MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020536	TTAA	2	8	2158950	2158957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020536	ATT	2	6	2158966	2158971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020536	TTA	2	6	2158974	2158979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020536	TAACA	2	10	2159823	2159832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12505	NC_020536	TAAA	3	12	2159853	2159864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_020536	A	6	6	2159923	2159928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_020536	TTTAAT	2	12	2159969	2159980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020536	TGAT	2	8	2159984	2159991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020536	A	6	6	2159995	2160000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020536	ATA	2	6	2161892	2161897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020536	TAT	2	6	2161913	2161918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020536	T	6	6	2161998	2162003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020536	TTA	2	6	2162024	2162029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020536	TAA	2	6	2162063	2162068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020536	CCG	2	6	2162100	2162105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12516	NC_020536	TCC	2	6	2162122	2162127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_020536	AT	3	6	2162142	2162147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_020536	AT	3	6	2162169	2162174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_020536	CAAATA	2	12	2162189	2162200	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12520	NC_020536	ATT	2	6	2162257	2162262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_020536	GTT	2	6	2162273	2162278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020536	T	7	7	2162327	2162333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_020536	TGA	2	6	2162368	2162373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_020536	TTTA	2	8	2162377	2162384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_020536	ATTT	2	8	2162395	2162402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_020536	TA	4	8	2162455	2162462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_020536	AT	3	6	2162468	2162473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_020536	A	6	6	2162475	2162480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_020536	TAAA	2	8	2164035	2164042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_020536	ATT	2	6	2166217	2166222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_020536	TAAATG	2	12	2166243	2166254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_020536	GTG	2	6	2166306	2166311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_020536	ATT	2	6	2166442	2166447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_020536	AGT	2	6	2166481	2166486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020536	GAA	3	9	2166563	2166571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020536	ATCGT	2	10	2166579	2166588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12537	NC_020536	AGA	2	6	2166604	2166609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_020536	GAG	2	6	2166626	2166631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_020536	TTTG	2	8	2167760	2167767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_020536	AAG	2	6	2167772	2167777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_020536	TAA	2	6	2167805	2167810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020536	GTA	2	6	2167812	2167817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_020536	A	6	6	2167854	2167859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_020536	TATG	2	8	2167892	2167899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_020536	TAA	2	6	2167918	2167923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_020536	TCC	2	6	2175521	2175526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12547	NC_020536	ATT	2	6	2175533	2175538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_020536	AGT	2	6	2175579	2175584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_020536	AATTAA	2	12	2175620	2175631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_020536	ATC	2	6	2175636	2175641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_020536	TA	3	6	2175644	2175649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_020536	ATT	2	6	2175730	2175735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_020536	A	7	7	2175747	2175753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_020536	TCC	2	6	2178923	2178928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_020536	ATA	2	6	2178944	2178949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_020536	AT	3	6	2178988	2178993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_020536	A	6	6	2179002	2179007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_020536	ACT	2	6	2179026	2179031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_020536	A	7	7	2179052	2179058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_020536	AAT	2	6	2180045	2180050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_020536	TTA	2	6	2180101	2180106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_020536	A	8	8	2180113	2180120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_020536	AGT	2	6	2180146	2180151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_020536	AT	3	6	2180302	2180307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_020536	TGG	2	6	2180311	2180316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_020536	G	6	6	2180318	2180323	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_020536	CCG	2	6	2180364	2180369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12568	NC_020536	TAA	2	6	2180412	2180417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_020536	TGG	2	6	2180424	2180429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_020536	CCG	2	6	2180447	2180452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12571	NC_020536	AAT	2	6	2180502	2180507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_020536	CCG	2	6	2180536	2180541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12573	NC_020536	CCT	2	6	2180758	2180763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12574	NC_020536	AGTA	2	8	2180814	2180821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_020536	ATTT	2	8	2180845	2180852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_020536	TCGA	2	8	2180864	2180871	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12577	NC_020536	TCA	2	6	2180926	2180931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12578	NC_020536	G	6	6	2180976	2180981	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_020536	CA	3	6	2181017	2181022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12580	NC_020536	CTC	2	6	2181103	2181108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12581	NC_020536	ACG	2	6	2181126	2181131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_020536	ACG	2	6	2181152	2181157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12583	NC_020536	ACC	2	6	2181347	2181352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12584	NC_020536	ATGA	2	8	2181429	2181436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_020536	AGG	2	6	2181483	2181488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_020536	CAC	2	6	2181528	2181533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12587	NC_020536	GTG	2	6	2181539	2181544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12588	NC_020536	GTA	2	6	2181571	2181576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_020536	CCA	2	6	2181579	2181584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12590	NC_020536	CCTA	2	8	2181623	2181630	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12591	NC_020536	TC	3	6	2181743	2181748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12592	NC_020536	GCC	2	6	2181840	2181845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12593	NC_020536	CTC	2	6	2181888	2181893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12594	NC_020536	TCGC	2	8	2182077	2182084	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12595	NC_020536	TCTA	2	8	2182143	2182150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12596	NC_020536	TCT	2	6	2182197	2182202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_020536	CAATC	2	10	2182270	2182279	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12598	NC_020536	C	6	6	2182305	2182310	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12599	NC_020536	GGT	2	6	2182330	2182335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_020536	ATG	2	6	2182650	2182655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_020536	GCT	2	6	2182656	2182661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_020536	AT	3	6	2182715	2182720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_020536	TGG	2	6	2182735	2182740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_020536	AATT	2	8	2182800	2182807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_020536	AAT	2	6	2182876	2182881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_020536	GA	3	6	2182914	2182919	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_020536	TCGGT	2	10	2182991	2183000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12608	NC_020536	ACT	2	6	2183196	2183201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_020536	AG	3	6	2183291	2183296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_020536	TCC	2	6	2183317	2183322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12611	NC_020536	CGT	2	6	2183350	2183355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_020536	AG	3	6	2183372	2183377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_020536	ACA	2	6	2183378	2183383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12614	NC_020536	ATT	2	6	2183398	2183403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_020536	CTT	2	6	2183406	2183411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12616	NC_020536	GAT	2	6	2183427	2183432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_020536	GTC	2	6	2183442	2183447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_020536	CAA	2	6	2183481	2183486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_020536	TTG	2	6	2183493	2183498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_020536	TCGC	2	8	2183517	2183524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12621	NC_020536	CTA	2	6	2183527	2183532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_020536	TCC	2	6	2183556	2183561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12623	NC_020536	CTTA	2	8	2183679	2183686	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12624	NC_020536	TCG	2	6	2183704	2183709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_020536	TAA	2	6	2183762	2183767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_020536	CCA	2	6	2183782	2183787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12627	NC_020536	TTA	2	6	2183847	2183852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_020536	ATT	2	6	2183883	2183888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12630	NC_020536	A	6	6	2184023	2184028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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