	2	8	2385853	2385860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14041	NC_020536	ATG	2	6	2385902	2385907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_020536	AGA	2	6	2385910	2385915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_020536	ATT	2	6	2385964	2385969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_020536	TTG	2	6	2386016	2386021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_020536	TAA	2	6	2386038	2386043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_020536	TAA	2	6	2386078	2386083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_020536	GAT	2	6	2386086	2386091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_020536	TAAT	2	8	2386105	2386112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_020536	AT	3	6	2386115	2386120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_020536	TGA	2	6	2386150	2386155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_020536	TGA	2	6	2386218	2386223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_020536	ATG	2	6	2386232	2386237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_020536	TAATA	2	10	2386239	2386248	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_020536	TGT	2	6	2386298	2386303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_020536	GTT	2	6	2386328	2386333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_020536	TTC	2	6	2386393	2386398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_020536	GCT	2	6	2386399	2386404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_020536	ATG	2	6	2386451	2386456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_020536	TG	3	6	2386480	2386485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_020536	TTG	2	6	2386493	2386498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_020536	ATT	2	6	2386549	2386554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020536	T	6	6	2386658	2386663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_020536	TTG	3	9	2386698	2386706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_020536	AAT	2	6	2386712	2386717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_020536	CTA	2	6	2386743	2386748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_020536	AAG	2	6	2386763	2386768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_020536	TGA	2	6	2386798	2386803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_020536	AAT	2	6	2386826	2386831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_020536	T	6	6	2386866	2386871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_020536	T	7	7	2386901	2386907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_020536	AGTT	2	8	2386941	2386948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_020536	T	6	6	2386967	2386972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_020536	ATTA	2	8	2386997	2387004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_020536	TAATT	2	10	2387014	2387023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_020536	AT	4	8	2387236	2387243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_020536	GA	4	8	2387251	2387258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_020536	CAT	2	6	2387283	2387288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_020536	TAA	2	6	2387318	2387323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_020536	TAT	2	6	2387324	2387329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_020536	TAA	2	6	2387343	2387348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_020536	GAT	2	6	2389452	2389457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020536	TAT	2	6	2389524	2389529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_020536	ATA	2	6	2389539	2389544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_020536	TAG	2	6	2389555	2389560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_020536	AT	3	6	2389561	2389566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_020536	ATG	2	6	2389578	2389583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_020536	TA	3	6	2389593	2389598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_020536	CAG	2	6	2389647	2389652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_020536	AGT	2	6	2389720	2389725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_020536	AGA	2	6	2389789	2389794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_020536	TGA	2	6	2389839	2389844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_020536	TA	4	8	2389893	2389900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020536	AC	3	6	2390013	2390018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14094	NC_020536	GT	3	6	2390044	2390049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_020536	AATT	2	8	2390057	2390064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_020536	TGA	2	6	2390140	2390145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_020536	GAAAAA	2	12	2390151	2390162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_020536	CAT	2	6	2390193	2390198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_020536	TGTA	2	8	2390205	2390212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_020536	ATG	3	9	2390227	2390235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_020536	GAAA	2	8	2390243	2390250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_020536	ATAC	2	8	2390252	2390259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14103	NC_020536	ATA	2	6	2390276	2390281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_020536	CTA	2	6	2390282	2390287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_020536	A	6	6	2390291	2390296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_020536	A	7	7	2390324	2390330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_020536	TTCAGA	2	12	2390343	2390354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14108	NC_020536	GTTAAA	2	12	2390356	2390367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_020536	A	6	6	2390365	2390370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_020536	GTTAAA	2	12	2390416	2390427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_020536	A	6	6	2390425	2390430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_020536	ATG	2	6	2390438	2390443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_020536	ATG	2	6	2390461	2390466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_020536	AGA	2	6	2390530	2390535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_020536	AGC	2	6	2390543	2390548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_020536	CTG	2	6	2390581	2390586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_020536	GCAT	2	8	2390638	2390645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14118	NC_020536	AAC	2	6	2390656	2390661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_020536	GCAT	2	8	2390699	2390706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14120	NC_020536	AAC	2	6	2390717	2390722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_020536	GCAT	2	8	2390760	2390767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_020536	AAC	2	6	2390778	2390783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14123	NC_020536	A	6	6	2392162	2392167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_020536	AAT	2	6	2392233	2392238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_020536	TTGA	2	8	2392303	2392310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_020536	CAA	2	6	2392365	2392370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_020536	TTA	2	6	2392379	2392384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_020536	AGA	2	6	2392446	2392451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14130	NC_020536	T	6	6	2392476	2392481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14262	NC_020536	ATT	2	6	2416289	2416294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14263	NC_020536	CAT	2	6	2416322	2416327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14264	NC_020536	TAC	2	6	2416355	2416360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14265	NC_020536	ATC	2	6	2416367	2416372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14266	NC_020536	ATC	2	6	2416400	2416405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14282	NC_020536	ATA	2	6	2417467	2417472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14285	NC_020536	GTT	2	6	2417601	2417606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14291	NC_020536	TAAT	2	8	2417763	2417770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14292	NC_020536	ACT	2	6	2417802	2417807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14294	NC_020536	ATAAA	2	10	2417906	2417915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14295	NC_020536	A	7	7	2417913	2417919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14388	NC_020536	TGT	2	6	2433612	2433617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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