MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020532	TAT	2	6	2157218	2157223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020532	TA	3	6	2157344	2157349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020532	ATG	2	6	2157357	2157362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020532	TAT	2	6	2157376	2157381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020532	ACA	2	6	2157413	2157418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_020532	ATC	2	6	2157438	2157443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_020532	GAAA	2	8	2157460	2157467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020532	TA	4	8	2157507	2157514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020532	CTA	2	6	2157521	2157526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_020532	TAT	2	6	2157530	2157535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020532	TA	3	6	2157625	2157630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020532	AAGAA	2	10	2157674	2157683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020532	AAT	2	6	2157715	2157720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020532	T	7	7	2157859	2157865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020532	ACT	2	6	2157885	2157890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_020532	AGAA	2	8	2157933	2157940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_020532	A	6	6	2157939	2157944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_020532	GAATGT	2	12	2157964	2157975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_020532	A	6	6	2157976	2157981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_020532	CTTA	2	8	2158003	2158010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12521	NC_020532	GTT	2	6	2158058	2158063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020532	GTT	2	6	2158106	2158111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_020532	TTC	2	6	2158204	2158209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_020532	AT	3	6	2158215	2158220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_020532	GAA	2	6	2158224	2158229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_020532	AGA	2	6	2158238	2158243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_020532	TCA	2	6	2158333	2158338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12528	NC_020532	TAAAT	2	10	2158346	2158355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_020532	AATA	2	8	2158356	2158363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_020532	TTAA	2	8	2159260	2159267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_020532	ATT	2	6	2159276	2159281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_020532	TTA	2	6	2159284	2159289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_020532	TAACA	2	10	2160133	2160142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12534	NC_020532	TAAA	3	12	2160163	2160174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020532	A	6	6	2160233	2160238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020532	TTTAAT	2	12	2160279	2160290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_020532	TGAT	2	8	2160294	2160301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_020532	A	6	6	2160305	2160310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_020532	ATA	2	6	2162202	2162207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_020532	TAT	2	6	2162223	2162228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_020532	T	6	6	2162308	2162313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020532	TTA	2	6	2162334	2162339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_020532	TAA	2	6	2162373	2162378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_020532	CCG	2	6	2162410	2162415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12545	NC_020532	TCC	2	6	2162432	2162437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12546	NC_020532	AT	3	6	2162452	2162457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_020532	AT	3	6	2162479	2162484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_020532	CAAATA	2	12	2162499	2162510	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12549	NC_020532	ATT	2	6	2162567	2162572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_020532	GTT	2	6	2162583	2162588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_020532	T	7	7	2162637	2162643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_020532	TGA	2	6	2162678	2162683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_020532	TTTA	2	8	2162687	2162694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_020532	ATTT	2	8	2162705	2162712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_020532	TA	4	8	2162765	2162772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_020532	AT	3	6	2162778	2162783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_020532	A	6	6	2162785	2162790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_020532	TAAA	2	8	2164345	2164352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_020532	ATT	2	6	2166527	2166532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_020532	TAAATG	2	12	2166553	2166564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_020532	GTG	2	6	2166616	2166621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_020532	ATT	2	6	2166752	2166757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_020532	AGT	2	6	2166791	2166796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_020532	GAA	3	9	2166873	2166881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_020532	ATCGT	2	10	2166889	2166898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12566	NC_020532	AGA	2	6	2166914	2166919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_020532	GAG	2	6	2166936	2166941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_020532	TTTG	2	8	2168070	2168077	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_020532	AAG	2	6	2168082	2168087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_020532	TAA	2	6	2168115	2168120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_020532	GTA	2	6	2168122	2168127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_020532	A	6	6	2168164	2168169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_020532	TATG	2	8	2168202	2168209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_020532	TAA	2	6	2168228	2168233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_020532	TCC	2	6	2175831	2175836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12576	NC_020532	ATT	2	6	2175843	2175848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_020532	AGT	2	6	2175889	2175894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_020532	AATTAA	2	12	2175930	2175941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_020532	ATC	2	6	2175946	2175951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12580	NC_020532	TA	3	6	2175954	2175959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_020532	ATT	2	6	2176040	2176045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12582	NC_020532	A	7	7	2176057	2176063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_020532	TCC	2	6	2179233	2179238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12584	NC_020532	ATA	2	6	2179254	2179259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_020532	AT	3	6	2179298	2179303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_020532	A	6	6	2179312	2179317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_020532	ACT	2	6	2179336	2179341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_020532	A	7	7	2179362	2179368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_020532	AAT	2	6	2180355	2180360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_020532	TTA	2	6	2180411	2180416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_020532	A	8	8	2180423	2180430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_020532	AGT	2	6	2180456	2180461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_020532	AT	3	6	2180612	2180617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_020532	TGG	2	6	2180621	2180626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_020532	G	6	6	2180628	2180633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_020532	CCG	2	6	2180674	2180679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_020532	TAA	2	6	2180722	2180727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_020532	TGG	2	6	2180734	2180739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_020532	CCG	2	6	2180757	2180762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12600	NC_020532	AAT	2	6	2180812	2180817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_020532	CCG	2	6	2180846	2180851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12602	NC_020532	CCT	2	6	2181068	2181073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12603	NC_020532	AGTA	2	8	2181124	2181131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_020532	ATTT	2	8	2181155	2181162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_020532	TCGA	2	8	2181174	2181181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12606	NC_020532	TCA	2	6	2181236	2181241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_020532	G	6	6	2181286	2181291	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_020532	CA	3	6	2181327	2181332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_020532	CTC	2	6	2181413	2181418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12610	NC_020532	ACG	2	6	2181436	2181441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_020532	ACG	2	6	2181462	2181467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_020532	ACC	2	6	2181657	2181662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12613	NC_020532	ATGA	2	8	2181739	2181746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_020532	AGG	2	6	2181793	2181798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_020532	CAC	2	6	2181838	2181843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_020532	GTG	2	6	2181849	2181854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_020532	GTA	2	6	2181881	2181886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_020532	CCA	2	6	2181889	2181894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12619	NC_020532	CCTA	2	8	2181933	2181940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12620	NC_020532	TC	3	6	2182053	2182058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12621	NC_020532	GCC	2	6	2182150	2182155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12622	NC_020532	CTC	2	6	2182198	2182203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12623	NC_020532	TCGC	2	8	2182387	2182394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12624	NC_020532	TCTA	2	8	2182453	2182460	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12625	NC_020532	TCT	2	6	2182507	2182512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12626	NC_020532	CAATC	2	10	2182580	2182589	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12627	NC_020532	C	6	6	2182615	2182620	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12628	NC_020532	GGT	2	6	2182640	2182645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_020532	ATG	2	6	2182960	2182965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12630	NC_020532	GCT	2	6	2182966	2182971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12632	NC_020532	TGG	2	6	2183045	2183050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12634	NC_020532	AAT	2	6	2183186	2183191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12762	NC_020532	GTA	2	6	2199601	2199606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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