MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_020529	T	7	7	2540878	2540884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_020529	TA	3	6	2540904	2540909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_020529	AC	3	6	2541729	2541734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15004	NC_020529	AT	3	6	2541764	2541769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_020529	TTTAT	2	10	2542950	2542959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_020529	ATT	2	6	2543001	2543006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_020529	AT	3	6	2543023	2543028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_020529	TGA	2	6	2543036	2543041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_020529	TGA	2	6	2543097	2543102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_020529	AT	3	6	2544023	2544028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_020529	AT	3	6	2544100	2544105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_020529	A	6	6	2544165	2544170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_020529	TAA	2	6	2544198	2544203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_020529	A	6	6	2545609	2545614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_020529	TAT	2	6	2545641	2545646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_020529	CCA	2	6	2545662	2545667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15017	NC_020529	CGT	2	6	2545674	2545679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15018	NC_020529	CAAA	2	8	2545696	2545703	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15019	NC_020529	A	7	7	2545701	2545707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_020529	AT	3	6	2545739	2545744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_020529	ATTA	2	8	2546444	2546451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_020529	TAT	2	6	2546479	2546484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_020529	AT	3	6	2546496	2546501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_020529	TAA	2	6	2546554	2546559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_020529	ATT	2	6	2546573	2546578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_020529	ATA	2	6	2547086	2547091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_020529	TAACA	2	10	2547119	2547128	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15028	NC_020529	T	6	6	2547178	2547183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_020529	TAG	2	6	2547245	2547250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_020529	ATA	2	6	2547291	2547296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_020529	ATG	2	6	2547347	2547352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_020529	GAT	2	6	2547364	2547369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_020529	ATC	2	6	2547385	2547390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_020529	AAG	2	6	2547487	2547492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_020529	ATCT	2	8	2547494	2547501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15036	NC_020529	CAGA	2	8	2547515	2547522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15037	NC_020529	CTT	2	6	2547525	2547530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_020529	T	6	6	2547529	2547534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_020529	CT	4	8	2550209	2550216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15040	NC_020529	TTTAT	2	10	2550220	2550229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_020529	ATCAA	2	10	2550286	2550295	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15042	NC_020529	ACT	2	6	2550354	2550359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_020529	TGT	2	6	2550362	2550367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_020529	TG	3	6	2550413	2550418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_020529	T	6	6	2550423	2550428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_020529	T	6	6	2550435	2550440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_020529	TATT	2	8	2550503	2550510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_020529	TTTTGT	2	12	2550511	2550522	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_020529	TTA	2	6	2550562	2550567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_020529	AT	3	6	2550571	2550576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_020529	ATT	2	6	2550603	2550608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_020529	ATG	2	6	2550627	2550632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_020529	T	7	7	2550657	2550663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_020529	TCTA	2	8	2550780	2550787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15055	NC_020529	CTT	2	6	2550814	2550819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_020529	ATT	2	6	2550828	2550833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_020529	TA	3	6	2550835	2550840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15058	NC_020529	ATG	2	6	2550856	2550861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_020529	TCA	2	6	2550893	2550898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_020529	CATT	2	8	2550970	2550977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15061	NC_020529	TATC	2	8	2550995	2551002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15062	NC_020529	GAT	2	6	2551023	2551028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_020529	T	7	7	2551028	2551034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_020529	AAC	2	6	2552107	2552112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15065	NC_020529	T	6	6	2552140	2552145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_020529	GTC	2	6	2553120	2553125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15068	NC_020529	TGA	2	6	2553135	2553140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_020529	CTA	2	6	2553144	2553149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_020529	TTA	2	6	2553175	2553180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_020529	ATG	2	6	2553208	2553213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_020529	TCAT	2	8	2553281	2553288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15073	NC_020529	GAT	2	6	2553297	2553302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_020529	AC	3	6	2553496	2553501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15075	NC_020529	TGA	2	6	2553545	2553550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15080	NC_020529	CTGT	2	8	2553713	2553720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15081	NC_020529	CTTG	2	8	2553780	2553787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15082	NC_020529	TTGA	2	8	2553882	2553889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_020529	TTG	2	6	2553893	2553898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_020529	TAA	2	6	2553917	2553922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_020529	TTTC	2	8	2554010	2554017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15086	NC_020529	TGT	2	6	2554038	2554043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_020529	ATTT	2	8	2554092	2554099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_020529	TTA	2	6	2554100	2554105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_020529	TTA	2	6	2554137	2554142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_020529	TTA	2	6	2554258	2554263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_020529	TCA	2	6	2554264	2554269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15093	NC_020529	CAT	2	6	2554284	2554289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15095	NC_020529	TAT	2	6	2556629	2556634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_020529	CAA	2	6	2556656	2556661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15097	NC_020529	ATC	2	6	2556677	2556682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_020529	ATAA	2	8	2556704	2556711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_020529	TTG	2	6	2556732	2556737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_020529	TTCAA	2	10	2556762	2556771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15101	NC_020529	ATGTTT	2	12	2559292	2559303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_020529	T	6	6	2559312	2559317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_020529	TAA	2	6	2559360	2559365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_020529	TA	3	6	2559382	2559387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_020529	ATA	2	6	2559416	2559421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_020529	GAA	2	6	2559439	2559444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_020529	TAA	2	6	2559460	2559465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_020529	TCT	2	6	2559479	2559484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_020529	TAAA	2	8	2559520	2559527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_020529	CAA	2	6	2559540	2559545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15111	NC_020529	ATG	2	6	2559608	2559613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_020529	GTA	3	9	2559624	2559632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_020529	ATT	2	6	2559638	2559643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_020529	TAT	2	6	2559703	2559708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_020529	T	7	7	2559739	2559745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_020529	CT	3	6	2559777	2559782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15117	NC_020529	A	7	7	2559803	2559809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_020529	TCA	2	6	2559813	2559818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_020529	ATG	2	6	2559836	2559841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_020529	AAT	2	6	2559849	2559854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_020529	TTA	2	6	2559862	2559867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_020529	CTT	2	6	2560798	2560803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_020529	TAT	2	6	2560877	2560882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_020529	GAGGT	2	10	2560907	2560916	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_020529	TGA	2	6	2560953	2560958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_020529	CAT	2	6	2561157	2561162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15127	NC_020529	TTTC	2	8	2561236	2561243	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15128	NC_020529	CTTTT	2	10	2561262	2561271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15129	NC_020529	AATT	2	8	2561340	2561347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_020529	A	6	6	2561377	2561382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15132	NC_020529	TTG	2	6	2561439	2561444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15134	NC_020529	A	7	7	2561464	2561470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_020529	A	7	7	2561501	2561507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15254	NC_020529	TAGG	2	8	2582813	2582820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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15391	NC_020529	GAT	3	9	2607470	2607478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15392	NC_020529	ATT	2	6	2607518	2607523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15393	NC_020529	ATT	2	6	2607543	2607548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15394	NC_020529	ATT	2	6	2607554	2607559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15395	NC_020529	AT	3	6	2607573	2607578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15396	NC_020529	AAT	2	6	2607594	2607599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15399	NC_020529	ATTTT	2	10	2607750	2607759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15400	NC_020529	A	6	6	2607768	2607773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15401	NC_020529	TACT	2	8	2608747	2608754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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15421	NC_020529	GTCA	2	8	2611406	2611413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15422	NC_020529	A	6	6	2611413	2611418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15435	NC_020529	GAA	2	6	2611841	2611846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15436	NC_020529	AAG	2	6	2611851	2611856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15496	NC_020529	TGC	2	6	2623531	2623536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15497	NC_020529	CAAA	2	8	2623543	2623550	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15498	NC_020529	ATT	4	12	2623603	2623614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15499	NC_020529	AATC	2	8	2623668	2623675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15500	NC_020529	TAC	2	6	2623680	2623685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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