MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020532	GAC	2	6	2014285	2014290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_020532	ATC	2	6	2014307	2014312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_020532	TTA	2	6	2014317	2014322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020532	AAAC	2	8	2014368	2014375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_020532	TTC	2	6	2014397	2014402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_020532	CTT	2	6	2014409	2014414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_020532	TTC	2	6	2014565	2014570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_020532	TCA	2	6	2014578	2014583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_020532	TGT	2	6	2014590	2014595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_020532	GTTT	2	8	2014610	2014617	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_020532	TAC	2	6	2014618	2014623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_020532	TTTTC	2	10	2014744	2014753	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11513	NC_020532	TGA	2	6	2014810	2014815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_020532	TCT	2	6	2014836	2014841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_020532	TTTC	2	8	2014858	2014865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11516	NC_020532	T	6	6	2014870	2014875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_020532	TG	3	6	2014888	2014893	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_020532	TTC	2	6	2014896	2014901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_020532	TCAT	2	8	2014911	2014918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11520	NC_020532	TTTTC	2	10	2014921	2014930	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11521	NC_020532	ATC	2	6	2014943	2014948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_020532	CAA	2	6	2014973	2014978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_020532	AT	3	6	2015004	2015009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020532	GCTTT	2	10	2015030	2015039	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11525	NC_020532	GT	3	6	2016426	2016431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_020532	T	6	6	2016465	2016470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020532	GTT	2	6	2016513	2016518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020532	AT	3	6	2016526	2016531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_020532	GTTG	2	8	2016550	2016557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_020532	TGT	2	6	2016620	2016625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020532	T	6	6	2016639	2016644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_020532	AAT	2	6	2016645	2016650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_020532	CCT	2	6	2018661	2018666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_020532	GTT	2	6	2018695	2018700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_020532	ATT	2	6	2018710	2018715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_020532	AGTTTG	2	12	2018719	2018730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_020532	TGA	2	6	2018738	2018743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_020532	TTG	2	6	2018747	2018752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020532	GTT	2	6	2018757	2018762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020532	GTT	2	6	2018764	2018769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_020532	TTC	2	6	2018771	2018776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_020532	CTA	2	6	2018802	2018807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_020532	ACT	2	6	2018933	2018938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_020532	GC	3	6	2019030	2019035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11545	NC_020532	CTA	2	6	2019066	2019071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_020532	CCT	2	6	2019720	2019725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11547	NC_020532	TAA	2	6	2019873	2019878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020532	CCT	2	6	2019933	2019938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11549	NC_020532	GATT	2	8	2020007	2020014	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_020532	TCT	2	6	2020079	2020084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_020532	CTT	3	9	2020117	2020125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_020532	AAATC	2	10	2020139	2020148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11553	NC_020532	ATTA	2	8	2020156	2020163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_020532	ACAT	2	8	2020171	2020178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11555	NC_020532	TCC	2	6	2020205	2020210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11556	NC_020532	CAA	2	6	2020271	2020276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_020532	T	7	7	2020284	2020290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_020532	GTA	2	6	2020313	2020318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_020532	ATA	2	6	2020411	2020416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_020532	CTA	2	6	2020420	2020425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_020532	TCC	2	6	2020457	2020462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11562	NC_020532	T	6	6	2020471	2020476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_020532	AAT	2	6	2020536	2020541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_020532	TTC	2	6	2020672	2020677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_020532	TGG	2	6	2020702	2020707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_020532	CTTTC	2	10	2020732	2020741	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11567	NC_020532	TGT	2	6	2020750	2020755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020532	CGA	2	6	2020792	2020797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_020532	TGT	2	6	2020844	2020849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_020532	CTA	2	6	2020873	2020878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_020532	TGA	2	6	2020940	2020945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020532	GTT	2	6	2020951	2020956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_020532	TCC	2	6	2020980	2020985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_020532	A	6	6	2020988	2020993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_020532	ACC	2	6	2021075	2021080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11576	NC_020532	ACT	2	6	2021118	2021123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_020532	TGA	2	6	2021188	2021193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_020532	TTG	2	6	2021220	2021225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020532	T	6	6	2021229	2021234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_020532	CTCAT	2	10	2021244	2021253	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11581	NC_020532	T	7	7	2021257	2021263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_020532	TGT	2	6	2021322	2021327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_020532	CTT	2	6	2022008	2022013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_020532	AAC	2	6	2022015	2022020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_020532	GTT	3	9	2022047	2022055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_020532	ATTT	2	8	2022100	2022107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_020532	CTTT	2	8	2022108	2022115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11588	NC_020532	CCT	2	6	2022149	2022154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11589	NC_020532	TGTT	2	8	2022162	2022169	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_020532	TTA	2	6	2022184	2022189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_020532	TTG	2	6	2022198	2022203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_020532	CCA	2	6	2022209	2022214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_020532	GAA	2	6	2022223	2022228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020532	A	6	6	2022289	2022294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020532	T	6	6	2022311	2022316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_020532	T	6	6	2022318	2022323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_020532	ATTT	2	8	2022324	2022331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_020532	TTAA	2	8	2022357	2022364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020532	AAACT	2	10	2022403	2022412	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11600	NC_020532	ACC	2	6	2022473	2022478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11601	NC_020532	TCAT	2	8	2022501	2022508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11602	NC_020532	A	6	6	2022632	2022637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_020532	TTAAA	2	10	2022677	2022686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020532	ATTT	2	8	2022707	2022714	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_020532	TAGT	2	8	2022749	2022756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_020532	AATTT	2	10	2024452	2024461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020532	TAT	2	6	2024464	2024469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_020532	TCT	2	6	2024488	2024493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_020532	TTG	2	6	2024547	2024552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_020532	ACACG	2	10	2024555	2024564	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11611	NC_020532	CTT	2	6	2024570	2024575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_020532	CAT	2	6	2024600	2024605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_020532	GTT	2	6	2024692	2024697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020532	TGTTCT	2	12	2024698	2024709	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11615	NC_020532	T	6	6	2024709	2024714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_020532	AAT	2	6	2024718	2024723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_020532	TCC	2	6	2024757	2024762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11618	NC_020532	A	6	6	2024765	2024770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_020532	ACAT	2	8	2024805	2024812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11620	NC_020532	TAA	2	6	2024816	2024821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_020532	TTAA	2	8	2024855	2024862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_020532	ATAAA	2	10	2024888	2024897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_020532	GGA	2	6	2024914	2024919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_020532	A	6	6	2025672	2025677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_020532	CA	3	6	2025683	2025688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11626	NC_020532	TAA	2	6	2026946	2026951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_020532	AATATT	2	12	2026993	2027004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_020532	AAG	2	6	2027081	2027086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_020532	AAT	2	6	2027091	2027096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_020532	AT	3	6	2027728	2027733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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