MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_020529	TAAATG	2	12	2166257	2166268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_020529	GTG	2	6	2166320	2166325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_020529	ATT	2	6	2166456	2166461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_020529	AGT	2	6	2166495	2166500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_020529	GAA	3	9	2166577	2166585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_020529	ATCGT	2	10	2166593	2166602	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12507	NC_020529	AGA	2	6	2166618	2166623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_020529	GAG	2	6	2166640	2166645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_020529	TTTG	2	8	2167774	2167781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_020529	AAG	2	6	2167786	2167791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_020529	TAA	2	6	2167819	2167824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_020529	GTA	2	6	2167826	2167831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_020529	A	6	6	2167868	2167873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_020529	TATG	2	8	2167906	2167913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_020529	TAA	2	6	2167932	2167937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_020529	TCC	2	6	2175535	2175540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_020529	ATT	2	6	2175547	2175552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_020529	AGT	2	6	2175593	2175598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_020529	AATTAA	2	12	2175634	2175645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_020529	ATC	2	6	2175650	2175655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_020529	TA	3	6	2175658	2175663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_020529	ATT	2	6	2175744	2175749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_020529	A	7	7	2175761	2175767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_020529	TCC	2	6	2178937	2178942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_020529	ATA	2	6	2178958	2178963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_020529	AT	3	6	2179002	2179007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_020529	A	6	6	2179016	2179021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_020529	ACT	2	6	2179040	2179045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_020529	A	7	7	2179066	2179072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_020529	AAT	2	6	2180059	2180064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_020529	TTA	2	6	2180115	2180120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_020529	A	8	8	2180127	2180134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_020529	AGT	2	6	2180160	2180165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_020529	AT	3	6	2180316	2180321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_020529	TGG	2	6	2180325	2180330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_020529	G	6	6	2180332	2180337	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_020529	CCG	2	6	2180378	2180383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12538	NC_020529	TAA	2	6	2180426	2180431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_020529	TGG	2	6	2180438	2180443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_020529	CCG	2	6	2180461	2180466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_020529	AAT	2	6	2180516	2180521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_020529	CCG	2	6	2180550	2180555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_020529	CCT	2	6	2180772	2180777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12544	NC_020529	AGTA	2	8	2180828	2180835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_020529	ATTT	2	8	2180859	2180866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_020529	TCGA	2	8	2180878	2180885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12547	NC_020529	TCA	2	6	2180940	2180945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12548	NC_020529	G	6	6	2180990	2180995	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_020529	CA	3	6	2181031	2181036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12550	NC_020529	CTC	2	6	2181117	2181122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12551	NC_020529	ACG	2	6	2181140	2181145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_020529	ACG	2	6	2181166	2181171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_020529	ACC	2	6	2181361	2181366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12554	NC_020529	ATGA	2	8	2181443	2181450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_020529	AGG	2	6	2181497	2181502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_020529	CAC	2	6	2181542	2181547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_020529	GTG	2	6	2181553	2181558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12558	NC_020529	GTA	2	6	2181585	2181590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_020529	CCA	2	6	2181593	2181598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_020529	CCTA	2	8	2181637	2181644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12561	NC_020529	TC	3	6	2181757	2181762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12562	NC_020529	GCC	2	6	2181854	2181859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12563	NC_020529	CTC	2	6	2181902	2181907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12564	NC_020529	TCGC	2	8	2182091	2182098	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12565	NC_020529	TCTA	2	8	2182157	2182164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12566	NC_020529	TCT	2	6	2182211	2182216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_020529	CAATC	2	10	2182284	2182293	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12568	NC_020529	C	6	6	2182319	2182324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12569	NC_020529	GGT	2	6	2182344	2182349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_020529	ATG	2	6	2182664	2182669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_020529	GCT	2	6	2182670	2182675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12572	NC_020529	AT	3	6	2182729	2182734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_020529	TGG	2	6	2182749	2182754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_020529	AATT	2	8	2182814	2182821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_020529	AAT	2	6	2182890	2182895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_020529	GA	3	6	2182928	2182933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12577	NC_020529	TCGGT	2	10	2183005	2183014	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12578	NC_020529	ACT	2	6	2183210	2183215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12579	NC_020529	AG	3	6	2183305	2183310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_020529	TCC	2	6	2183331	2183336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12581	NC_020529	CGT	2	6	2183364	2183369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_020529	AG	3	6	2183386	2183391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_020529	ACA	2	6	2183392	2183397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_020529	ATT	2	6	2183412	2183417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_020529	CTT	2	6	2183420	2183425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12586	NC_020529	GAT	2	6	2183441	2183446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_020529	GTC	2	6	2183456	2183461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12588	NC_020529	CAA	2	6	2183495	2183500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12589	NC_020529	TTG	2	6	2183507	2183512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_020529	TCGC	2	8	2183531	2183538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12591	NC_020529	CTA	2	6	2183541	2183546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_020529	TCC	2	6	2183570	2183575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12593	NC_020529	CTTA	2	8	2183693	2183700	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12594	NC_020529	TCG	2	6	2183718	2183723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_020529	TAA	2	6	2183776	2183781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_020529	CCA	2	6	2183796	2183801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12597	NC_020529	TTA	2	6	2183861	2183866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_020529	ATT	2	6	2183897	2183902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_020529	TACT	2	8	2183969	2183976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12600	NC_020529	A	6	6	2184037	2184042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_020529	CTTT	2	8	2184107	2184114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12602	NC_020529	A	6	6	2184163	2184168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_020529	TAAA	2	8	2184180	2184187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_020529	TCT	2	6	2184226	2184231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12605	NC_020529	GAA	2	6	2184232	2184237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_020529	AT	3	6	2184248	2184253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_020529	AGG	2	6	2184262	2184267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_020529	GTG	2	6	2184389	2184394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_020529	GT	3	6	2184404	2184409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_020529	AAC	2	6	2184508	2184513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_020529	GT	3	6	2184573	2184578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_020529	ATG	2	6	2184598	2184603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_020529	TCC	2	6	2184624	2184629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12614	NC_020529	ATG	2	6	2184668	2184673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_020529	CACGA	2	10	2184723	2184732	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12616	NC_020529	GAC	2	6	2184736	2184741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_020529	CAC	2	6	2184749	2184754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_020529	TTC	2	6	2184826	2184831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_020529	GCA	2	6	2184945	2184950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_020529	TCC	2	6	2185090	2185095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12621	NC_020529	A	6	6	2185211	2185216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_020529	CG	3	6	2185224	2185229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12623	NC_020529	AAT	2	6	2185240	2185245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_020529	GCT	2	6	2185280	2185285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_020529	TTAC	2	8	2185338	2185345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12626	NC_020529	TTC	2	6	2185353	2185358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12627	NC_020529	TAA	2	6	2185361	2185366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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