MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_020532	T	6	6	2454049	2454054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_020532	AAT	2	6	2454092	2454097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_020532	TAAT	2	8	2454114	2454121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_020532	TAA	2	6	2454141	2454146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_020532	A	6	6	2455697	2455702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_020532	ATA	2	6	2455726	2455731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_020532	ATC	2	6	2455733	2455738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_020532	CTTG	2	8	2456679	2456686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14509	NC_020532	GTC	2	6	2456746	2456751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_020532	ATCA	2	8	2456819	2456826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14511	NC_020532	CTG	2	6	2456869	2456874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_020532	TTTA	2	8	2456878	2456885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_020532	TAA	2	6	2456900	2456905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_020532	GTT	3	9	2457916	2457924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_020532	TAC	2	6	2457936	2457941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_020532	CA	3	6	2457985	2457990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14517	NC_020532	AC	3	6	2458012	2458017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14518	NC_020532	GT	3	6	2458048	2458053	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_020532	ACTT	2	8	2458061	2458068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14520	NC_020532	ATA	2	6	2458096	2458101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_020532	CCT	2	6	2459534	2459539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14522	NC_020532	AT	3	6	2459569	2459574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_020532	TAAA	2	8	2459608	2459615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_020532	T	6	6	2459624	2459629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_020532	AAT	2	6	2459641	2459646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_020532	ATA	2	6	2459675	2459680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_020532	ATT	2	6	2459737	2459742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_020532	T	6	6	2459764	2459769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_020532	TCT	2	6	2459805	2459810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_020532	CCT	2	6	2461460	2461465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14531	NC_020532	CCA	2	6	2462075	2462080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14532	NC_020532	CAT	2	6	2463433	2463438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_020532	TATG	2	8	2463504	2463511	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_020532	TTTG	2	8	2463531	2463538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_020532	ATG	2	6	2463579	2463584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_020532	TTA	2	6	2463585	2463590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_020532	ATT	3	9	2463594	2463602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_020532	T	6	6	2463634	2463639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_020532	TAT	2	6	2463651	2463656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_020532	GTT	2	6	2463667	2463672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_020532	A	6	6	2463680	2463685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_020532	ATT	2	6	2463704	2463709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_020532	TAA	2	6	2463728	2463733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_020532	TCA	2	6	2463810	2463815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_020532	GACA	2	8	2463899	2463906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14546	NC_020532	A	7	7	2463912	2463918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_020532	CAAC	2	8	2463919	2463926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14548	NC_020532	GTT	2	6	2463941	2463946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_020532	TGT	3	9	2463962	2463970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_020532	TAT	2	6	2464623	2464628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_020532	AT	3	6	2464627	2464632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_020532	A	6	6	2464644	2464649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_020532	A	6	6	2464680	2464685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_020532	TAT	3	9	2464696	2464704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_020532	ATT	2	6	2464727	2464732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_020532	T	6	6	2464731	2464736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_020532	AT	3	6	2466424	2466429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_020532	AC	5	10	2466437	2466446	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14559	NC_020532	AACC	2	8	2466450	2466457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14560	NC_020532	TTGG	2	8	2466473	2466480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_020532	T	6	6	2466481	2466486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_020532	TAAC	2	8	2466508	2466515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14563	NC_020532	AGA	2	6	2466559	2466564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_020532	CAT	2	6	2466566	2466571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_020532	ATC	2	6	2466656	2466661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14566	NC_020532	GAT	2	6	2466689	2466694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_020532	AGG	2	6	2466697	2466702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_020532	TAA	2	6	2466704	2466709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_020532	A	6	6	2468078	2468083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_020532	CAAA	2	8	2469328	2469335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14571	NC_020532	A	6	6	2469374	2469379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_020532	TG	3	6	2469380	2469385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_020532	TA	4	8	2469397	2469404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_020532	TAT	2	6	2469412	2469417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_020532	ATA	2	6	2469418	2469423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_020532	ATT	2	6	2469456	2469461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_020532	TAA	2	6	2469507	2469512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_020532	CAA	2	6	2469535	2469540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14579	NC_020532	A	6	6	2469548	2469553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_020532	GCAC	2	8	2469554	2469561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14581	NC_020532	CTC	2	6	2471149	2471154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14582	NC_020532	AT	3	6	2471160	2471165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_020532	TAT	2	6	2471172	2471177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_020532	T	7	7	2471183	2471189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_020532	A	6	6	2471215	2471220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_020532	A	6	6	2471281	2471286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_020532	AAC	2	6	2471342	2471347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14588	NC_020532	TAT	2	6	2471370	2471375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_020532	T	6	6	2472557	2472562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_020532	TTA	2	6	2472643	2472648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_020532	TAT	2	6	2472700	2472705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_020532	AAC	2	6	2472727	2472732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14593	NC_020532	TTAA	2	8	2472776	2472783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_020532	CTT	2	6	2472854	2472859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14595	NC_020532	ATC	2	6	2472867	2472872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_020532	GAC	2	6	2472882	2472887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_020532	TTC	2	6	2472905	2472910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_020532	T	6	6	2472976	2472981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_020532	CAA	2	6	2472989	2472994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_020532	CTT	2	6	2473008	2473013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_020532	CAAT	2	8	2473098	2473105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14602	NC_020532	ATC	2	6	2473106	2473111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14603	NC_020532	TGT	2	6	2473118	2473123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_020532	TAT	2	6	2473129	2473134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_020532	TCTCTT	2	12	2473140	2473151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_020532	AT	3	6	2473181	2473186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_020532	TCT	2	6	2473209	2473214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_020532	ATT	2	6	2473232	2473237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_020532	ATT	2	6	2473244	2473249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_020532	ATT	3	9	2473274	2473282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_020532	T	6	6	2473287	2473292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_020532	CCT	2	6	2473349	2473354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14613	NC_020532	TTCTT	2	10	2473461	2473470	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14614	NC_020532	CAG	2	6	2473504	2473509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_020532	AC	3	6	2473514	2473519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14616	NC_020532	A	6	6	2473587	2473592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_020532	A	8	8	2473604	2473611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_020532	AAATTT	2	12	2473617	2473628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_020532	CAT	2	6	2473637	2473642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14620	NC_020532	T	6	6	2473642	2473647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_020532	GACT	2	8	2473693	2473700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14622	NC_020532	TG	3	6	2474240	2474245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_020532	ACT	2	6	2474256	2474261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14624	NC_020532	ATT	2	6	2474270	2474275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_020532	GCT	2	6	2474295	2474300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_020532	ATACA	2	10	2476035	2476044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14627	NC_020532	TA	3	6	2476067	2476072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_020532	TAT	2	6	2476859	2476864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_020532	TTTA	2	8	2476930	2476937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14630	NC_020532	AG	3	6	2476969	2476974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14632	NC_020532	T	6	6	2477057	2477062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14894	NC_020532	CTT	3	9	2512576	2512584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14895	NC_020532	TC	3	6	2512585	2512590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14896	NC_020532	TCT	2	6	2512686	2512691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14897	NC_020532	TAA	2	6	2512708	2512713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14898	NC_020532	T	6	6	2512731	2512736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14900	NC_020532	TCT	2	6	2512755	2512760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14902	NC_020532	ATT	2	6	2514247	2514252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14903	NC_020532	TA	3	6	2514254	2514259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14972	NC_020532	TAA	2	6	2529194	2529199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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