MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_020532	CTA	2	6	1890057	1890062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_020532	TTGA	2	8	1890070	1890077	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_020532	TTA	2	6	1890122	1890127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_020532	CCCT	2	8	1891606	1891613	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10505	NC_020532	CTT	2	6	1891697	1891702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_020532	A	6	6	1891720	1891725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_020532	TAT	2	6	1891731	1891736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_020532	ATCA	2	8	1891762	1891769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10509	NC_020532	A	6	6	1891769	1891774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_020532	CTA	2	6	1891778	1891783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_020532	AT	3	6	1891819	1891824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_020532	TCA	2	6	1891840	1891845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_020532	TCA	2	6	1892944	1892949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_020532	TAT	2	6	1892950	1892955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_020532	TAC	2	6	1893075	1893080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_020532	TAA	2	6	1893098	1893103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_020532	TAA	2	6	1893106	1893111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_020532	AGAT	2	8	1893145	1893152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_020532	AT	3	6	1893201	1893206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_020532	AT	3	6	1893227	1893232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_020532	ATA	2	6	1893241	1893246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_020532	ATCATT	2	12	1893249	1893260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10523	NC_020532	A	7	7	1893272	1893278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_020532	TCA	2	6	1893321	1893326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_020532	TTC	2	6	1893383	1893388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_020532	TGG	2	6	1893397	1893402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_020532	T	7	7	1893421	1893427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_020532	TA	3	6	1894864	1894869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_020532	CAC	2	6	1894872	1894877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10530	NC_020532	TGG	2	6	1894881	1894886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_020532	TGTAT	2	10	1894902	1894911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_020532	AG	3	6	1894912	1894917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_020532	GTTAT	2	10	1894956	1894965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_020532	GGT	2	6	1894988	1894993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_020532	CG	3	6	1895039	1895044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10536	NC_020532	A	6	6	1895080	1895085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_020532	GGAA	2	8	1895145	1895152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_020532	ACT	2	6	1895170	1895175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_020532	AGGA	2	8	1895232	1895239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_020532	ATT	3	9	1895269	1895277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_020532	GGAA	2	8	1895323	1895330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_020532	ACT	2	6	1895348	1895353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_020532	GGC	2	6	1895370	1895375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_020532	GCC	2	6	1895434	1895439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10545	NC_020532	TAA	3	9	1895518	1895526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_020532	GGC	2	6	1895528	1895533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_020532	CAC	2	6	1895589	1895594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10548	NC_020532	GCC	2	6	1895596	1895601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10549	NC_020532	ATA	2	6	1895684	1895689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_020532	G	6	6	1895696	1895701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_020532	CCG	2	6	1895742	1895747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_020532	ATA	2	6	1895934	1895939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_020532	ATG	2	6	1895948	1895953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_020532	CAGG	2	8	1895994	1896001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10555	NC_020532	ATTAA	2	10	1896029	1896038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_020532	ACC	2	6	1896068	1896073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10557	NC_020532	CGA	2	6	1896093	1896098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_020532	ATA	2	6	1896123	1896128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_020532	A	6	6	1896128	1896133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_020532	GGA	2	6	1896141	1896146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_020532	TCC	2	6	1896224	1896229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10562	NC_020532	ATT	2	6	1896230	1896235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_020532	ATTA	2	8	1896250	1896257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_020532	CAGG	2	8	1896310	1896317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10565	NC_020532	GGA	2	6	1896355	1896360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_020532	TCC	2	6	1896438	1896443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10567	NC_020532	TAA	2	6	1896545	1896550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_020532	TA	3	6	1896630	1896635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_020532	ATA	2	6	1896644	1896649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_020532	TGG	2	6	1896650	1896655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_020532	CCT	2	6	1896680	1896685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10572	NC_020532	ATA	2	6	1896726	1896731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_020532	TCAC	2	8	1896953	1896960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10574	NC_020532	AGA	2	6	1897023	1897028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_020532	ACT	2	6	1897081	1897086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10576	NC_020532	TGG	2	6	1897353	1897358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_020532	CCG	2	6	1897376	1897381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10578	NC_020532	CCT	2	6	1897533	1897538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10579	NC_020532	AGTA	2	8	1897589	1897596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_020532	ATTT	2	8	1897620	1897627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_020532	TCGA	2	8	1897639	1897646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10582	NC_020532	TCA	2	6	1897701	1897706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_020532	G	6	6	1897751	1897756	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_020532	CA	3	6	1897792	1897797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10585	NC_020532	CTC	2	6	1897878	1897883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10586	NC_020532	ACG	2	6	1897901	1897906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10587	NC_020532	ACG	2	6	1897927	1897932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_020532	ACC	2	6	1898122	1898127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10589	NC_020532	ATGA	2	8	1898204	1898211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_020532	AGG	2	6	1898258	1898263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_020532	CAC	2	6	1898303	1898308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10592	NC_020532	GTG	2	6	1898314	1898319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_020532	GTA	2	6	1898346	1898351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_020532	CCA	2	6	1898354	1898359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10595	NC_020532	CCTA	2	8	1898398	1898405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10596	NC_020532	TC	3	6	1898518	1898523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10597	NC_020532	GCC	2	6	1898615	1898620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10598	NC_020532	CTC	2	6	1898663	1898668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_020532	TCGC	2	8	1898852	1898859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10600	NC_020532	TCTA	2	8	1898918	1898925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10601	NC_020532	TCT	2	6	1898972	1898977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_020532	CAATC	2	10	1899045	1899054	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10603	NC_020532	C	6	6	1899080	1899085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10604	NC_020532	GGT	2	6	1899105	1899110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_020532	ATG	2	6	1899425	1899430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_020532	GCT	2	6	1899431	1899436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_020532	AT	3	6	1899490	1899495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_020532	TGG	2	6	1899510	1899515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_020532	AATT	2	8	1899575	1899582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_020532	AAT	2	6	1899651	1899656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_020532	GA	3	6	1899689	1899694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_020532	TCGGT	2	10	1899766	1899775	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10613	NC_020532	ACT	2	6	1899971	1899976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_020532	AG	3	6	1900066	1900071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_020532	TCC	2	6	1900092	1900097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10616	NC_020532	CGT	2	6	1900125	1900130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10617	NC_020532	AG	3	6	1900147	1900152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_020532	ACA	2	6	1900153	1900158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_020532	ATT	2	6	1900173	1900178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_020532	CTT	2	6	1900181	1900186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_020532	GAT	2	6	1900202	1900207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_020532	GTC	2	6	1900217	1900222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_020532	CAA	2	6	1900256	1900261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_020532	TTG	2	6	1900268	1900273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_020532	TCGC	2	8	1900292	1900299	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10626	NC_020532	CTA	2	6	1900302	1900307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10627	NC_020532	TCC	2	6	1900331	1900336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10628	NC_020532	CTTA	2	8	1900454	1900461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10630	NC_020532	TAA	2	6	1900537	1900542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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