MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_020529	ATC	2	6	2736083	2736088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_020529	AGGT	2	8	2736171	2736178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_020529	ATG	2	6	2737309	2737314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_020529	TTAA	2	8	2738354	2738361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_020529	T	6	6	2738416	2738421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_020529	CATA	2	8	2738427	2738434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16007	NC_020529	TAAAT	2	10	2738469	2738478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_020529	CAAA	2	8	2739153	2739160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16009	NC_020529	GAT	2	6	2739206	2739211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_020529	ATG	2	6	2739232	2739237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_020529	ATC	2	6	2740051	2740056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_020529	GCC	2	6	2740143	2740148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16013	NC_020529	T	7	7	2740158	2740164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_020529	T	6	6	2740185	2740190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_020529	TAC	2	6	2740217	2740222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_020529	ATCTG	2	10	2740336	2740345	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16017	NC_020529	CTA	2	6	2740365	2740370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_020529	ATA	2	6	2740377	2740382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_020529	GTT	2	6	2740431	2740436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_020529	AAC	2	6	2740458	2740463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_020529	TTA	2	6	2740995	2741000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_020529	AAC	2	6	2741007	2741012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_020529	T	6	6	2741024	2741029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_020529	T	6	6	2741048	2741053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_020529	TAA	2	6	2741059	2741064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_020529	TTC	2	6	2741081	2741086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_020529	AAT	2	6	2741101	2741106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_020529	TTAAT	2	10	2741123	2741132	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_020529	ATT	2	6	2741143	2741148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_020529	AGAA	2	8	2741204	2741211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_020529	A	7	7	2742881	2742887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_020529	ATTT	2	8	2742932	2742939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_020529	CA	3	6	2742982	2742987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16034	NC_020529	CCT	2	6	2743972	2743977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16035	NC_020529	TAA	2	6	2744038	2744043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_020529	ACCA	2	8	2744090	2744097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16037	NC_020529	AAT	2	6	2744119	2744124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_020529	ACA	2	6	2744164	2744169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_020529	GGAT	2	8	2744174	2744181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_020529	AT	4	8	2744801	2744808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_020529	TAA	2	6	2744811	2744816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_020529	AAT	2	6	2744821	2744826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_020529	ATA	2	6	2744832	2744837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_020529	TTG	2	6	2745968	2745973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_020529	CTT	2	6	2745995	2746000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_020529	AGT	2	6	2746019	2746024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_020529	AGG	2	6	2746166	2746171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_020529	CTTA	2	8	2747004	2747011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16049	NC_020529	GTAG	2	8	2747014	2747021	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_020529	T	6	6	2747028	2747033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_020529	ACA	2	6	2747047	2747052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_020529	CTT	2	6	2747085	2747090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_020529	CAAT	2	8	2747625	2747632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16054	NC_020529	A	6	6	2747666	2747671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_020529	TAT	2	6	2747674	2747679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_020529	AAT	2	6	2747682	2747687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_020529	CAT	2	6	2747716	2747721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_020529	CTCA	2	8	2747773	2747780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_020529	CTA	2	6	2747786	2747791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_020529	TTCA	2	8	2747820	2747827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16061	NC_020529	CTA	2	6	2747852	2747857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_020529	ATT	2	6	2747866	2747871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_020529	GATTTT	2	12	2750562	2750573	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_020529	GA	3	6	2750612	2750617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_020529	ACA	2	6	2750736	2750741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_020529	TTA	2	6	2750766	2750771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_020529	TTA	2	6	2750780	2750785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_020529	CGT	2	6	2750793	2750798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_020529	GAA	2	6	2750799	2750804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_020529	CAA	2	6	2750872	2750877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_020529	GCT	2	6	2750890	2750895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16073	NC_020529	T	6	6	2750980	2750985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_020529	ATTT	2	8	2751041	2751048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_020529	A	6	6	2751051	2751056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_020529	TAA	2	6	2751099	2751104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_020529	T	6	6	2751149	2751154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_020529	AGA	2	6	2751330	2751335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_020529	CAA	2	6	2751455	2751460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16081	NC_020529	T	7	7	2751481	2751487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_020529	ATA	2	6	2751500	2751505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_020529	GAT	3	9	2751517	2751525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16084	NC_020529	ACA	2	6	2752197	2752202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_020529	AGAC	2	8	2752225	2752232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16086	NC_020529	TTA	2	6	2752282	2752287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_020529	ATG	2	6	2752288	2752293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_020529	T	6	6	2752402	2752407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_020529	ATAC	2	8	2752434	2752441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16090	NC_020529	TGA	2	6	2752447	2752452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_020529	CAA	2	6	2752468	2752473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_020529	CAT	2	6	2752508	2752513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16094	NC_020529	TAA	2	6	2752700	2752705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_020529	C	6	6	2752716	2752721	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16096	NC_020529	A	6	6	2752724	2752729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_020529	ATG	2	6	2752749	2752754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_020529	TAA	2	6	2752779	2752784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_020529	CAA	2	6	2752861	2752866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_020529	AG	3	6	2752913	2752918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16101	NC_020529	GAT	2	6	2753009	2753014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16102	NC_020529	ATA	2	6	2753029	2753034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_020529	AAGA	2	8	2753040	2753047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_020529	TAG	2	6	2753057	2753062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16107	NC_020529	AAT	2	6	2753100	2753105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_020529	ACC	2	6	2753127	2753132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16109	NC_020529	GAA	2	6	2753144	2753149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_020529	TAAT	2	8	2753190	2753197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_020529	CA	3	6	2753218	2753223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16112	NC_020529	ATTT	2	8	2753375	2753382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_020529	CGT	2	6	2753383	2753388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16115	NC_020529	ACT	2	6	2753453	2753458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_020529	ATATAA	2	12	2753514	2753525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_020529	A	7	7	2753548	2753554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_020529	TCA	2	6	2753597	2753602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_020529	CCT	2	6	2757109	2757114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16120	NC_020529	CTT	2	6	2757134	2757139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_020529	CCT	2	6	2758558	2758563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16122	NC_020529	TTA	2	6	2758593	2758598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_020529	TTCC	2	8	2758665	2758672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_020529	CTTA	2	8	2758684	2758691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16125	NC_020529	TTA	2	6	2758698	2758703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_020529	GTC	2	6	2758755	2758760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_020529	GCTG	2	8	2758770	2758777	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16128	NC_020529	AAT	2	6	2758790	2758795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_020529	AT	3	6	2758807	2758812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_020529	T	6	6	2758883	2758888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16131	NC_020529	TAT	2	6	2758927	2758932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16132	NC_020529	ACA	2	6	2758944	2758949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16133	NC_020529	T	6	6	2758976	2758981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16134	NC_020529	AT	3	6	2758982	2758987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16135	NC_020529	TTAT	2	8	2759046	2759053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16136	NC_020529	TATT	2	8	2759108	2759115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_020529	A	8	8	2759129	2759136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16138	NC_020529	TGA	2	6	2759143	2759148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16139	NC_020529	ACG	3	9	2759186	2759194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16140	NC_020529	GC	3	6	2759195	2759200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16141	NC_020529	T	6	6	2759217	2759222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16142	NC_020529	ACT	2	6	2759436	2759441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16143	NC_020529	TAC	2	6	2759483	2759488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16144	NC_020529	T	7	7	2759496	2759502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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