MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_020536	ATC	2	6	2092187	2092192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12002	NC_020536	CGA	2	6	2092201	2092206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12003	NC_020536	GT	3	6	2092218	2092223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_020536	ATT	2	6	2092242	2092247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_020536	ACTT	2	8	2092258	2092265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12006	NC_020536	TAA	2	6	2092287	2092292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_020536	T	7	7	2092311	2092317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_020536	ATG	2	6	2092332	2092337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_020536	ATT	2	6	2092379	2092384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_020536	TAC	2	6	2092438	2092443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_020536	ATTT	2	8	2092463	2092470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_020536	TCA	2	6	2092530	2092535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_020536	TAT	2	6	2092601	2092606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_020536	TGA	2	6	2092620	2092625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12015	NC_020536	ACTT	2	8	2092661	2092668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12016	NC_020536	TTC	2	6	2092670	2092675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_020536	ATC	2	6	2092713	2092718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_020536	TAA	2	6	2092759	2092764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_020536	ATA	2	6	2092808	2092813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_020536	TGT	2	6	2092826	2092831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_020536	TAA	2	6	2092834	2092839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_020536	CAT	2	6	2092893	2092898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_020536	TCT	2	6	2092910	2092915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_020536	ATG	2	6	2092996	2093001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_020536	TACTA	2	10	2093050	2093059	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12026	NC_020536	GT	3	6	2093089	2093094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_020536	GTA	2	6	2095359	2095364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_020536	TGA	2	6	2095365	2095370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12029	NC_020536	GTT	2	6	2095387	2095392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_020536	TGT	3	9	2095428	2095436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_020536	GTCAT	2	10	2095448	2095457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12032	NC_020536	ATG	2	6	2095503	2095508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12034	NC_020536	ATG	2	6	2095703	2095708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_020536	TAT	2	6	2095728	2095733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_020536	ATGCC	2	10	2095751	2095760	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12037	NC_020536	TGT	2	6	2095778	2095783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_020536	TAT	2	6	2095801	2095806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_020536	TGA	2	6	2095886	2095891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_020536	GAA	2	6	2095919	2095924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12041	NC_020536	TTA	2	6	2095936	2095941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_020536	ATT	2	6	2095973	2095978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_020536	CAG	2	6	2095990	2095995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12044	NC_020536	ATC	2	6	2096018	2096023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12045	NC_020536	CTG	2	6	2096027	2096032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12046	NC_020536	GC	3	6	2096095	2096100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12047	NC_020536	ATT	2	6	2096140	2096145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_020536	TAA	2	6	2098460	2098465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_020536	CAC	2	6	2099312	2099317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_020536	A	6	6	2100052	2100057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_020536	TCC	2	6	2100058	2100063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12052	NC_020536	TAAA	2	8	2100065	2100072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_020536	A	7	7	2100070	2100076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_020536	AGT	2	6	2100093	2100098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_020536	ACT	2	6	2100139	2100144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12056	NC_020536	TAG	2	6	2100220	2100225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_020536	ATT	2	6	2100279	2100284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_020536	TAT	3	9	2100297	2100305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_020536	ATA	2	6	2100312	2100317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12060	NC_020536	A	6	6	2100346	2100351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_020536	AT	3	6	2100378	2100383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12062	NC_020536	TA	3	6	2100402	2100407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12063	NC_020536	TCC	2	6	2101141	2101146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12064	NC_020536	ACT	2	6	2101182	2101187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12066	NC_020536	A	7	7	2101225	2101231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12067	NC_020536	T	6	6	2101240	2101245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12068	NC_020536	T	6	6	2101320	2101325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_020536	T	6	6	2101334	2101339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12072	NC_020536	A	6	6	2101466	2101471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12073	NC_020536	GGAT	2	8	2101476	2101483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12074	NC_020536	TAA	2	6	2101528	2101533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12076	NC_020536	ATT	2	6	2101591	2101596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12078	NC_020536	ACCA	2	8	2101702	2101709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12082	NC_020536	CCT	2	6	2101930	2101935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12083	NC_020536	TA	3	6	2101985	2101990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12084	NC_020536	A	6	6	2102552	2102557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12085	NC_020536	T	8	8	2102596	2102603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12086	NC_020536	TTTTA	2	10	2102605	2102614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12087	NC_020536	CAAG	2	8	2102647	2102654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12091	NC_020536	CA	3	6	2102940	2102945	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12092	NC_020536	CTT	2	6	2102954	2102959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12093	NC_020536	ACT	2	6	2102968	2102973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12095	NC_020536	CTGT	2	8	2102994	2103001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12096	NC_020536	TCC	2	6	2103056	2103061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12097	NC_020536	TCC	2	6	2104353	2104358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12098	NC_020536	ATT	2	6	2104398	2104403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_020536	ATT	2	6	2104411	2104416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_020536	TTATT	2	10	2104457	2104466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_020536	TAA	2	6	2104529	2104534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_020536	CAA	2	6	2104540	2104545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12103	NC_020536	AC	3	6	2104553	2104558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12104	NC_020536	T	6	6	2104580	2104585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_020536	A	6	6	2104586	2104591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_020536	ATCTA	2	10	2104595	2104604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12107	NC_020536	ATTG	2	8	2104605	2104612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_020536	AATACA	2	12	2104628	2104639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12109	NC_020536	ACA	2	6	2104641	2104646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_020536	AAT	2	6	2104739	2104744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12111	NC_020536	TA	3	6	2104792	2104797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_020536	A	6	6	2104842	2104847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_020536	A	6	6	2104861	2104866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_020536	GTG	2	6	2104887	2104892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12115	NC_020536	A	6	6	2104930	2104935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_020536	AGT	2	6	2104999	2105004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_020536	CAT	2	6	2105130	2105135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12118	NC_020536	TTCC	2	8	2105160	2105167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12119	NC_020536	C	6	6	2105166	2105171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12120	NC_020536	A	6	6	2105206	2105211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12121	NC_020536	TTTA	2	8	2105244	2105251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12122	NC_020536	CT	4	8	2105287	2105294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12123	NC_020536	GTC	2	6	2105327	2105332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_020536	CAA	2	6	2105449	2105454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12125	NC_020536	AT	3	6	2105472	2105477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12126	NC_020536	AGC	2	6	2105522	2105527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12127	NC_020536	TGT	2	6	2105570	2105575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12128	NC_020536	AAC	2	6	2105582	2105587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12129	NC_020536	TCC	2	6	2105664	2105669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12130	NC_020536	TCC	2	6	2107096	2107101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12131	NC_020536	CAC	2	6	2107982	2107987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12132	NC_020536	CTC	2	6	2109524	2109529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12133	NC_020536	AAT	2	6	2110623	2110628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_020536	TA	3	6	2110638	2110643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12135	NC_020536	A	7	7	2110645	2110651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12136	NC_020536	CGA	2	6	2110652	2110657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12138	NC_020536	TA	3	6	2110736	2110741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12139	NC_020536	CAT	2	6	2110744	2110749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12140	NC_020536	TAC	2	6	2110822	2110827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12142	NC_020536	TGC	3	9	2110987	2110995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12143	NC_020536	TAATT	2	10	2111007	2111016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12144	NC_020536	TCC	2	6	2111017	2111022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12145	NC_020536	TA	3	6	2111031	2111036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12146	NC_020536	ATT	2	6	2111037	2111042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12160	NC_020536	ATCA	2	8	2112177	2112184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12161	NC_020536	ATA	2	6	2112216	2112221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12162	NC_020536	TTG	2	6	2112253	2112258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12166	NC_020536	A	7	7	2115384	2115390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12174	NC_020536	TACA	2	8	2116080	2116087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12175	NC_020536	CTT	2	6	2116127	2116132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12202	NC_020536	ATT	2	6	2122122	2122127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12204	NC_020536	AGTA	2	8	2122136	2122143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12220	NC_020536	AACT	2	8	2124159	2124166	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12246	NC_020536	T	6	6	2127122	2127127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12247	NC_020536	ATA	2	6	2127190	2127195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12251	NC_020536	TTA	2	6	2127860	2127865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12255	NC_020536	AACAT	2	10	2129542	2129551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12256	NC_020536	AAGC	2	8	2129554	2129561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12257	NC_020536	GTT	2	6	2129570	2129575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12258	NC_020536	AAATT	2	10	2129594	2129603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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