MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_020532	TTC	2	6	2612381	2612386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15502	NC_020532	CAA	2	6	2612499	2612504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_020532	TAA	2	6	2612530	2612535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_020532	GCAAG	2	10	2612550	2612559	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15505	NC_020532	TCC	2	6	2613186	2613191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15506	NC_020532	TGA	2	6	2613249	2613254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_020532	AGA	2	6	2615046	2615051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_020532	T	6	6	2616475	2616480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_020532	TTAT	2	8	2616489	2616496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_020532	TTAC	2	8	2617261	2617268	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15511	NC_020532	T	6	6	2617280	2617285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_020532	ACA	2	6	2617332	2617337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15513	NC_020532	TTA	2	6	2617346	2617351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_020532	ATT	2	6	2617425	2617430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_020532	GAA	2	6	2617433	2617438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_020532	GAT	2	6	2617499	2617504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_020532	AGG	2	6	2617526	2617531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_020532	TAA	2	6	2618350	2618355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15519	NC_020532	TTC	2	6	2618388	2618393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_020532	AGT	2	6	2618425	2618430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_020532	TTAC	2	8	2619301	2619308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15522	NC_020532	TAA	2	6	2619395	2619400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_020532	TAT	2	6	2619409	2619414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15524	NC_020532	T	6	6	2619452	2619457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15525	NC_020532	TTTTCT	2	12	2619459	2619470	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15526	NC_020532	CTT	2	6	2619483	2619488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15527	NC_020532	TAA	2	6	2619499	2619504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_020532	TCC	2	6	2619510	2619515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15529	NC_020532	GATTC	2	10	2619576	2619585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15530	NC_020532	AATTAA	2	12	2619649	2619660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_020532	T	6	6	2619717	2619722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_020532	TGT	2	6	2619752	2619757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_020532	T	7	7	2621623	2621629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_020532	TAA	2	6	2621647	2621652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15535	NC_020532	ACT	2	6	2622786	2622791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15536	NC_020532	TTTA	2	8	2622815	2622822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_020532	CTC	2	6	2622845	2622850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15538	NC_020532	ACT	2	6	2622855	2622860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15539	NC_020532	ACT	2	6	2622864	2622869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15540	NC_020532	ATT	2	6	2622870	2622875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_020532	TCC	2	6	2623391	2623396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15542	NC_020532	TAT	2	6	2623406	2623411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_020532	TAT	2	6	2623434	2623439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_020532	TCAAT	2	10	2623450	2623459	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15545	NC_020532	ACA	2	6	2623481	2623486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_020532	GTTAA	2	10	2623504	2623513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15547	NC_020532	AAAT	2	8	2623531	2623538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15548	NC_020532	CAT	2	6	2623594	2623599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_020532	ATA	2	6	2623623	2623628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_020532	ATAAAA	2	12	2623660	2623671	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_020532	CTA	2	6	2623699	2623704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15552	NC_020532	AAT	2	6	2623766	2623771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_020532	TTCA	2	8	2623781	2623788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15554	NC_020532	TCT	2	6	2623821	2623826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15555	NC_020532	CAA	2	6	2623873	2623878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15556	NC_020532	TGC	2	6	2623886	2623891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15557	NC_020532	CAAA	2	8	2623898	2623905	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15558	NC_020532	ATT	4	12	2623958	2623969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_020532	AATC	2	8	2624023	2624030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15560	NC_020532	TAC	2	6	2624035	2624040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15561	NC_020532	TCA	2	6	2624092	2624097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15562	NC_020532	GTA	2	6	2624944	2624949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_020532	TAT	2	6	2625798	2625803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_020532	GAAAG	2	10	2625831	2625840	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_020532	AAG	3	9	2625838	2625846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_020532	AT	3	6	2626712	2626717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_020532	ACC	2	6	2626749	2626754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15568	NC_020532	ACT	2	6	2627560	2627565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15569	NC_020532	ATA	2	6	2627626	2627631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_020532	ATT	3	9	2627641	2627649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_020532	TGCT	2	8	2627676	2627683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15572	NC_020532	A	7	7	2627684	2627690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_020532	AT	3	6	2627745	2627750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15574	NC_020532	TAAT	2	8	2627754	2627761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15575	NC_020532	CCTAA	2	10	2628745	2628754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15576	NC_020532	ATTT	2	8	2628759	2628766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_020532	ATTTT	2	10	2628816	2628825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15578	NC_020532	AATA	2	8	2628899	2628906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_020532	T	7	7	2629016	2629022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15580	NC_020532	TA	3	6	2629062	2629067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15581	NC_020532	CCT	2	6	2629069	2629074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15582	NC_020532	TCA	2	6	2629091	2629096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15583	NC_020532	CAT	2	6	2629106	2629111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15584	NC_020532	A	6	6	2629262	2629267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_020532	ATT	2	6	2629346	2629351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_020532	A	6	6	2629373	2629378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_020532	GGA	2	6	2629408	2629413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_020532	A	7	7	2630875	2630881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_020532	T	6	6	2630920	2630925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_020532	GCAA	2	8	2632319	2632326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15591	NC_020532	CT	3	6	2632333	2632338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15592	NC_020532	TAA	2	6	2632413	2632418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15593	NC_020532	AT	3	6	2632434	2632439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_020532	TGC	2	6	2632573	2632578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15595	NC_020532	TCAT	2	8	2632589	2632596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15596	NC_020532	TGT	2	6	2632614	2632619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15597	NC_020532	TAA	2	6	2632626	2632631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15598	NC_020532	CAAT	2	8	2632633	2632640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15599	NC_020532	TAT	2	6	2632656	2632661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15600	NC_020532	AT	3	6	2632699	2632704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_020532	ATA	2	6	2632712	2632717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_020532	ATTT	2	8	2632742	2632749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15603	NC_020532	CTAT	2	8	2632789	2632796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15604	NC_020532	TTAT	2	8	2632817	2632824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_020532	TATT	2	8	2632845	2632852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15606	NC_020532	ATT	2	6	2632901	2632906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15607	NC_020532	AATAA	2	10	2632951	2632960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15608	NC_020532	TTAA	2	8	2632966	2632973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_020532	ATT	2	6	2632981	2632986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_020532	T	6	6	2633991	2633996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15611	NC_020532	ACT	2	6	2634004	2634009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_020532	T	6	6	2634054	2634059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_020532	GTAT	2	8	2634079	2634086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_020532	A	7	7	2634097	2634103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_020532	ATC	2	6	2635696	2635701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_020532	TAGT	2	8	2635796	2635803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_020532	AGCA	2	8	2635823	2635830	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15618	NC_020532	GTAAAT	2	12	2635834	2635845	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15619	NC_020532	ATT	2	6	2635850	2635855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15620	NC_020532	AT	3	6	2635869	2635874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15621	NC_020532	AGA	2	6	2635891	2635896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_020532	ATCAA	2	10	2635902	2635911	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15623	NC_020532	ATT	2	6	2635917	2635922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_020532	ACA	2	6	2635925	2635930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15625	NC_020532	ATCA	2	8	2636013	2636020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15626	NC_020532	ATT	2	6	2636082	2636087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15627	NC_020532	TTA	2	6	2636172	2636177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15628	NC_020532	GAC	2	6	2636269	2636274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15629	NC_020532	CAT	2	6	2636281	2636286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15630	NC_020532	ATC	2	6	2636311	2636316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15631	NC_020532	TGA	2	6	2637980	2637985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15632	NC_020532	TA	4	8	2638009	2638016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15633	NC_020532	ATTC	2	8	2638641	2638648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15634	NC_020532	TATT	2	8	2638652	2638659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15638	NC_020532	TGA	2	6	2638939	2638944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15640	NC_020532	TCT	2	6	2638996	2639001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15643	NC_020532	TC	3	6	2639085	2639090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15644	NC_020532	TA	3	6	2639099	2639104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15645	NC_020532	ATC	2	6	2639206	2639211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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