MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020532	T	6	6	720862	720867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020532	ATTA	2	8	720907	720914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020532	A	6	6	720949	720954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020532	TGT	2	6	720973	720978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020532	AGA	2	6	721037	721042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020532	A	6	6	721069	721074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020532	TAAAG	2	10	722279	722288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020532	ATGA	2	8	722298	722305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020532	TTA	2	6	722330	722335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020532	A	6	6	722415	722420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020532	TAA	2	6	722431	722436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020532	GAT	2	6	722508	722513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020532	A	6	6	722514	722519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_020532	A	6	6	722553	722558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_020532	TTG	2	6	722573	722578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_020532	GTTT	2	8	722593	722600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_020532	TTA	2	6	722608	722613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_020532	CAA	2	6	722621	722626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_020532	TGAA	2	8	722753	722760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_020532	AAAT	2	8	722802	722809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_020532	AGAA	2	8	722889	722896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020532	ATA	2	6	722983	722988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020532	ATA	2	6	722994	722999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_020532	AAT	2	6	723044	723049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020532	ATG	2	6	723081	723086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020532	GAA	2	6	723146	723151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020532	AACG	2	8	723188	723195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_020532	AGA	2	6	723254	723259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020532	GCT	2	6	723402	723407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_020532	TTGG	2	8	723408	723415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020532	AGA	2	6	723418	723423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020532	GTG	2	6	723475	723480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020532	ATGA	2	8	723559	723566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020532	TAA	2	6	723568	723573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020532	CAA	2	6	723574	723579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4038	NC_020532	AT	3	6	727522	727527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020532	TTTTTA	2	12	727619	727630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020532	ATGA	2	8	727636	727643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020532	T	6	6	727671	727676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020532	TAAA	2	8	727748	727755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020532	TAT	2	6	729008	729013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_020532	T	7	7	729035	729041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_020532	AT	3	6	730527	730532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_020532	TGGT	2	8	730563	730570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_020532	T	7	7	730573	730579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_020532	T	6	6	730644	730649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_020532	TTG	2	6	730680	730685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_020532	GA	3	6	730729	730734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_020532	AAAT	2	8	731630	731637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_020532	TAAA	2	8	731691	731698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020532	A	7	7	732699	732705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_020532	CTT	2	6	732726	732731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_020532	ATTTT	2	10	732744	732753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_020532	ATAA	2	8	732754	732761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_020532	ATATCA	2	12	734370	734381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4059	NC_020532	GTT	2	6	734421	734426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4061	NC_020532	TG	3	6	734982	734987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020532	TA	3	6	734993	734998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020532	AAAC	2	8	735078	735085	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_020532	A	7	7	735096	735102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020532	TA	4	8	735145	735152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020532	A	6	6	735156	735161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020532	G	6	6	735186	735191	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020532	TGT	2	6	735268	735273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_020532	ATT	2	6	735299	735304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_020532	T	6	6	735457	735462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_020532	TGA	2	6	735492	735497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4079	NC_020532	T	6	6	735632	735637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_020532	AT	3	6	736651	736656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_020532	ACA	2	6	737445	737450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4100	NC_020532	AGTA	2	8	737704	737711	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_020532	CTT	2	6	737740	737745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_020532	ATGTG	2	10	737754	737763	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_020532	TTTA	2	8	737783	737790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_020532	TGT	2	6	737829	737834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_020532	TAA	2	6	738530	738535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_020532	TAA	2	6	738539	738544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_020532	TAAAA	2	10	738582	738591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020532	A	7	7	738588	738594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_020532	GAAA	2	8	738618	738625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_020532	AT	4	8	738641	738648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_020532	T	6	6	738689	738694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_020532	GAATA	2	10	738741	738750	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_020532	AT	3	6	738755	738760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4116	NC_020532	CTA	2	6	739531	739536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4119	NC_020532	ATT	2	6	741265	741270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020532	TGT	2	6	741284	741289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020532	AT	3	6	741346	741351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020532	GTT	2	6	741352	741357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020532	TAC	2	6	741375	741380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4125	NC_020532	ACC	2	6	741458	741463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_020532	AAAGT	2	10	741521	741530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020532	ATG	2	6	742320	742325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4129	NC_020532	ATA	2	6	743317	743322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_020532	GT	3	6	743386	743391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_020532	TATT	2	8	743423	743430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_020532	TTA	3	9	743444	743452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_020532	ATA	2	6	743490	743495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_020532	TAAA	2	8	743497	743504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_020532	TTA	2	6	743643	743648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_020532	TAT	2	6	743700	743705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_020532	TAT	2	6	745728	745733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4272	NC_020532	A	7	7	771917	771923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_020532	ATTTT	2	10	771952	771961	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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