MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020532	AT	3	6	2721650	2721655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_020532	ATG	2	6	2721699	2721704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_020532	TAT	2	6	2721705	2721710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_020532	T	7	7	2721710	2721716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_020532	GA	3	6	2721731	2721736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_020532	TTA	2	6	2721754	2721759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_020532	ATC	2	6	2721793	2721798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_020532	AT	3	6	2721851	2721856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_020532	TTC	2	6	2721867	2721872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_020532	AGTA	2	8	2721879	2721886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_020532	CTA	2	6	2721889	2721894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_020532	ATG	2	6	2721950	2721955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_020532	AGTT	2	8	2721981	2721988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_020532	T	6	6	2721987	2721992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_020532	AT	3	6	2722074	2722079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_020532	GTA	2	6	2722133	2722138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_020532	T	6	6	2722171	2722176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_020532	CAT	2	6	2722179	2722184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_020532	ATT	2	6	2722267	2722272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_020532	ACT	2	6	2722297	2722302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_020532	TCA	2	6	2723709	2723714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_020532	AT	3	6	2723732	2723737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_020532	ACGAC	2	10	2723793	2723802	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16024	NC_020532	T	6	6	2723834	2723839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_020532	TTG	2	6	2724504	2724509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_020532	AATCA	2	10	2724514	2724523	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16027	NC_020532	TTG	2	6	2727923	2727928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_020532	GTT	2	6	2729434	2729439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_020532	TACTT	2	10	2729440	2729449	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16030	NC_020532	TAA	2	6	2729477	2729482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_020532	CTT	2	6	2729618	2729623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_020532	TTA	2	6	2729642	2729647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_020532	TTTC	2	8	2729659	2729666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16034	NC_020532	TTA	2	6	2729674	2729679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_020532	TAT	2	6	2730832	2730837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_020532	TAT	2	6	2730856	2730861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_020532	ATTTTA	2	12	2730893	2730904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_020532	T	6	6	2730905	2730910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_020532	CTATTT	2	12	2731441	2731452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16040	NC_020532	TAA	2	6	2732220	2732225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_020532	TGA	2	6	2732254	2732259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_020532	TAT	2	6	2732291	2732296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_020532	AT	3	6	2734008	2734013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_020532	CATT	2	8	2734027	2734034	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16045	NC_020532	CAA	2	6	2734048	2734053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_020532	A	6	6	2734632	2734637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_020532	CCT	2	6	2735497	2735502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16048	NC_020532	T	6	6	2735502	2735507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_020532	A	7	7	2735516	2735522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_020532	TAG	2	6	2735605	2735610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_020532	ATA	3	9	2735625	2735633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_020532	CTT	2	6	2735677	2735682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_020532	AATT	2	8	2735691	2735698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_020532	GTG	2	6	2735719	2735724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_020532	ATTCGA	2	12	2735761	2735772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16056	NC_020532	T	6	6	2735794	2735799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_020532	GGT	2	6	2735801	2735806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_020532	TGTA	2	8	2735809	2735816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_020532	A	6	6	2735827	2735832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_020532	AT	5	10	2736412	2736421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_020532	ATC	2	6	2736438	2736443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_020532	AGGT	2	8	2736526	2736533	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_020532	ATG	2	6	2737664	2737669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_020532	TTAA	2	8	2738709	2738716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_020532	T	6	6	2738771	2738776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_020532	CATA	2	8	2738782	2738789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16067	NC_020532	TAAAT	2	10	2738824	2738833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_020532	CAAA	2	8	2739508	2739515	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16069	NC_020532	GAT	2	6	2739561	2739566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_020532	ATG	2	6	2739587	2739592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_020532	ATC	2	6	2740406	2740411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_020532	GCC	2	6	2740498	2740503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16073	NC_020532	T	7	7	2740513	2740519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_020532	T	6	6	2740540	2740545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_020532	TAC	2	6	2740572	2740577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_020532	ATCTG	2	10	2740691	2740700	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16077	NC_020532	CTA	2	6	2740720	2740725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_020532	ATA	2	6	2740732	2740737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_020532	GTT	2	6	2740786	2740791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_020532	AAC	2	6	2740813	2740818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_020532	TTA	2	6	2741350	2741355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_020532	AAC	2	6	2741362	2741367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_020532	T	6	6	2741379	2741384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_020532	T	6	6	2741403	2741408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_020532	TAA	2	6	2741414	2741419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_020532	TTC	2	6	2741436	2741441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_020532	AAT	2	6	2741456	2741461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_020532	TTAAT	2	10	2741478	2741487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_020532	ATT	2	6	2741498	2741503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_020532	AGAA	2	8	2741559	2741566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_020532	A	7	7	2743236	2743242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_020532	ATTT	2	8	2743287	2743294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_020532	CA	3	6	2743337	2743342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16094	NC_020532	CCT	2	6	2744327	2744332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16095	NC_020532	TAA	2	6	2744393	2744398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_020532	ACCA	2	8	2744445	2744452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16097	NC_020532	AAT	2	6	2744474	2744479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_020532	ACA	2	6	2744519	2744524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_020532	GGAT	2	8	2744529	2744536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_020532	AT	4	8	2745156	2745163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_020532	TAA	2	6	2745166	2745171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_020532	AAT	2	6	2745176	2745181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_020532	ATA	2	6	2745187	2745192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_020532	TTG	2	6	2746323	2746328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_020532	CTT	2	6	2746350	2746355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_020532	AGT	2	6	2746374	2746379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_020532	AGG	2	6	2746521	2746526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_020532	CTTA	2	8	2747359	2747366	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16109	NC_020532	GTAG	2	8	2747369	2747376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_020532	T	6	6	2747383	2747388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_020532	ACA	2	6	2747402	2747407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_020532	CTT	2	6	2747440	2747445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_020532	CAAT	2	8	2747980	2747987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16114	NC_020532	A	6	6	2748021	2748026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_020532	TAT	2	6	2748029	2748034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_020532	AAT	2	6	2748037	2748042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_020532	CAT	2	6	2748071	2748076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_020532	CTCA	2	8	2748128	2748135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16119	NC_020532	CTA	2	6	2748141	2748146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_020532	TTCA	2	8	2748175	2748182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16121	NC_020532	CTA	2	6	2748207	2748212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_020532	ATT	2	6	2748221	2748226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_020532	GATTTT	2	12	2750917	2750928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_020532	GA	3	6	2750967	2750972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_020532	ACA	2	6	2751091	2751096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_020532	TTA	2	6	2751121	2751126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_020532	TTA	2	6	2751135	2751140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_020532	CGT	2	6	2751148	2751153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16129	NC_020532	GAA	2	6	2751154	2751159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_020532	CAA	2	6	2751227	2751232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16131	NC_020532	GCT	2	6	2751245	2751250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16132	NC_020532	T	6	6	2751253	2751258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_020532	T	6	6	2751335	2751340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16134	NC_020532	ATTT	2	8	2751396	2751403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_020532	A	6	6	2751406	2751411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16136	NC_020532	TAA	2	6	2751454	2751459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_020532	T	6	6	2751504	2751509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16140	NC_020532	TTG	2	6	2751827	2751832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16142	NC_020532	ATA	2	6	2751855	2751860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16146	NC_020532	TTA	2	6	2752637	2752642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16148	NC_020532	T	6	6	2752757	2752762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16149	NC_020532	ATAC	2	8	2752789	2752796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16150	NC_020532	TGA	2	6	2752802	2752807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16151	NC_020532	CAA	2	6	2752823	2752828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16152	NC_020532	CAT	2	6	2752863	2752868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16153	NC_020532	TAA	2	6	2752964	2752969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16154	NC_020532	TAA	2	6	2753055	2753060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16155	NC_020532	C	6	6	2753071	2753076	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16156	NC_020532	A	6	6	2753079	2753084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16158	NC_020532	TAA	2	6	2753134	2753139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16159	NC_020532	CAA	2	6	2753216	2753221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16160	NC_020532	AG	3	6	2753268	2753273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16161	NC_020532	GAT	2	6	2753364	2753369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16162	NC_020532	ATA	2	6	2753384	2753389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16163	NC_020532	AAGA	2	8	2753395	2753402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16164	NC_020532	TAG	2	6	2753412	2753417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16168	NC_020532	ACC	2	6	2753482	2753487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16169	NC_020532	GAA	2	6	2753499	2753504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16170	NC_020532	TAAT	2	8	2753545	2753552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16171	NC_020532	CA	3	6	2753573	2753578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16172	NC_020532	ATTT	2	8	2753730	2753737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16173	NC_020532	CGT	2	6	2753738	2753743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16177	NC_020532	A	7	7	2753903	2753909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16178	NC_020532	TCA	2	6	2753952	2753957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16181	NC_020532	CCT	2	6	2758913	2758918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16204	NC_020532	T	7	7	2759869	2759875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.