MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020536	TCG	2	6	1836656	1836661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_020536	CTT	2	6	1836662	1836667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_020536	CT	3	6	1836716	1836721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_020536	TAG	2	6	1836743	1836748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020536	CTGA	2	8	1836750	1836757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10006	NC_020536	TTCATT	2	12	1836796	1836807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10007	NC_020536	TTA	2	6	1836818	1836823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_020536	CTT	2	6	1836879	1836884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_020536	AGA	2	6	1836909	1836914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020536	TA	3	6	1836922	1836927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_020536	T	6	6	1836931	1836936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_020536	TGT	2	6	1836938	1836943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_020536	TCT	2	6	1836966	1836971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_020536	T	6	6	1839042	1839047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_020536	TTG	2	6	1839060	1839065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_020536	GTT	2	6	1839071	1839076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_020536	TCC	2	6	1839098	1839103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_020536	TAT	2	6	1839143	1839148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_020536	TGG	3	9	1839187	1839195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_020536	TGT	2	6	1839245	1839250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_020536	ATG	2	6	1839287	1839292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_020536	GTT	2	6	1839300	1839305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_020536	CATA	2	8	1839310	1839317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_020536	CAA	2	6	1839330	1839335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_020536	AATC	2	8	1839349	1839356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_020536	AAT	2	6	1839381	1839386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_020536	AT	3	6	1839390	1839395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_020536	TAA	2	6	1839396	1839401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_020536	GTTA	2	8	1839404	1839411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020536	CTC	2	6	1840180	1840185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_020536	AGGTT	2	10	1840206	1840215	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020536	T	6	6	1840228	1840233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020536	AATA	2	8	1840245	1840252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020536	TTG	2	6	1840274	1840279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020536	TGT	2	6	1840284	1840289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020536	ATGG	2	8	1840317	1840324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_020536	T	7	7	1841093	1841099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_020536	ATT	2	6	1841131	1841136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_020536	A	6	6	1842761	1842766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_020536	GAAT	2	8	1842777	1842784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_020536	TGA	2	6	1842785	1842790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_020536	CCT	2	6	1843508	1843513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10043	NC_020536	ATTT	2	8	1843519	1843526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_020536	TA	3	6	1843558	1843563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_020536	TAAA	2	8	1843569	1843576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_020536	ATTA	2	8	1843580	1843587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_020536	ATTA	2	8	1843591	1843598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_020536	TTA	2	6	1843604	1843609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_020536	TTA	2	6	1843615	1843620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_020536	AAT	2	6	1843621	1843626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_020536	ATTT	2	8	1843644	1843651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_020536	ATT	2	6	1843700	1843705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_020536	ATTA	2	8	1843718	1843725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_020536	AT	3	6	1843771	1843776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_020536	TAT	2	6	1843819	1843824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_020536	ATT	2	6	1843842	1843847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_020536	TAT	2	6	1843863	1843868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_020536	TCAA	2	8	1843885	1843892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10059	NC_020536	ATGT	2	8	1843899	1843906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_020536	ATT	2	6	1843940	1843945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020536	GAT	2	6	1843949	1843954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_020536	T	7	7	1843967	1843973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020536	AGT	2	6	1844023	1844028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_020536	GTT	2	6	1844069	1844074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020536	ATA	2	6	1844078	1844083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_020536	T	6	6	1844117	1844122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020536	ATT	2	6	1844185	1844190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_020536	ATTA	2	8	1844208	1844215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020536	TCA	2	6	1844266	1844271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_020536	ACA	2	6	1844319	1844324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_020536	A	6	6	1844335	1844340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_020536	T	6	6	1844349	1844354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_020536	ATAG	2	8	1844360	1844367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_020536	A	7	7	1844404	1844410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_020536	A	7	7	1844441	1844447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_020536	TAA	2	6	1845077	1845082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10078	NC_020536	ATA	2	6	1845112	1845117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_020536	A	7	7	1845155	1845161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_020536	A	6	6	1845197	1845202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_020536	GCTT	2	8	1845224	1845231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10082	NC_020536	GAC	2	6	1845233	1845238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_020536	GTC	2	6	1845251	1845256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_020536	TA	3	6	1845270	1845275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_020536	ATTCAA	2	12	1845322	1845333	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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10087	NC_020536	TTAA	2	8	1845376	1845383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_020536	CTG	2	6	1845413	1845418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10091	NC_020536	TTA	2	6	1845542	1845547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_020536	ATA	3	9	1845584	1845592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020536	ACA	2	6	1845743	1845748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_020536	AT	3	6	1845774	1845779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020536	ATT	2	6	1845795	1845800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020536	AAT	2	6	1845801	1845806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10098	NC_020536	TAA	2	6	1845833	1845838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_020536	AAT	2	6	1845885	1845890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_020536	TAC	2	6	1845922	1845927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_020536	ATA	2	6	1845939	1845944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_020536	ATT	2	6	1846019	1846024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_020536	ACA	2	6	1846058	1846063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_020536	TAACA	2	10	1846095	1846104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10105	NC_020536	T	6	6	1846140	1846145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_020536	TAA	2	6	1846239	1846244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_020536	AT	3	6	1846271	1846276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_020536	AT	3	6	1846346	1846351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_020536	ATT	2	6	1846380	1846385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_020536	ATA	2	6	1846421	1846426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_020536	TA	3	6	1847267	1847272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_020536	ATA	2	6	1847284	1847289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_020536	TACCAA	2	12	1847333	1847344	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_020536	T	7	7	1847426	1847432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_020536	AAT	2	6	1847433	1847438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_020536	T	6	6	1847438	1847443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_020536	AAT	2	6	1847462	1847467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_020536	CTAA	2	8	1847521	1847528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_020536	TG	3	6	1847538	1847543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_020536	TAAA	2	8	1847544	1847551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_020536	AAT	2	6	1847588	1847593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020536	ATT	2	6	1847606	1847611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_020536	CTTT	2	8	1849556	1849563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10124	NC_020536	TA	3	6	1849565	1849570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_020536	TAT	2	6	1849588	1849593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_020536	ATT	2	6	1849596	1849601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_020536	TTAT	2	8	1849606	1849613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_020536	A	7	7	1849631	1849637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_020536	ATG	2	6	1849681	1849686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_020536	TAT	2	6	1849833	1849838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10260	NC_020536	A	7	7	1860335	1860341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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