MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020536	TGT	2	6	2016306	2016311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_020536	T	6	6	2016325	2016330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_020536	AAT	2	6	2016331	2016336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020536	CCT	2	6	2018347	2018352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_020536	GTT	2	6	2018381	2018386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_020536	ATT	2	6	2018396	2018401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_020536	AGTTTG	2	12	2018405	2018416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_020536	TGA	2	6	2018424	2018429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_020536	TTG	2	6	2018433	2018438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_020536	GTT	2	6	2018443	2018448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_020536	GTT	2	6	2018450	2018455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_020536	TTC	2	6	2018457	2018462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_020536	CTA	2	6	2018488	2018493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_020536	ACT	2	6	2018619	2018624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_020536	GC	3	6	2018716	2018721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_020536	CTA	2	6	2018752	2018757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_020536	CCT	2	6	2019406	2019411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_020536	TAA	2	6	2019559	2019564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_020536	CCT	2	6	2019619	2019624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11520	NC_020536	GATT	2	8	2019693	2019700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_020536	TCT	2	6	2019765	2019770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_020536	CTT	3	9	2019803	2019811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_020536	AAATC	2	10	2019825	2019834	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11524	NC_020536	ATTA	2	8	2019842	2019849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_020536	ACAT	2	8	2019857	2019864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11526	NC_020536	TCC	2	6	2019891	2019896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11527	NC_020536	CAA	2	6	2019957	2019962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_020536	T	7	7	2019970	2019976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_020536	GTA	2	6	2019999	2020004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020536	ATA	2	6	2020097	2020102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020536	CTA	2	6	2020106	2020111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_020536	TCC	2	6	2020143	2020148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11533	NC_020536	T	6	6	2020157	2020162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_020536	AAT	2	6	2020222	2020227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_020536	TTC	2	6	2020358	2020363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_020536	TGG	2	6	2020388	2020393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_020536	CTTTC	2	10	2020418	2020427	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11538	NC_020536	TGT	2	6	2020436	2020441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020536	CGA	2	6	2020478	2020483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_020536	TGT	2	6	2020530	2020535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020536	CTA	2	6	2020559	2020564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_020536	TGA	2	6	2020626	2020631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_020536	GTT	2	6	2020637	2020642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020536	TCC	2	6	2020666	2020671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_020536	A	6	6	2020674	2020679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020536	ACC	2	6	2020761	2020766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11547	NC_020536	ACT	2	6	2020804	2020809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_020536	TGA	2	6	2020874	2020879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020536	TTG	2	6	2020906	2020911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020536	T	6	6	2020915	2020920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_020536	CTCAT	2	10	2020930	2020939	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11552	NC_020536	T	7	7	2020943	2020949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_020536	TGT	2	6	2021008	2021013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020536	CTT	2	6	2021694	2021699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_020536	AAC	2	6	2021701	2021706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_020536	GTT	3	9	2021733	2021741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020536	ATTT	2	8	2021786	2021793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_020536	CTTT	2	8	2021794	2021801	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_020536	CCT	2	6	2021835	2021840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11560	NC_020536	TGTT	2	8	2021848	2021855	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_020536	TTA	2	6	2021870	2021875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_020536	TTG	2	6	2021884	2021889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_020536	CCA	2	6	2021895	2021900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_020536	GAA	2	6	2021909	2021914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020536	A	6	6	2021975	2021980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_020536	T	6	6	2021997	2022002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_020536	T	6	6	2022004	2022009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020536	ATTT	2	8	2022010	2022017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_020536	TTAA	2	8	2022043	2022050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_020536	AAACT	2	10	2022089	2022098	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11571	NC_020536	ACC	2	6	2022159	2022164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11572	NC_020536	TCAT	2	8	2022187	2022194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11573	NC_020536	A	6	6	2022318	2022323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_020536	TTAAA	2	10	2022363	2022372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020536	ATTT	2	8	2022393	2022400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_020536	TAGT	2	8	2022435	2022442	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_020536	AATTT	2	10	2024138	2024147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_020536	TAT	2	6	2024150	2024155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020536	TCT	2	6	2024174	2024179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11580	NC_020536	TTG	2	6	2024233	2024238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_020536	ACACG	2	10	2024241	2024250	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11582	NC_020536	CTT	2	6	2024256	2024261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_020536	CAT	2	6	2024286	2024291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_020536	GTT	2	6	2024378	2024383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_020536	TGTTCT	2	12	2024384	2024395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11586	NC_020536	T	6	6	2024395	2024400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_020536	AAT	2	6	2024404	2024409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020536	TCC	2	6	2024443	2024448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_020536	A	6	6	2024451	2024456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_020536	ACAT	2	8	2024491	2024498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11591	NC_020536	TAA	2	6	2024502	2024507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_020536	TTAA	2	8	2024541	2024548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020536	ATAAA	2	10	2024574	2024583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020536	GGA	2	6	2024600	2024605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020536	A	6	6	2025358	2025363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_020536	CA	3	6	2025369	2025374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11597	NC_020536	TAA	2	6	2026632	2026637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_020536	AATATT	2	12	2026679	2026690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020536	AAG	2	6	2026767	2026772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_020536	AAT	2	6	2026777	2026782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_020536	AT	3	6	2027414	2027419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_020536	GTA	2	6	2027468	2027473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_020536	GCT	2	6	2027491	2027496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_020536	ACT	2	6	2027651	2027656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_020536	T	6	6	2027708	2027713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_020536	TA	4	8	2027740	2027747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020536	ATA	2	6	2028569	2028574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_020536	GA	3	6	2028608	2028613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_020536	T	7	7	2028635	2028641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_020536	ATA	2	6	2028642	2028647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020536	ATGA	2	8	2028683	2028690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020536	TTAA	2	8	2028696	2028703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_020536	T	6	6	2028713	2028718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020536	AT	3	6	2028745	2028750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_020536	CTT	2	6	2028788	2028793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_020536	A	6	6	2028803	2028808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_020536	TTA	3	9	2028842	2028850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020536	T	6	6	2028870	2028875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_020536	TTA	2	6	2028895	2028900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_020536	A	7	7	2028907	2028913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020536	TTTA	2	8	2028915	2028922	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_020536	AAT	2	6	2028926	2028931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_020536	TGT	2	6	2028942	2028947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_020536	AAT	2	6	2028970	2028975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11626	NC_020536	TTA	2	6	2029069	2029074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_020536	TAA	2	6	2029088	2029093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_020536	TAAT	2	8	2029140	2029147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11630	NC_020536	TTG	2	6	2029212	2029217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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