MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020529	AGG	2	6	2238691	2238696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_020529	A	6	6	2239672	2239677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_020529	AAT	2	6	2239754	2239759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_020529	AC	3	6	2239766	2239771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_020529	A	7	7	2239778	2239784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_020529	ATA	2	6	2239794	2239799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_020529	TA	3	6	2239813	2239818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_020529	ACG	2	6	2239854	2239859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_020529	GCT	2	6	2239861	2239866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_020529	T	6	6	2239878	2239883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_020529	AGTA	2	8	2239908	2239915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_020529	TAA	2	6	2239959	2239964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_020529	AGCTTG	2	12	2239989	2240000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13014	NC_020529	ACC	3	9	2240010	2240018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_020529	CAT	2	6	2240036	2240041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_020529	TGGT	2	8	2240070	2240077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_020529	TTA	2	6	2240128	2240133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_020529	ACG	2	6	2240187	2240192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_020529	TCC	2	6	2240230	2240235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13020	NC_020529	GTT	2	6	2240268	2240273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_020529	CCA	2	6	2240297	2240302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_020529	T	6	6	2240314	2240319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_020529	TTC	2	6	2240394	2240399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_020529	CAG	2	6	2240409	2240414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_020529	TGAT	2	8	2240415	2240422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_020529	ACC	2	6	2240428	2240433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_020529	GAT	2	6	2240436	2240441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_020529	GTA	2	6	2240452	2240457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_020529	TAA	2	6	2240505	2240510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_020529	GTGTG	2	10	2240536	2240545	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_020529	AGAT	2	8	2240571	2240578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_020529	TGA	2	6	2240587	2240592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_020529	ATA	2	6	2240678	2240683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_020529	TCC	2	6	2240688	2240693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_020529	A	6	6	2240695	2240700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_020529	GAT	2	6	2240744	2240749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_020529	ATTT	2	8	2240783	2240790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_020529	TGT	2	6	2240798	2240803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_020529	TA	3	6	2240815	2240820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_020529	TAA	2	6	2240879	2240884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_020529	CAT	2	6	2243308	2243313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_020529	TC	4	8	2244193	2244200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13043	NC_020529	TATC	2	8	2244215	2244222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13044	NC_020529	TA	3	6	2244273	2244278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_020529	GTT	2	6	2244317	2244322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_020529	AAC	2	6	2244324	2244329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_020529	CT	3	6	2244351	2244356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13048	NC_020529	TAA	2	6	2244376	2244381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_020529	GGT	2	6	2244405	2244410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_020529	ATA	2	6	2244427	2244432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_020529	TTCA	2	8	2244440	2244447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13052	NC_020529	A	6	6	2244500	2244505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_020529	A	6	6	2244568	2244573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_020529	GC	3	6	2244574	2244579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_020529	CAT	2	6	2244584	2244589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_020529	TTG	2	6	2244594	2244599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_020529	TTTA	2	8	2244617	2244624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_020529	TA	3	6	2244693	2244698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_020529	AGT	2	6	2244701	2244706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_020529	TA	3	6	2244716	2244721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_020529	CGA	2	6	2244767	2244772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_020529	ACC	2	6	2244799	2244804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_020529	AAT	2	6	2244839	2244844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_020529	ACG	2	6	2244916	2244921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_020529	T	6	6	2244937	2244942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_020529	CAA	2	6	2244963	2244968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_020529	CTT	2	6	2244978	2244983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_020529	TAA	3	9	2245017	2245025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_020529	CCT	2	6	2245103	2245108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_020529	TCC	2	6	2246064	2246069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_020529	TA	3	6	2246071	2246076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_020529	CAT	2	6	2246122	2246127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_020529	ACG	3	9	2246137	2246145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13074	NC_020529	TGG	2	6	2246149	2246154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_020529	TGC	2	6	2246332	2246337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_020529	T	6	6	2246350	2246355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_020529	TGA	2	6	2246383	2246388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_020529	TCA	2	6	2246411	2246416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_020529	GTT	2	6	2246434	2246439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_020529	TG	3	6	2246454	2246459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_020529	CCT	2	6	2246531	2246536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_020529	TAT	2	6	2246542	2246547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_020529	T	6	6	2246547	2246552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_020529	CG	3	6	2246590	2246595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_020529	T	6	6	2246606	2246611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_020529	ACG	2	6	2246631	2246636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_020529	ATG	2	6	2246654	2246659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_020529	AGTT	2	8	2246687	2246694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_020529	ACG	2	6	2246697	2246702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_020529	TCA	2	6	2246758	2246763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_020529	CTT	2	6	2246801	2246806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_020529	T	6	6	2246813	2246818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_020529	TA	4	8	2246842	2246849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_020529	CT	3	6	2246922	2246927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_020529	TTA	2	6	2246929	2246934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_020529	TTTG	2	8	2246943	2246950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_020529	CTTTAC	2	12	2246979	2246990	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_020529	TAT	2	6	2247061	2247066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_020529	ATT	2	6	2247076	2247081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_020529	TTC	2	6	2247097	2247102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_020529	ATTC	2	8	2247167	2247174	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13102	NC_020529	AATT	2	8	2247402	2247409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_020529	ATCT	2	8	2247429	2247436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_020529	CCT	2	6	2248142	2248147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_020529	CTG	3	9	2249485	2249493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_020529	AAC	2	6	2249579	2249584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13107	NC_020529	CTA	2	6	2249593	2249598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13108	NC_020529	TTA	2	6	2249634	2249639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_020529	ACG	2	6	2249705	2249710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_020529	AAT	2	6	2249712	2249717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_020529	ACC	2	6	2249726	2249731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13112	NC_020529	ACC	2	6	2249750	2249755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_020529	ATTTC	2	10	2249878	2249887	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13114	NC_020529	CCT	2	6	2249892	2249897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_020529	ATT	2	6	2249900	2249905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_020529	TCT	2	6	2249908	2249913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_020529	TTG	2	6	2249935	2249940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_020529	CAA	2	6	2249969	2249974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_020529	GAC	2	6	2250035	2250040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_020529	CCT	2	6	2250607	2250612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13121	NC_020529	TTAAA	2	10	2250613	2250622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_020529	TGC	2	6	2250642	2250647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_020529	TCC	2	6	2250684	2250689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13124	NC_020529	CAG	2	6	2250722	2250727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_020529	T	6	6	2250729	2250734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_020529	GTA	2	6	2250781	2250786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_020529	GAA	2	6	2250805	2250810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13128	NC_020529	TAT	2	6	2250833	2250838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_020529	AAT	2	6	2250843	2250848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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