MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020532	TTAT	2	8	1414718	1414725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_020532	AGG	2	6	1414761	1414766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_020532	TAC	2	6	1415488	1415493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_020532	ATTT	2	8	1415544	1415551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_020532	CGT	2	6	1415552	1415557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_020532	TTG	2	6	1415606	1415611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_020532	ATT	2	6	1415633	1415638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_020532	A	6	6	1415689	1415694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_020532	ACT	2	6	1415725	1415730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_020532	GAT	2	6	1415782	1415787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_020532	T	7	7	1415787	1415793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_020532	TAC	2	6	1415810	1415815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_020532	ATC	2	6	1415826	1415831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_020532	T	6	6	1415883	1415888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_020532	TAT	2	6	1415960	1415965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_020532	AAAT	2	8	1415971	1415978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_020532	TGC	2	6	1415984	1415989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_020532	AGA	2	6	1416035	1416040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_020532	AGC	2	6	1416043	1416048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_020532	TATACA	2	12	1416051	1416062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8021	NC_020532	TAT	2	6	1416157	1416162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_020532	TAT	2	6	1416271	1416276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020532	GA	3	6	1416293	1416298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_020532	ACAAA	2	10	1416299	1416308	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8025	NC_020532	ATTA	2	8	1416344	1416351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_020532	AATA	2	8	1416357	1416364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_020532	TGATG	2	10	1416379	1416388	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_020532	CTC	2	6	1416399	1416404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_020532	TTG	2	6	1448320	1448325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_020532	TGT	2	6	1448335	1448340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_020532	CATTC	2	10	1448385	1448394	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8032	NC_020532	ATTT	2	8	1448485	1448492	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_020532	ATA	2	6	1448505	1448510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_020532	AT	3	6	1448518	1448523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_020532	TAA	2	6	1448554	1448559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_020532	TAAA	2	8	1448563	1448570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_020532	TAA	2	6	1448585	1448590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_020532	A	6	6	1448589	1448594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_020532	AAT	2	6	1448616	1448621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_020532	ATT	2	6	1452723	1452728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_020532	ATT	2	6	1453887	1453892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_020532	ATTA	3	12	1453923	1453934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_020532	TAA	2	6	1453958	1453963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_020532	AT	3	6	1453971	1453976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_020532	TATTCT	2	12	1453977	1453988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8046	NC_020532	TATT	2	8	1454016	1454023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_020532	TAAT	2	8	1454074	1454081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_020532	T	6	6	1454090	1454095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_020532	TAA	2	6	1454100	1454105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_020532	ATTT	2	8	1454139	1454146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_020532	TATC	2	8	1454191	1454198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_020532	TTAT	2	8	1454209	1454216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020532	CTT	2	6	1455215	1455220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_020532	GTTC	2	8	1458680	1458687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8055	NC_020532	TGCT	2	8	1458697	1458704	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_020532	TAT	2	6	1458770	1458775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_020532	GCT	2	6	1458793	1458798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_020532	AAT	2	6	1458813	1458818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_020532	TTC	2	6	1458824	1458829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_020532	ATC	2	6	1458871	1458876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_020532	AAAT	2	8	1458893	1458900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_020532	CA	3	6	1458917	1458922	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_020532	GGGA	2	8	1458956	1458963	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_020532	TC	3	6	1460353	1460358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_020532	TAA	2	6	1460381	1460386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_020532	T	6	6	1460426	1460431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_020532	A	6	6	1460444	1460449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_020532	AAG	2	6	1460465	1460470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_020532	CTT	2	6	1460480	1460485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_020532	T	6	6	1460506	1460511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_020532	TCA	2	6	1460539	1460544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_020532	TCA	2	6	1460562	1460567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_020532	CAT	2	6	1460602	1460607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_020532	T	6	6	1460636	1460641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_020532	T	6	6	1460755	1460760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_020532	A	6	6	1460767	1460772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_020532	AAC	2	6	1460801	1460806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_020532	T	7	7	1460833	1460839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_020532	CTC	2	6	1460853	1460858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8080	NC_020532	TAT	2	6	1460876	1460881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_020532	ATT	2	6	1460894	1460899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_020532	T	6	6	1462118	1462123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_020532	CAA	2	6	1462133	1462138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_020532	A	6	6	1462238	1462243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_020532	CAT	2	6	1462250	1462255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8087	NC_020532	TGTTC	2	10	1462295	1462304	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8088	NC_020532	TCA	2	6	1462313	1462318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_020532	GT	3	6	1462382	1462387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_020532	TCA	2	6	1462581	1462586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_020532	ATC	2	6	1462602	1462607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_020532	TG	3	6	1462614	1462619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_020532	TA	3	6	1462636	1462641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_020532	ATT	2	6	1462688	1462693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_020532	ATT	2	6	1462724	1462729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_020532	ATT	2	6	1462779	1462784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_020532	TGT	3	9	1462797	1462805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_020532	ATT	2	6	1462806	1462811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_020532	GAA	2	6	1462813	1462818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_020532	TTC	2	6	1462866	1462871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_020532	T	6	6	1462878	1462883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_020532	TCT	2	6	1462897	1462902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_020532	ATT	2	6	1462920	1462925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020532	T	6	6	1462937	1462942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_020532	AAT	2	6	1462953	1462958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_020532	CTT	2	6	1462979	1462984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_020532	T	6	6	1463009	1463014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_020532	T	6	6	1463069	1463074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_020532	AT	3	6	1463674	1463679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_020532	GTT	2	6	1463761	1463766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_020532	TAA	2	6	1463821	1463826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_020532	TTG	3	9	1463909	1463917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_020532	TGT	2	6	1463947	1463952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_020532	CAT	2	6	1463980	1463985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_020532	CCT	2	6	1463997	1464002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_020532	T	6	6	1464006	1464011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_020532	TA	3	6	1464053	1464058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_020532	T	6	6	1464073	1464078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_020532	TA	3	6	1464121	1464126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_020532	TGT	2	6	1464148	1464153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_020532	TAA	2	6	1464178	1464183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_020532	CTG	2	6	1464207	1464212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_020532	AAC	2	6	1464216	1464221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_020532	TACTTG	2	12	1464225	1464236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8125	NC_020532	AAAAAT	2	12	1464241	1464252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_020532	AATT	2	8	1464331	1464338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_020532	TG	3	6	1464344	1464349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_020532	TAT	2	6	1464376	1464381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_020532	ATT	2	6	1464385	1464390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_020532	TCT	2	6	1465160	1465165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_020532	TAA	2	6	1465183	1465188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8401	NC_020532	CTA	2	6	1516339	1516344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8402	NC_020532	ATT	2	6	1516364	1516369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8403	NC_020532	TA	3	6	1516999	1517004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8404	NC_020532	TAA	2	6	1517974	1517979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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