MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020536	TAAA	2	8	2237543	2237550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_020536	TAAA	2	8	2237552	2237559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_020536	AGT	2	6	2237614	2237619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_020536	CTT	2	6	2237675	2237680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_020536	TGA	2	6	2237698	2237703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_020536	ACA	2	6	2237779	2237784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_020536	TAG	2	6	2237869	2237874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_020536	TAT	2	6	2237878	2237883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_020536	GAT	2	6	2237908	2237913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_020536	ATA	2	6	2237917	2237922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_020536	AAT	2	6	2237929	2237934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_020536	CTT	2	6	2237950	2237955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_020536	ATT	2	6	2237976	2237981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_020536	TTC	2	6	2237991	2237996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_020536	ATC	2	6	2237998	2238003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_020536	TAA	2	6	2238089	2238094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_020536	TTG	2	6	2238131	2238136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_020536	ATT	2	6	2238203	2238208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_020536	A	7	7	2238253	2238259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_020536	GATA	2	8	2238277	2238284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_020536	TAAA	2	8	2238300	2238307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_020536	AGA	2	6	2238322	2238327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020536	GAA	2	6	2238344	2238349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_020536	CATAC	2	10	2238396	2238405	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13025	NC_020536	TAG	2	6	2238407	2238412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020536	TAT	2	6	2238530	2238535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_020536	CAA	2	6	2238548	2238553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_020536	AAG	2	6	2238558	2238563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020536	GAC	2	6	2238594	2238599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_020536	ATC	2	6	2238627	2238632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_020536	AGG	2	6	2238677	2238682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020536	A	6	6	2239658	2239663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020536	AAT	2	6	2239740	2239745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_020536	AC	3	6	2239752	2239757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_020536	A	7	7	2239764	2239770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_020536	ATA	2	6	2239780	2239785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_020536	TA	3	6	2239799	2239804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_020536	ACG	2	6	2239840	2239845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_020536	GCT	2	6	2239847	2239852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_020536	T	6	6	2239864	2239869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_020536	AGTA	2	8	2239894	2239901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_020536	TAA	2	6	2239945	2239950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_020536	AGCTTG	2	12	2239975	2239986	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13044	NC_020536	ACC	3	9	2239996	2240004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_020536	CAT	2	6	2240022	2240027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_020536	TGGT	2	8	2240056	2240063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_020536	TTA	2	6	2240114	2240119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_020536	ACG	2	6	2240173	2240178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_020536	TCC	2	6	2240216	2240221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13050	NC_020536	GTT	2	6	2240254	2240259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_020536	CCA	2	6	2240283	2240288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_020536	T	6	6	2240300	2240305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_020536	TTC	2	6	2240380	2240385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_020536	CAG	2	6	2240395	2240400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_020536	TGAT	2	8	2240401	2240408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_020536	ACC	2	6	2240414	2240419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_020536	GAT	2	6	2240422	2240427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_020536	GTA	2	6	2240438	2240443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_020536	TAA	2	6	2240491	2240496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_020536	GTGTG	2	10	2240522	2240531	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_020536	AGAT	2	8	2240557	2240564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_020536	TGA	2	6	2240573	2240578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_020536	ATA	2	6	2240664	2240669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_020536	TCC	2	6	2240674	2240679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_020536	A	6	6	2240681	2240686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_020536	GAT	2	6	2240730	2240735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_020536	ATTT	2	8	2240769	2240776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_020536	TGT	2	6	2240784	2240789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_020536	TA	3	6	2240801	2240806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_020536	TAA	2	6	2240865	2240870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_020536	CAT	2	6	2243294	2243299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_020536	TC	4	8	2244179	2244186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13073	NC_020536	TATC	2	8	2244201	2244208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13074	NC_020536	TA	3	6	2244259	2244264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_020536	GTT	2	6	2244303	2244308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_020536	AAC	2	6	2244310	2244315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_020536	CT	3	6	2244337	2244342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_020536	TAA	2	6	2244362	2244367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_020536	GGT	2	6	2244391	2244396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_020536	ATA	2	6	2244413	2244418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_020536	TTCA	2	8	2244426	2244433	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13082	NC_020536	A	6	6	2244486	2244491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_020536	A	6	6	2244554	2244559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_020536	GC	3	6	2244560	2244565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_020536	CAT	2	6	2244570	2244575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_020536	TTG	2	6	2244580	2244585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_020536	TTTA	2	8	2244603	2244610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_020536	TA	3	6	2244679	2244684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_020536	AGT	2	6	2244687	2244692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_020536	TA	3	6	2244702	2244707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_020536	CGA	2	6	2244753	2244758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_020536	ACC	2	6	2244785	2244790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_020536	AAT	2	6	2244825	2244830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_020536	ACG	2	6	2244902	2244907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_020536	T	6	6	2244923	2244928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_020536	CAA	2	6	2244949	2244954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_020536	CTT	2	6	2244964	2244969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_020536	TAA	3	9	2245003	2245011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_020536	CCT	2	6	2245089	2245094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_020536	TCC	2	6	2246050	2246055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_020536	TA	3	6	2246057	2246062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_020536	CAT	2	6	2246108	2246113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_020536	ACG	3	9	2246123	2246131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_020536	TGG	2	6	2246135	2246140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_020536	TGC	2	6	2246318	2246323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_020536	T	6	6	2246336	2246341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_020536	TGA	2	6	2246369	2246374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_020536	TCA	2	6	2246397	2246402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_020536	GTT	2	6	2246420	2246425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_020536	TG	3	6	2246440	2246445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_020536	CCT	2	6	2246517	2246522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_020536	TAT	2	6	2246528	2246533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_020536	T	6	6	2246533	2246538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_020536	CG	3	6	2246576	2246581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13115	NC_020536	T	6	6	2246592	2246597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020536	ACG	2	6	2246617	2246622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_020536	ATG	2	6	2246640	2246645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_020536	AGTT	2	8	2246673	2246680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_020536	ACG	2	6	2246683	2246688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_020536	TCA	2	6	2246744	2246749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_020536	CTT	2	6	2246787	2246792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_020536	T	6	6	2246799	2246804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_020536	TA	4	8	2246828	2246835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_020536	CT	3	6	2246908	2246913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_020536	TTA	2	6	2246915	2246920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_020536	TTTG	2	8	2246929	2246936	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_020536	CTTTAC	2	12	2246965	2246976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_020536	TAT	2	6	2247047	2247052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_020536	ATT	2	6	2247062	2247067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_020536	TTC	2	6	2247083	2247088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_020536	ATTC	2	8	2247153	2247160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13132	NC_020536	AATT	2	8	2247388	2247395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_020536	ATCT	2	8	2247415	2247422	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13134	NC_020536	CCT	2	6	2248128	2248133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13138	NC_020536	TTA	2	6	2249620	2249625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13139	NC_020536	ACG	2	6	2249691	2249696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13142	NC_020536	ACC	2	6	2249736	2249741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13143	NC_020536	ATTTC	2	10	2249864	2249873	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13144	NC_020536	CCT	2	6	2249878	2249883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13145	NC_020536	ATT	2	6	2249886	2249891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13146	NC_020536	TCT	2	6	2249894	2249899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13160	NC_020536	CTTT	2	8	2250974	2250981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13161	NC_020536	CCT	2	6	2251540	2251545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13162	NC_020536	T	6	6	2251548	2251553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13163	NC_020536	CCA	2	6	2251580	2251585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13171	NC_020536	AGCT	2	8	2251990	2251997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13172	NC_020536	AATTTA	2	12	2252055	2252066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13173	NC_020536	T	8	8	2252132	2252139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13174	NC_020536	CCT	2	6	2252179	2252184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13181	NC_020536	T	6	6	2252807	2252812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13241	NC_020536	CGA	2	6	2255739	2255744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13250	NC_020536	T	6	6	2256792	2256797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13251	NC_020536	TTC	2	6	2256849	2256854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13253	NC_020536	TCC	2	6	2257612	2257617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13256	NC_020536	TAT	2	6	2258318	2258323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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