MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020533	TGT	3	9	340542	340550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020533	ATT	2	6	340585	340590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020533	TAT	2	6	340636	340641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020533	TTA	2	6	340649	340654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020533	A	6	6	340672	340677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020533	AT	3	6	340680	340685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020533	GTT	2	6	340708	340713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020533	A	7	7	340735	340741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020533	TCT	2	6	342841	342846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_020533	TAA	2	6	342996	343001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020533	AAT	2	6	343010	343015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020533	ATG	2	6	343041	343046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020533	T	6	6	343057	343062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020533	GAAT	2	8	345225	345232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020533	ATG	2	6	345238	345243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020533	ATAGA	2	10	345254	345263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020533	AATG	2	8	345298	345305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020533	ATATGA	2	12	345324	345335	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020533	TGACA	2	10	345446	345455	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1520	NC_020533	AGA	2	6	346490	346495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020533	AAGAT	2	10	346505	346514	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020533	ATT	2	6	346529	346534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020533	GAT	2	6	346591	346596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020533	GAT	2	6	346648	346653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020533	ATT	2	6	346717	346722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020533	GAA	3	9	346741	346749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020533	AGA	2	6	346776	346781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020533	GTT	2	6	346788	346793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020533	GAT	2	6	346801	346806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1531	NC_020533	AT	3	6	348590	348595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020533	CAT	2	6	349702	349707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020533	TTA	2	6	349725	349730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020533	TTCATT	2	12	349779	349790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1536	NC_020533	CTA	2	6	349815	349820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_020533	TA	3	6	349830	349835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020533	TAAG	2	8	350939	350946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020533	TA	3	6	350997	351002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020533	CCT	2	6	352370	352375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_020533	GTT	2	6	352390	352395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020533	TGT	2	6	352416	352421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020533	CTT	2	6	352591	352596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_020533	ACT	2	6	352619	352624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_020533	TAC	2	6	352643	352648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_020533	T	6	6	352702	352707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020533	GA	3	6	352812	352817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020533	TCA	2	6	352831	352836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020533	TGCAAT	2	12	352911	352922	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1551	NC_020533	AAT	2	6	352995	353000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020533	GTA	2	6	353009	353014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020533	ATG	2	6	353071	353076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020533	GTT	2	6	353080	353085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1556	NC_020533	TTGTAA	2	12	355082	355093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_020533	TTAG	2	8	355242	355249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020533	TGG	2	6	355263	355268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020533	TATT	2	8	355295	355302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020533	CAA	2	6	355406	355411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_020533	TTA	2	6	355475	355480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020533	GAA	2	6	355536	355541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020533	GACT	2	8	355551	355558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1566	NC_020533	GAA	3	9	355637	355645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020533	ATT	2	6	355773	355778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020533	TCGG	2	8	357189	357196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_020533	A	7	7	357211	357217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020533	AT	3	6	357221	357226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020533	A	6	6	357239	357244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020533	AT	3	6	357288	357293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020533	GAA	2	6	357301	357306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020533	GAA	2	6	357328	357333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020533	TGA	2	6	357519	357524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_020533	TAA	2	6	357700	357705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020533	AT	3	6	357737	357742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020533	GATAA	2	10	357751	357760	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020533	T	6	6	357774	357779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_020533	TGA	2	6	364022	364027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020533	TTTA	2	8	364049	364056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020533	GTT	2	6	364074	364079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020533	TAT	2	6	364085	364090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020533	ATT	2	6	364117	364122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020533	GGA	2	6	364144	364149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020533	ATC	2	6	364159	364164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1598	NC_020533	TTG	2	6	368094	368099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020533	TGGT	2	8	368119	368126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020533	TGC	2	6	368242	368247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_020533	CCA	2	6	368887	368892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_020533	ATG	2	6	368895	368900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020533	ACG	2	6	368909	368914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1605	NC_020533	TGT	2	6	369012	369017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020533	GT	3	6	369034	369039	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020533	TCT	2	6	369060	369065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_020533	T	6	6	369122	369127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020533	AAT	2	6	369137	369142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020533	GAC	2	6	369161	369166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_020533	TTG	2	6	369172	369177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020533	TAAAA	2	10	369191	369200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020533	GTTA	2	8	369203	369210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020533	CTCA	2	8	369225	369232	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1615	NC_020533	AGT	2	6	369235	369240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020533	AAT	2	6	369294	369299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020533	ATA	2	6	369345	369350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020533	AAGTAC	2	12	369373	369384	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1619	NC_020533	TCA	2	6	369432	369437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_020533	TTG	2	6	369464	369469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020533	TTGTT	2	10	369496	369505	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020533	GAT	2	6	369523	369528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020533	ATC	2	6	369554	369559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_020533	TGAT	2	8	369563	369570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020533	TTG	2	6	369671	369676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020533	TTG	2	6	369683	369688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020533	ATA	2	6	369711	369716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020533	CAT	2	6	369754	369759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_020533	GTT	2	6	369836	369841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020533	CATA	2	8	369851	369858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_020533	T	7	7	369873	369879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020533	TAT	2	6	370131	370136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020533	GAG	2	6	370138	370143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_020533	ATC	2	6	372429	372434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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