MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020536	AAAT	2	8	1236849	1236856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_020536	AGA	2	6	1236958	1236963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_020536	TGA	2	6	1237480	1237485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_020536	GGA	2	6	1237486	1237491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_020536	A	6	6	1237491	1237496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_020536	GAAAAA	2	12	1238696	1238707	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_020536	A	7	7	1238703	1238709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_020536	AAATG	2	10	1238735	1238744	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_020536	A	6	6	1238751	1238756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_020536	ATT	2	6	1238940	1238945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_020536	AGAGA	2	10	1238958	1238967	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_020536	GTAAA	2	10	1239024	1239033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_020536	A	6	6	1239065	1239070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_020536	TTG	2	6	1239090	1239095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_020536	ATG	2	6	1239099	1239104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_020536	ATA	2	6	1239111	1239116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_020536	ATTA	2	8	1239124	1239131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_020536	T	6	6	1241524	1241529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_020536	TGG	2	6	1241591	1241596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_020536	TAT	2	6	1241634	1241639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_020536	TTA	2	6	1241703	1241708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_020536	AAT	2	6	1241727	1241732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_020536	A	6	6	1241753	1241758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_020536	TAAAGA	2	12	1241778	1241789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_020536	GAA	2	6	1241838	1241843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_020536	ATC	2	6	1241857	1241862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_020536	ATTACA	2	12	1241896	1241907	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7028	NC_020536	TGT	2	6	1241910	1241915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_020536	AAG	2	6	1241972	1241977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_020536	TAT	2	6	1242054	1242059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_020536	ATCA	2	8	1242083	1242090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7032	NC_020536	TAA	2	6	1242102	1242107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_020536	ACAA	2	8	1242134	1242141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7034	NC_020536	GATA	2	8	1242142	1242149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_020536	T	7	7	1242255	1242261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_020536	AT	3	6	1242292	1242297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_020536	A	6	6	1242301	1242306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_020536	TA	3	6	1244236	1244241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_020536	TAG	2	6	1244267	1244272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_020536	AGG	2	6	1244322	1244327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_020536	TACT	2	8	1244428	1244435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_020536	AC	3	6	1244469	1244474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7043	NC_020536	A	6	6	1244475	1244480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020536	ACC	2	6	1244482	1244487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_020536	CGT	2	6	1244493	1244498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_020536	ATT	2	6	1244501	1244506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_020536	GTC	2	6	1244518	1244523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_020536	ACT	2	6	1244539	1244544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_020536	GTA	2	6	1244548	1244553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_020536	AATT	2	8	1244575	1244582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_020536	CGT	2	6	1244598	1244603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_020536	A	6	6	1244665	1244670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_020536	TAT	2	6	1244693	1244698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_020536	AAT	2	6	1244720	1244725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_020536	GAT	2	6	1244745	1244750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_020536	TAA	2	6	1244767	1244772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_020536	T	6	6	1244797	1244802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_020536	A	6	6	1244803	1244808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_020536	ATA	2	6	1244860	1244865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_020536	CT	3	6	1244879	1244884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_020536	T	7	7	1244884	1244890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_020536	ATA	2	6	1244926	1244931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_020536	ATGAT	2	10	1244933	1244942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_020536	AG	3	6	1244959	1244964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_020536	GAC	2	6	1247087	1247092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_020536	T	7	7	1247110	1247116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_020536	T	6	6	1247123	1247128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_020536	TGT	2	6	1247151	1247156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_020536	TAT	2	6	1247178	1247183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_020536	TGTA	2	8	1247208	1247215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_020536	T	6	6	1247242	1247247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_020536	ATG	2	6	1249061	1249066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_020536	GAT	2	6	1249120	1249125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_020536	TA	4	8	1249187	1249194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_020536	CGT	2	6	1249199	1249204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7078	NC_020536	TA	3	6	1252345	1252350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_020536	TGAT	2	8	1255642	1255649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_020536	AGG	2	6	1256545	1256550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_020536	CGGT	2	8	1256565	1256572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7082	NC_020536	AAT	2	6	1256669	1256674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_020536	TTA	2	6	1256715	1256720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_020536	GTA	2	6	1256735	1256740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_020536	AATT	2	8	1256757	1256764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_020536	TCA	2	6	1256770	1256775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7088	NC_020536	ATT	2	6	1256878	1256883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_020536	TAA	2	6	1256907	1256912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_020536	AAAT	2	8	1256954	1256961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_020536	TTTCAT	2	12	1257581	1257592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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7093	NC_020536	AT	3	6	1257652	1257657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_020536	T	6	6	1257678	1257683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_020536	TGT	2	6	1257693	1257698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_020536	A	6	6	1257753	1257758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_020536	TAT	2	6	1258941	1258946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_020536	TATTT	2	10	1259028	1259037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_020536	GATAA	2	10	1259057	1259066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_020536	AGG	2	6	1259089	1259094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_020536	GATT	2	8	1260192	1260199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_020536	AAT	2	6	1260228	1260233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_020536	T	6	6	1260275	1260280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_020536	TATT	2	8	1260285	1260292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_020536	TAG	2	6	1260340	1260345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_020536	AATT	2	8	1260413	1260420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_020536	TA	4	8	1260430	1260437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_020536	AGG	2	6	1260486	1260491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_020536	T	6	6	1262091	1262096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_020536	TAA	2	6	1262136	1262141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_020536	AAG	2	6	1262191	1262196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_020536	TAA	2	6	1262207	1262212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_020536	TATATT	2	12	1262237	1262248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_020536	A	6	6	1262286	1262291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_020536	GAAGA	2	10	1262292	1262301	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_020536	TCT	2	6	1262311	1262316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_020536	ATTA	2	8	1262327	1262334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_020536	ATTT	2	8	1262337	1262344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_020536	TTG	2	6	1262417	1262422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_020536	TTG	2	6	1262426	1262431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_020536	TC	3	6	1262436	1262441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7122	NC_020536	CTTT	2	8	1262476	1262483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7123	NC_020536	TATT	2	8	1262572	1262579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_020536	TATT	2	8	1262589	1262596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_020536	TC	3	6	1262643	1262648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_020536	GAA	2	6	1262656	1262661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_020536	AAT	2	6	1262663	1262668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_020536	GTAA	2	8	1263548	1263555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_020536	GGT	2	6	1263625	1263630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_020536	T	6	6	1266365	1266370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_020536	A	6	6	1266379	1266384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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