MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_020532	ATT	2	6	1534130	1534135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_020532	ATG	2	6	1534193	1534198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_020532	TAT	2	6	1534199	1534204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_020532	ATT	2	6	1534241	1534246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_020532	T	7	7	1534257	1534263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_020532	A	7	7	1534291	1534297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_020532	CATC	2	8	1534300	1534307	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8508	NC_020532	ACAAGA	2	12	1534309	1534320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8509	NC_020532	TCC	2	6	1537626	1537631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8510	NC_020532	CTAA	2	8	1539067	1539074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8511	NC_020532	AT	4	8	1539077	1539084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_020532	TTA	2	6	1539096	1539101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_020532	ATTA	2	8	1539121	1539128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_020532	ATAA	2	8	1539166	1539173	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_020532	AC	3	6	1539193	1539198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8516	NC_020532	CTTGA	2	10	1540921	1540930	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8517	NC_020532	TCA	2	6	1540933	1540938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_020532	AAT	2	6	1540959	1540964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_020532	ATC	2	6	1540974	1540979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_020532	CTT	2	6	1541000	1541005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_020532	TAA	2	6	1541198	1541203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_020532	AAT	2	6	1541310	1541315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_020532	T	6	6	1541343	1541348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_020532	ATTT	2	8	1541386	1541393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_020532	ACT	2	6	1541415	1541420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_020532	TATC	2	8	1541454	1541461	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8527	NC_020532	AT	3	6	1541530	1541535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_020532	TAA	2	6	1541539	1541544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_020532	ATT	2	6	1541553	1541558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_020532	TAA	2	6	1541564	1541569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_020532	TTAA	2	8	1541591	1541598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_020532	T	6	6	1541653	1541658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_020532	AACA	2	8	1541710	1541717	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8534	NC_020532	TTG	2	6	1541761	1541766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_020532	AT	3	6	1541774	1541779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_020532	CTT	3	9	1542683	1542691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_020532	TTA	2	6	1542692	1542697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_020532	T	7	7	1542709	1542715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_020532	T	6	6	1542721	1542726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_020532	GCT	2	6	1542742	1542747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_020532	CAT	2	6	1542840	1542845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_020532	TTC	2	6	1542846	1542851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_020532	ATTTT	2	10	1544219	1544228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_020532	T	7	7	1544225	1544231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_020532	ATC	3	9	1544267	1544275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_020532	TTGTT	2	10	1544282	1544291	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_020532	TTCA	2	8	1544303	1544310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8548	NC_020532	ATA	2	6	1544367	1544372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_020532	TAA	2	6	1544384	1544389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_020532	TAA	2	6	1544512	1544517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_020532	TTTA	2	8	1544642	1544649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_020532	TTTG	2	8	1544767	1544774	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_020532	TA	4	8	1544821	1544828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_020532	TCT	2	6	1544834	1544839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_020532	AAT	2	6	1545012	1545017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_020532	CCT	2	6	1545041	1545046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8557	NC_020532	GTTT	2	8	1546885	1546892	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_020532	TTCAA	2	10	1546926	1546935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8559	NC_020532	TAA	2	6	1546981	1546986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_020532	TTAAA	2	10	1546996	1547005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_020532	TATT	2	8	1547016	1547023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_020532	TAT	2	6	1547103	1547108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_020532	CAA	2	6	1547119	1547124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_020532	AT	3	6	1547137	1547142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_020532	T	6	6	1547162	1547167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_020532	ATT	2	6	1547204	1547209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_020532	TAAAAA	2	12	1547211	1547222	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_020532	TCC	2	6	1547905	1547910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_020532	TTA	2	6	1548987	1548992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_020532	CCT	2	6	1548993	1548998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8571	NC_020532	ATA	2	6	1549036	1549041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_020532	ATA	2	6	1549044	1549049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_020532	A	6	6	1549055	1549060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_020532	TAATA	2	10	1549690	1549699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_020532	TTA	2	6	1549713	1549718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8579	NC_020532	TAT	2	6	1549820	1549825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_020532	TTC	2	6	1549826	1549831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8582	NC_020532	A	7	7	1549906	1549912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_020532	T	6	6	1549951	1549956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8589	NC_020532	ATT	2	6	1550997	1551002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8592	NC_020532	TGACTA	2	12	1551116	1551127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8593	NC_020532	GCTA	2	8	1551234	1551241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8594	NC_020532	GGC	2	6	1551297	1551302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8597	NC_020532	TAA	2	6	1551366	1551371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_020532	ATC	2	6	1551389	1551394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8600	NC_020532	ATA	2	6	1551480	1551485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_020532	A	6	6	1551531	1551536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_020532	AAT	2	6	1551560	1551565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_020532	TTA	2	6	1551581	1551586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_020532	AAT	3	9	1551674	1551682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_020532	TAT	2	6	1555711	1555716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8609	NC_020532	TTATAG	2	12	1556344	1556355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_020532	TA	3	6	1556369	1556374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_020532	AAAT	2	8	1556425	1556432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_020532	TA	3	6	1556477	1556482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_020532	TAA	2	6	1556492	1556497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8616	NC_020532	TTC	2	6	1557070	1557075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8622	NC_020532	CTAT	2	8	1557218	1557225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8623	NC_020532	TTC	2	6	1557265	1557270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8626	NC_020532	T	6	6	1557350	1557355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_020532	AAT	2	6	1557365	1557370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8629	NC_020532	TAT	2	6	1557427	1557432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_020532	AT	3	6	1557480	1557485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_020532	AATTC	2	10	1557517	1557526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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