MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_020532	ATA	2	6	1635786	1635791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_020532	TAA	2	6	1635793	1635798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_020532	ATTT	2	8	1635987	1635994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_020532	T	6	6	1636013	1636018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_020532	TATCT	2	10	1636049	1636058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9006	NC_020532	CTC	2	6	1636144	1636149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9007	NC_020532	T	6	6	1636178	1636183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_020532	CAA	2	6	1636225	1636230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_020532	CTT	2	6	1636231	1636236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_020532	CTT	2	6	1636267	1636272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_020532	ACTT	2	8	1636339	1636346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9012	NC_020532	CCT	2	6	1636365	1636370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_020532	TA	3	6	1636377	1636382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_020532	TA	3	6	1636385	1636390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_020532	AGG	2	6	1636397	1636402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_020532	TATAG	2	10	1636436	1636445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_020532	TGT	2	6	1636523	1636528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_020532	TC	3	6	1636542	1636547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_020532	TC	3	6	1636554	1636559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9020	NC_020532	GTT	2	6	1636573	1636578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_020532	GGT	2	6	1636587	1636592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_020532	CAA	2	6	1636609	1636614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_020532	CTG	2	6	1636651	1636656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_020532	TTC	2	6	1636661	1636666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_020532	ATT	2	6	1636772	1636777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_020532	TTC	2	6	1636778	1636783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_020532	T	6	6	1636820	1636825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_020532	ATC	2	6	1636836	1636841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_020532	TAG	2	6	1636864	1636869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_020532	T	6	6	1636925	1636930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_020532	AATCA	2	10	1638278	1638287	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9032	NC_020532	CTA	2	6	1638314	1638319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_020532	AGTTTT	2	12	1638336	1638347	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_020532	ATT	2	6	1639247	1639252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_020532	TTA	2	6	1639278	1639283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_020532	TTA	2	6	1639309	1639314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_020532	TA	3	6	1639413	1639418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_020532	GGTG	2	8	1639421	1639428	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_020532	AAC	2	6	1639540	1639545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_020532	ATG	2	6	1639561	1639566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_020532	AATTAA	2	12	1639581	1639592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_020532	T	6	6	1639622	1639627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_020532	TATTT	2	10	1642700	1642709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_020532	TAAAAC	2	12	1642721	1642732	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9045	NC_020532	TA	3	6	1642733	1642738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_020532	A	6	6	1642852	1642857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_020532	ATC	2	6	1642872	1642877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_020532	TAAA	2	8	1642900	1642907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_020532	ACGT	2	8	1642925	1642932	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9050	NC_020532	CTT	2	6	1642962	1642967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_020532	TA	3	6	1642978	1642983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_020532	ACT	2	6	1642985	1642990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9053	NC_020532	TTAG	2	8	1643033	1643040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_020532	ACT	2	6	1643112	1643117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_020532	ATAA	2	8	1644037	1644044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_020532	CAT	2	6	1644057	1644062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_020532	TG	3	6	1644081	1644086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_020532	CAT	2	6	1644132	1644137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_020532	T	8	8	1644205	1644212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_020532	AG	3	6	1644223	1644228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_020532	CATT	2	8	1644256	1644263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9062	NC_020532	TAT	2	6	1644286	1644291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_020532	AAT	2	6	1644303	1644308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_020532	TAA	2	6	1644377	1644382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_020532	T	6	6	1644392	1644397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_020532	ATT	2	6	1644404	1644409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_020532	CTT	2	6	1644433	1644438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_020532	ACT	2	6	1644453	1644458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_020532	TTA	2	6	1646688	1646693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_020532	TTG	2	6	1646723	1646728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_020532	CGTC	2	8	1646756	1646763	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_020532	GTC	2	6	1646783	1646788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9073	NC_020532	T	6	6	1646887	1646892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_020532	TAC	2	6	1646910	1646915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9076	NC_020532	TTA	2	6	1646940	1646945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_020532	ATC	2	6	1646960	1646965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9078	NC_020532	TAAA	2	8	1646978	1646985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_020532	A	6	6	1646983	1646988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_020532	T	6	6	1647023	1647028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_020532	TGA	2	6	1647055	1647060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9083	NC_020532	TCC	2	6	1647618	1647623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9084	NC_020532	TAAA	2	8	1649953	1649960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_020532	AAT	2	6	1649974	1649979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_020532	T	6	6	1649999	1650004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_020532	AATG	2	8	1650008	1650015	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_020532	TTAT	2	8	1650023	1650030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9090	NC_020532	TTAAAT	2	12	1650041	1650052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9093	NC_020532	TCTT	2	8	1652454	1652461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9094	NC_020532	TTA	2	6	1652469	1652474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_020532	AT	3	6	1652523	1652528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_020532	AATTTA	2	12	1652531	1652542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_020532	ATT	2	6	1652546	1652551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_020532	T	7	7	1652567	1652573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_020532	TAC	2	6	1652598	1652603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9101	NC_020532	GTT	2	6	1652741	1652746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_020532	ACC	2	6	1652776	1652781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_020532	TTA	2	6	1652813	1652818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9105	NC_020532	ATC	2	6	1652861	1652866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9106	NC_020532	TA	4	8	1652896	1652903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_020532	CTC	2	6	1652931	1652936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9109	NC_020532	CATACT	2	12	1656785	1656796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_020532	AATT	2	8	1656797	1656804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_020532	TCT	2	6	1656849	1656854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9113	NC_020532	TTC	2	6	1656905	1656910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_020532	TGA	2	6	1656924	1656929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_020532	TAGA	2	8	1657090	1657097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_020532	CAT	2	6	1657114	1657119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_020532	TCT	2	6	1657194	1657199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_020532	TAAA	2	8	1657205	1657212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_020532	CAT	2	6	1657235	1657240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9121	NC_020532	AAT	2	6	1658580	1658585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_020532	TA	3	6	1658606	1658611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_020532	AAT	2	6	1658617	1658622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_020532	TTTAC	2	10	1658651	1658660	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9125	NC_020532	T	7	7	1658698	1658704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_020532	T	6	6	1658803	1658808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_020532	ATA	2	6	1658824	1658829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_020532	A	6	6	1658853	1658858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_020532	AGA	2	6	1658863	1658868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_020532	ATT	2	6	1658895	1658900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9132	NC_020532	AAC	2	6	1658956	1658961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9259	NC_020532	CATA	2	8	1679039	1679046	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9261	NC_020532	ATT	2	6	1681680	1681685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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