MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16204

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020532	TCC	2	6	964676	964681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_020532	TTA	2	6	964699	964704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_020532	T	6	6	964745	964750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020532	AATGA	2	10	964901	964910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020532	AT	3	6	964943	964948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020532	A	7	7	966615	966621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020532	ACAATA	2	12	966686	966697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5508	NC_020532	ACT	2	6	966700	966705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_020532	T	6	6	966715	966720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_020532	TAG	2	6	967487	967492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_020532	TATAA	2	10	967526	967535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_020532	ATTTA	2	10	967559	967568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_020532	ATT	2	6	967601	967606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_020532	ATA	2	6	967638	967643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_020532	AGG	2	6	967660	967665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_020532	ATA	2	6	968188	968193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_020532	GTA	2	6	968206	968211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_020532	TAA	2	6	968221	968226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_020532	TAA	2	6	968251	968256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020532	TTTA	2	8	970668	970675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_020532	TAA	2	6	970896	970901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_020532	ATA	2	6	970934	970939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_020532	TAG	2	6	970959	970964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_020532	TAG	2	6	970983	970988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_020532	TTA	2	6	971012	971017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_020532	CAA	2	6	971022	971027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_020532	TAA	2	6	971036	971041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_020532	TGA	2	6	972565	972570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_020532	TTTA	2	8	972588	972595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_020532	GAA	2	6	972674	972679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_020532	TTGT	2	8	972707	972714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_020532	AGA	2	6	972721	972726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_020532	AAT	2	6	974394	974399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_020532	GAA	2	6	974409	974414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_020532	AAAT	2	8	974415	974422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_020532	ATG	2	6	974451	974456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_020532	TATT	2	8	974600	974607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_020532	ACTTA	2	10	974630	974639	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5539	NC_020532	TTTA	2	8	974640	974647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_020532	GAA	2	6	975545	975550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_020532	T	6	6	975606	975611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_020532	TA	3	6	975622	975627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_020532	T	6	6	979436	979441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_020532	TAA	2	6	981043	981048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_020532	ATTA	2	8	981049	981056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_020532	CAA	2	6	981063	981068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_020532	AGA	2	6	981088	981093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020532	TCAT	2	8	981150	981157	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_020532	TA	4	8	981158	981165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020532	A	6	6	981173	981178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020532	TA	3	6	981189	981194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020532	AACGGA	2	12	981209	981220	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5553	NC_020532	CGC	2	6	981237	981242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_020532	ATT	2	6	981411	981416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_020532	A	7	7	981452	981458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020532	TTA	2	6	982103	982108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_020532	TAA	2	6	982160	982165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_020532	TTA	2	6	982183	982188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_020532	AAT	2	6	982206	982211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_020532	TTA	2	6	982265	982270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_020532	AAAG	2	8	982277	982284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_020532	AATAC	2	10	982301	982310	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5563	NC_020532	AATT	2	8	982370	982377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_020532	AGC	2	6	982455	982460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_020532	TC	3	6	983588	983593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_020532	TA	4	8	983603	983610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_020532	TTAT	2	8	983619	983626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_020532	TA	3	6	983653	983658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_020532	TAT	2	6	983698	983703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_020532	AGG	2	6	983768	983773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_020532	TTG	2	6	983806	983811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_020532	ATGG	2	8	983817	983824	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_020532	A	6	6	983842	983847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_020532	TTG	2	6	983866	983871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_020532	A	6	6	983914	983919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_020532	ATCA	2	8	983925	983932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_020532	TTG	2	6	983947	983952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_020532	AAG	2	6	983956	983961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_020532	TAT	2	6	984654	984659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_020532	TTA	2	6	984687	984692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_020532	TTA	2	6	984717	984722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_020532	TGG	2	6	984773	984778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_020532	G	6	6	984792	984797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_020532	TAG	3	9	984914	984922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_020532	AAT	2	6	984924	984929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_020532	A	6	6	984943	984948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_020532	CAT	2	6	984953	984958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_020532	ATG	2	6	984978	984983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_020532	GTC	2	6	985049	985054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_020532	TTTA	2	8	985082	985089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_020532	TTA	2	6	985101	985106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020532	GTA	2	6	985210	985215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020532	AT	3	6	985257	985262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_020532	A	6	6	985312	985317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_020532	CAT	2	6	985322	985327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_020532	ATG	2	6	985347	985352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_020532	GTC	2	6	985418	985423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_020532	AAT	2	6	985448	985453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_020532	AAAT	2	8	985504	985511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_020532	TAT	2	6	985522	985527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_020532	AGA	2	6	985590	985595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_020532	TATAT	2	10	985612	985621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_020532	CAG	2	6	985647	985652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_020532	AGG	2	6	985678	985683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_020532	AGTA	2	8	985706	985713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_020532	TTA	3	9	985723	985731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_020532	AAAAGC	2	12	985807	985818	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5608	NC_020532	CTA	2	6	985824	985829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_020532	TAT	2	6	985856	985861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_020532	TTA	2	6	985867	985872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_020532	A	6	6	985879	985884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_020532	AAC	2	6	985897	985902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_020532	ATT	2	6	987904	987909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_020532	CAT	2	6	987950	987955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_020532	CAA	2	6	988025	988030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_020532	TAG	2	6	988105	988110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_020532	CAAT	2	8	988867	988874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_020532	AAC	2	6	988940	988945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_020532	A	7	7	988955	988961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_020532	ATA	3	9	988967	988975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_020532	TAA	2	6	988990	988995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_020532	A	6	6	989025	989030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_020532	AAC	2	6	989045	989050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_020532	GAA	2	6	989071	989076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_020532	ATA	3	9	989117	989125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_020532	AAT	2	6	989152	989157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_020532	CAT	2	6	989233	989238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_020532	AGA	2	6	989262	989267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_020532	AAATT	2	10	989273	989282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_020532	TAA	2	6	989318	989323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_020532	ATA	2	6	989347	989352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_020532	TAA	2	6	989387	989392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_020532	GA	3	6	989426	989431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_020532	A	6	6	989502	989507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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