MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_020532	GTAAA	2	10	1238989	1238998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_020532	A	6	6	1239030	1239035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_020532	TTG	2	6	1239055	1239060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_020532	ATG	2	6	1239064	1239069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_020532	ATA	2	6	1239076	1239081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_020532	ATTA	2	8	1239089	1239096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_020532	T	6	6	1241489	1241494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_020532	TGG	2	6	1241556	1241561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_020532	TAT	2	6	1241599	1241604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_020532	TTA	2	6	1241668	1241673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_020532	AAT	2	6	1241692	1241697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_020532	A	6	6	1241718	1241723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_020532	TAAAGA	2	12	1241743	1241754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_020532	GAA	2	6	1241803	1241808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_020532	ATC	2	6	1241822	1241827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_020532	ATTACA	2	12	1241861	1241872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7017	NC_020532	TGT	2	6	1241875	1241880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_020532	AAG	2	6	1241937	1241942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_020532	TAT	2	6	1242019	1242024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_020532	ATCA	2	8	1242048	1242055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7021	NC_020532	TAA	2	6	1242067	1242072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_020532	ACAA	2	8	1242099	1242106	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7023	NC_020532	GATA	2	8	1242107	1242114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_020532	T	7	7	1242220	1242226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_020532	AT	3	6	1242257	1242262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_020532	A	6	6	1242266	1242271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_020532	TA	3	6	1244201	1244206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_020532	TAG	2	6	1244232	1244237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_020532	AGG	2	6	1244287	1244292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_020532	TACT	2	8	1244393	1244400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7031	NC_020532	AC	3	6	1244434	1244439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_020532	A	6	6	1244440	1244445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_020532	ACC	2	6	1244447	1244452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7034	NC_020532	CGT	2	6	1244458	1244463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_020532	ATT	2	6	1244466	1244471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_020532	GTC	2	6	1244483	1244488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_020532	ACT	2	6	1244504	1244509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_020532	GTA	2	6	1244513	1244518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_020532	AATT	2	8	1244540	1244547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_020532	CGT	2	6	1244563	1244568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_020532	A	6	6	1244630	1244635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_020532	TAT	2	6	1244658	1244663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_020532	AAT	2	6	1244685	1244690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_020532	GAT	2	6	1244710	1244715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_020532	TAA	2	6	1244732	1244737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_020532	T	6	6	1244762	1244767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_020532	A	6	6	1244768	1244773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_020532	ATA	2	6	1244825	1244830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_020532	CT	3	6	1244844	1244849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_020532	T	7	7	1244849	1244855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_020532	ATA	2	6	1244891	1244896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_020532	ATGAT	2	10	1244898	1244907	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_020532	AG	3	6	1244924	1244929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_020532	GAC	2	6	1247052	1247057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_020532	T	7	7	1247075	1247081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_020532	T	6	6	1247088	1247093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_020532	TGT	2	6	1247116	1247121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_020532	TAT	2	6	1247143	1247148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_020532	TGTA	2	8	1247173	1247180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_020532	T	6	6	1247207	1247212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_020532	ATG	2	6	1249026	1249031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_020532	GAT	2	6	1249085	1249090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_020532	TA	4	8	1249152	1249159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_020532	CGT	2	6	1249164	1249169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7066	NC_020532	AGG	2	6	1252303	1252308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_020532	TA	3	6	1252310	1252315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_020532	TGAT	2	8	1255607	1255614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_020532	AGG	2	6	1256510	1256515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7070	NC_020532	CGGT	2	8	1256530	1256537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7071	NC_020532	AAT	2	6	1256634	1256639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_020532	TTA	2	6	1256680	1256685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_020532	GTA	2	6	1256700	1256705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_020532	AATT	2	8	1256722	1256729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_020532	TCA	2	6	1256735	1256740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_020532	AAT	3	9	1256793	1256801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_020532	ATT	2	6	1256843	1256848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_020532	TAA	2	6	1256872	1256877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_020532	AAAT	2	8	1256919	1256926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_020532	TTTCAT	2	12	1257546	1257557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7081	NC_020532	T	7	7	1257569	1257575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_020532	AT	3	6	1257617	1257622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_020532	T	6	6	1257643	1257648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_020532	TGT	2	6	1257658	1257663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7087	NC_020532	TATTT	2	10	1258993	1259002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_020532	GATAA	2	10	1259022	1259031	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_020532	AGG	2	6	1259054	1259059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7091	NC_020532	AAT	2	6	1260193	1260198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_020532	T	6	6	1260240	1260245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_020532	TATT	2	8	1260250	1260257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_020532	TAG	2	6	1260305	1260310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7096	NC_020532	TA	4	8	1260395	1260402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_020532	AGG	2	6	1260451	1260456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_020532	T	6	6	1262056	1262061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_020532	TAA	2	6	1262101	1262106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_020532	AAG	2	6	1262156	1262161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_020532	TAA	2	6	1262172	1262177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_020532	TATATT	2	12	1262202	1262213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_020532	A	6	6	1262251	1262256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_020532	GAAGA	2	10	1262257	1262266	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_020532	TCT	2	6	1262276	1262281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_020532	ATTA	2	8	1262292	1262299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_020532	ATTT	2	8	1262302	1262309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_020532	TTG	2	6	1262382	1262387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_020532	TTG	2	6	1262391	1262396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_020532	TC	3	6	1262401	1262406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_020532	CTTT	2	8	1262441	1262448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7112	NC_020532	TATT	2	8	1262537	1262544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_020532	TATT	2	8	1262554	1262561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_020532	TC	3	6	1262608	1262613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_020532	GAA	2	6	1262621	1262626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_020532	AAT	2	6	1262628	1262633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_020532	GTAA	2	8	1263513	1263520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_020532	GGT	2	6	1263590	1263595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_020532	T	6	6	1266330	1266335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_020532	A	6	6	1266344	1266349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_020532	AAT	2	6	1266393	1266398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_020532	ACAATG	2	12	1266413	1266424	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7123	NC_020532	AAT	2	6	1266453	1266458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_020532	ATGA	2	8	1266517	1266524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_020532	TTTAAT	2	12	1266528	1266539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_020532	TGG	2	6	1266560	1266565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_020532	TAT	2	6	1266582	1266587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_020532	AAGTT	2	10	1266593	1266602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_020532	ATG	2	6	1266650	1266655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_020532	ATT	2	6	1266754	1266759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_020532	TAA	2	6	1268344	1268349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7133	NC_020532	CAA	2	6	1268420	1268425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7401	NC_020532	CTATA	2	10	1303914	1303923	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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7403	NC_020532	AAT	2	6	1303943	1303948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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