MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020532	TAATG	2	10	2374055	2374064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_020532	TAC	2	6	2374120	2374125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_020532	A	6	6	2375899	2375904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_020532	T	7	7	2375944	2375950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_020532	CAT	2	6	2375957	2375962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_020532	TCC	2	6	2376598	2376603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_020532	TAT	2	6	2376741	2376746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_020532	ATT	3	9	2376763	2376771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_020532	ATT	2	6	2376807	2376812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_020532	TTA	2	6	2376863	2376868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_020532	CTG	2	6	2376886	2376891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_020532	TCC	2	6	2377425	2377430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_020532	ATTG	2	8	2377522	2377529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_020532	TG	3	6	2377528	2377533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_020532	T	6	6	2378651	2378656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_020532	ATAC	2	8	2378672	2378679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14017	NC_020532	ATA	2	6	2378796	2378801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_020532	CAA	2	6	2378860	2378865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_020532	GCT	2	6	2378970	2378975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_020532	CG	3	6	2378977	2378982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_020532	AAT	2	6	2379019	2379024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_020532	ATT	2	6	2379060	2379065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_020532	TCA	2	6	2379077	2379082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_020532	CA	3	6	2379081	2379086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14025	NC_020532	AT	3	6	2379087	2379092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_020532	AAAT	2	8	2380236	2380243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_020532	AC	3	6	2380293	2380298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14028	NC_020532	ACA	2	6	2380314	2380319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_020532	T	6	6	2380344	2380349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_020532	TAT	2	6	2380361	2380366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_020532	T	6	6	2380366	2380371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_020532	TCA	2	6	2380379	2380384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_020532	CAA	2	6	2380426	2380431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_020532	TG	3	6	2380450	2380455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_020532	GAA	2	6	2380513	2380518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_020532	CAT	2	6	2380531	2380536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_020532	TA	3	6	2380563	2380568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_020532	AGA	2	6	2380572	2380577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_020532	AGT	2	6	2380590	2380595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_020532	TAA	2	6	2380627	2380632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_020532	AAACAT	2	12	2380639	2380650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14042	NC_020532	TG	4	8	2380667	2380674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_020532	TGT	2	6	2380690	2380695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_020532	CT	3	6	2380723	2380728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14045	NC_020532	TAAA	2	8	2380743	2380750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_020532	A	6	6	2380764	2380769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_020532	ATA	2	6	2380779	2380784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_020532	TCC	2	6	2380801	2380806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14049	NC_020532	TAT	2	6	2380836	2380841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_020532	A	6	6	2380851	2380856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_020532	AAATA	2	10	2380933	2380942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_020532	CGCT	2	8	2380955	2380962	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14053	NC_020532	TAT	2	6	2380981	2380986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_020532	TATT	2	8	2380990	2380997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_020532	ATTA	2	8	2382282	2382289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_020532	CCT	2	6	2382290	2382295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14057	NC_020532	TGT	2	6	2382324	2382329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_020532	TAT	2	6	2382331	2382336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_020532	TCA	2	6	2382370	2382375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_020532	AGG	2	6	2382422	2382427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_020532	ATTT	2	8	2382431	2382438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020532	TA	3	6	2383100	2383105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_020532	CCT	2	6	2385588	2385593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14064	NC_020532	TAT	2	6	2385658	2385663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_020532	TA	3	6	2385669	2385674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_020532	CATT	2	8	2385700	2385707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14067	NC_020532	CTATA	2	10	2385715	2385724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14068	NC_020532	ATTA	2	8	2385740	2385747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_020532	TAG	2	6	2386173	2386178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_020532	ATCT	2	8	2386224	2386231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14071	NC_020532	ATG	2	6	2386273	2386278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_020532	AGA	2	6	2386281	2386286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_020532	ATT	2	6	2386335	2386340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_020532	TTG	2	6	2386387	2386392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_020532	TAA	2	6	2386409	2386414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_020532	TAA	2	6	2386449	2386454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_020532	GAT	2	6	2386457	2386462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_020532	TAAT	2	8	2386476	2386483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_020532	AT	3	6	2386486	2386491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_020532	TGA	2	6	2386521	2386526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_020532	TGA	2	6	2386589	2386594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_020532	ATG	2	6	2386603	2386608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_020532	TAATA	2	10	2386610	2386619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_020532	TGT	2	6	2386669	2386674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_020532	GTT	2	6	2386699	2386704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_020532	TTC	2	6	2386764	2386769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_020532	GCT	2	6	2386770	2386775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_020532	ATG	2	6	2386822	2386827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_020532	TG	3	6	2386851	2386856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_020532	TTG	2	6	2386864	2386869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_020532	ATT	2	6	2386920	2386925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_020532	T	6	6	2387029	2387034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020532	TTG	3	9	2387069	2387077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_020532	AAT	2	6	2387083	2387088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_020532	CTA	2	6	2387114	2387119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_020532	AAG	2	6	2387134	2387139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_020532	TGA	2	6	2387169	2387174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_020532	AAT	2	6	2387197	2387202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_020532	T	6	6	2387237	2387242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_020532	T	7	7	2387272	2387278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_020532	AGTT	2	8	2387312	2387319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_020532	T	6	6	2387338	2387343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_020532	ATTA	2	8	2387368	2387375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_020532	TAATT	2	10	2387385	2387394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_020532	AT	4	8	2387607	2387614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_020532	GA	4	8	2387622	2387629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_020532	CAT	2	6	2387654	2387659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_020532	TAA	2	6	2387689	2387694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_020532	TAT	2	6	2387695	2387700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_020532	TAA	2	6	2387714	2387719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_020532	GAT	2	6	2389823	2389828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_020532	TAT	2	6	2389895	2389900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_020532	ATA	2	6	2389910	2389915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_020532	TAG	2	6	2389926	2389931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_020532	AT	3	6	2389932	2389937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_020532	ATG	2	6	2389949	2389954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_020532	TA	3	6	2389964	2389969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_020532	CAG	2	6	2390018	2390023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_020532	AGT	2	6	2390091	2390096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_020532	AGA	2	6	2390160	2390165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_020532	TGA	2	6	2390210	2390215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_020532	TA	4	8	2390264	2390271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_020532	AC	3	6	2390384	2390389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14124	NC_020532	GT	3	6	2390415	2390420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_020532	AATT	2	8	2390428	2390435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_020532	TGA	2	6	2390511	2390516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_020532	GAAAAA	2	12	2390522	2390533	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_020532	CAT	2	6	2390564	2390569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_020532	TGTA	2	8	2390576	2390583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_020532	ATG	3	9	2390598	2390606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_020532	GAAA	2	8	2390614	2390621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_020532	ATAC	2	8	2390623	2390630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14133	NC_020532	ATA	2	6	2390647	2390652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_020532	CTA	2	6	2390653	2390658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14135	NC_020532	A	6	6	2390662	2390667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14136	NC_020532	A	7	7	2390695	2390701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14137	NC_020532	TTCAGA	2	12	2390714	2390725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14138	NC_020532	GTTAAA	2	12	2390727	2390738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14139	NC_020532	A	6	6	2390736	2390741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14140	NC_020532	GTTAAA	2	12	2390787	2390798	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14141	NC_020532	A	6	6	2390796	2390801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14142	NC_020532	ATG	2	6	2390809	2390814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14143	NC_020532	ATG	2	6	2390832	2390837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_020532	AGA	2	6	2390901	2390906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14150	NC_020532	AAC	2	6	2391088	2391093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14151	NC_020532	GCAT	2	8	2391131	2391138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14152	NC_020532	AAC	2	6	2391149	2391154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14158	NC_020532	AGA	2	6	2392817	2392822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14160	NC_020532	T	6	6	2392847	2392852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14161	NC_020532	CAA	2	6	2392958	2392963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14162	NC_020532	AAAT	2	8	2392970	2392977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14163	NC_020532	T	8	8	2393002	2393009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14164	NC_020532	CTT	2	6	2393010	2393015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14166	NC_020532	T	7	7	2393099	2393105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14167	NC_020532	ATT	2	6	2393115	2393120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14168	NC_020532	TACA	2	8	2393134	2393141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14169	NC_020532	A	6	6	2393152	2393157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14172	NC_020532	CTAT	2	8	2393180	2393187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14176	NC_020532	A	6	6	2393246	2393251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14177	NC_020532	AT	3	6	2393294	2393299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14178	NC_020532	ATT	2	6	2393305	2393310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14183	NC_020532	TAC	2	6	2394029	2394034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14189	NC_020532	AAT	3	9	2394278	2394286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14194	NC_020532	TCA	2	6	2394479	2394484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14195	NC_020532	ACT	2	6	2394525	2394530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14196	NC_020532	AATG	2	8	2394590	2394597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14197	NC_020532	T	6	6	2395809	2395814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14198	NC_020532	TA	3	6	2395836	2395841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14199	NC_020532	AT	4	8	2395914	2395921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14200	NC_020532	TAT	2	6	2395924	2395929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14201	NC_020532	TTAT	2	8	2395962	2395969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14202	NC_020532	CAT	2	6	2396025	2396030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14242	NC_020532	CTTA	2	8	2407005	2407012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14243	NC_020532	ATTT	2	8	2407016	2407023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_020532	T	6	6	2407021	2407026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14245	NC_020532	TCA	2	6	2408061	2408066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_020532	AATC	2	8	2408092	2408099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14247	NC_020532	CAC	2	6	2408131	2408136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14248	NC_020532	T	6	6	2408250	2408255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_020532	T	6	6	2408296	2408301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14250	NC_020532	ATA	2	6	2410744	2410749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_020532	A	7	7	2410758	2410764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_020532	A	7	7	2411662	2411668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_020532	AT	3	6	2411676	2411681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_020532	ATTT	2	8	2411697	2411704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_020532	AGCA	2	8	2411706	2411713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14256	NC_020532	AT	3	6	2411717	2411722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14257	NC_020532	TAT	3	9	2411740	2411748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14258	NC_020532	T	6	6	2412301	2412306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_020532	ATTTT	2	10	2412322	2412331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14261	NC_020532	TTA	2	6	2412421	2412426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14263	NC_020532	A	7	7	2412446	2412452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14392	NC_020532	ATTAA	2	10	2429258	2429267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14393	NC_020532	TAA	3	9	2429286	2429294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14394	NC_020532	ATA	2	6	2429343	2429348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14395	NC_020532	TAAA	2	8	2429376	2429383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14396	NC_020532	TAA	2	6	2429395	2429400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14402	NC_020532	A	6	6	2429586	2429591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14403	NC_020532	A	7	7	2429633	2429639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14492	NC_020532	AT	3	6	2449852	2449857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_020532	GAG	2	6	2449907	2449912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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