MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020532	T	6	6	1833903	1833908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_020532	AT	3	6	1833950	1833955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_020532	CTAT	2	8	1833979	1833986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10004	NC_020532	T	6	6	1834667	1834672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020532	GGC	2	6	1834780	1834785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_020532	ATC	2	6	1834801	1834806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_020532	TAT	2	6	1834818	1834823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_020532	CTTTT	2	10	1834824	1834833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10009	NC_020532	ATA	2	6	1834843	1834848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_020532	CTT	2	6	1834853	1834858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_020532	TTC	2	6	1834950	1834955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_020532	ATTTC	2	10	1835053	1835062	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10013	NC_020532	TTC	2	6	1835120	1835125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_020532	GAT	2	6	1835171	1835176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_020532	ATA	2	6	1835177	1835182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_020532	TC	3	6	1835196	1835201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_020532	AG	3	6	1835220	1835225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_020532	CAT	2	6	1835258	1835263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_020532	TCA	2	6	1835272	1835277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_020532	T	7	7	1835295	1835301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_020532	A	6	6	1835488	1835493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_020532	TGA	2	6	1835514	1835519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_020532	ATA	3	9	1835594	1835602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_020532	TAAT	2	8	1835651	1835658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_020532	TGT	2	6	1835666	1835671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_020532	ATT	2	6	1836253	1836258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_020532	TGA	2	6	1836286	1836291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_020532	GTTTT	2	10	1836312	1836321	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_020532	GA	3	6	1836331	1836336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_020532	ATG	2	6	1836341	1836346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_020532	ATT	2	6	1836403	1836408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_020532	ATT	2	6	1836418	1836423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_020532	A	7	7	1836536	1836542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_020532	AT	3	6	1836574	1836579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_020532	TAAT	2	8	1836610	1836617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_020532	TTAAA	2	10	1836950	1836959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_020532	TCG	2	6	1836973	1836978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_020532	CTT	2	6	1836979	1836984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_020532	CT	3	6	1837033	1837038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_020532	TAG	2	6	1837060	1837065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_020532	CTGA	2	8	1837067	1837074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_020532	TTCATT	2	12	1837113	1837124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10043	NC_020532	TTA	2	6	1837135	1837140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_020532	CTT	2	6	1837196	1837201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_020532	AGA	2	6	1837226	1837231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_020532	TA	3	6	1837239	1837244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_020532	T	6	6	1837248	1837253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_020532	TGT	2	6	1837255	1837260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_020532	TTC	2	6	1837280	1837285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_020532	ATG	2	6	1839603	1839608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_020532	GTT	2	6	1839616	1839621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_020532	CATA	2	8	1839626	1839633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10053	NC_020532	CAA	2	6	1839646	1839651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_020532	AATC	2	8	1839665	1839672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10055	NC_020532	AAT	2	6	1839697	1839702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_020532	AT	3	6	1839706	1839711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_020532	TAA	2	6	1839712	1839717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_020532	GTTA	2	8	1839720	1839727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_020532	CTC	2	6	1840496	1840501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_020532	AGGTT	2	10	1840522	1840531	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_020532	T	6	6	1840544	1840549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_020532	AATA	2	8	1840561	1840568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_020532	TTG	2	6	1840590	1840595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_020532	TGT	2	6	1840600	1840605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_020532	ATGG	2	8	1840633	1840640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_020532	T	7	7	1841409	1841415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_020532	ATT	2	6	1841447	1841452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_020532	A	6	6	1843077	1843082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_020532	GAAT	2	8	1843093	1843100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_020532	TGA	2	6	1843101	1843106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_020532	CCT	2	6	1843824	1843829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_020532	ATTT	2	8	1843835	1843842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_020532	TA	3	6	1843874	1843879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_020532	TAAA	2	8	1843885	1843892	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_020532	ATTA	2	8	1843896	1843903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_020532	ATTA	2	8	1843907	1843914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_020532	TTA	2	6	1843920	1843925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_020532	TTA	2	6	1843931	1843936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_020532	AAT	2	6	1843937	1843942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_020532	ATTT	2	8	1843960	1843967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_020532	ATT	2	6	1844016	1844021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_020532	ATTA	2	8	1844034	1844041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_020532	AT	3	6	1844087	1844092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_020532	TAT	2	6	1844135	1844140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_020532	ATT	2	6	1844158	1844163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_020532	TAT	2	6	1844179	1844184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_020532	TCAA	2	8	1844201	1844208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10088	NC_020532	ATGT	2	8	1844215	1844222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_020532	ATT	2	6	1844256	1844261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_020532	GAT	2	6	1844265	1844270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_020532	T	7	7	1844283	1844289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_020532	AGT	2	6	1844339	1844344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_020532	GTT	2	6	1844385	1844390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_020532	ATA	2	6	1844394	1844399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_020532	T	6	6	1844433	1844438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_020532	ATT	2	6	1844501	1844506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_020532	ATTA	2	8	1844524	1844531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_020532	TCA	2	6	1844582	1844587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_020532	ACA	2	6	1844635	1844640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_020532	A	6	6	1844651	1844656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_020532	T	6	6	1844665	1844670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_020532	ATAG	2	8	1844676	1844683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_020532	A	7	7	1844720	1844726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_020532	A	7	7	1844757	1844763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_020532	TAA	2	6	1845393	1845398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_020532	ACC	2	6	1845416	1845421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_020532	ATA	2	6	1845428	1845433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_020532	A	7	7	1845471	1845477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_020532	A	6	6	1845513	1845518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_020532	GCTT	2	8	1845540	1845547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10111	NC_020532	GAC	2	6	1845549	1845554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_020532	GTC	2	6	1845567	1845572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_020532	TA	3	6	1845586	1845591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_020532	ATTCAA	2	12	1845638	1845649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10115	NC_020532	TAAA	2	8	1845676	1845683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_020532	TTAA	2	8	1845692	1845699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_020532	CTG	2	6	1845729	1845734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_020532	ATT	2	6	1845747	1845752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_020532	TCC	2	6	1845779	1845784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_020532	TTA	2	6	1845858	1845863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_020532	ATA	3	9	1845900	1845908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_020532	ACA	2	6	1846059	1846064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_020532	AT	3	6	1846090	1846095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_020532	ATT	2	6	1846111	1846116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_020532	AAT	2	6	1846117	1846122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_020532	TAAA	2	8	1846140	1846147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_020532	TAA	2	6	1846149	1846154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_020532	AAT	2	6	1846201	1846206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_020532	TAC	2	6	1846238	1846243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10131	NC_020532	ATT	2	6	1846335	1846340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10389	NC_020532	TCG	2	6	1876255	1876260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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