MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_020529	GTCAT	2	10	2095462	2095471	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12002	NC_020529	ATG	2	6	2095517	2095522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_020529	ATG	2	6	2095617	2095622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_020529	ATG	2	6	2095717	2095722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_020529	TAT	2	6	2095742	2095747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_020529	ATGCC	2	10	2095765	2095774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12007	NC_020529	TGT	2	6	2095792	2095797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_020529	TAT	2	6	2095815	2095820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_020529	TGA	2	6	2095900	2095905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_020529	GAA	2	6	2095933	2095938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12011	NC_020529	TTA	2	6	2095950	2095955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_020529	ATT	2	6	2095987	2095992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12013	NC_020529	CAG	2	6	2096004	2096009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_020529	ATC	2	6	2096032	2096037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_020529	CTG	2	6	2096041	2096046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12016	NC_020529	GC	3	6	2096109	2096114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12017	NC_020529	ATT	2	6	2096154	2096159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_020529	TAA	2	6	2098474	2098479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_020529	CAC	2	6	2099326	2099331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12020	NC_020529	A	6	6	2100066	2100071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_020529	TCC	2	6	2100072	2100077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12022	NC_020529	TAAA	2	8	2100079	2100086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12023	NC_020529	A	7	7	2100084	2100090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_020529	AGT	2	6	2100107	2100112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_020529	ACT	2	6	2100153	2100158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12026	NC_020529	TAG	2	6	2100234	2100239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_020529	ATT	2	6	2100293	2100298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_020529	TAT	3	9	2100311	2100319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12029	NC_020529	ATA	2	6	2100326	2100331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_020529	A	6	6	2100360	2100365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_020529	AT	3	6	2100392	2100397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_020529	TA	3	6	2100416	2100421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_020529	TCC	2	6	2101155	2101160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12034	NC_020529	ACT	2	6	2101196	2101201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12035	NC_020529	ACA	2	6	2101229	2101234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12036	NC_020529	A	7	7	2101239	2101245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_020529	T	6	6	2101254	2101259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_020529	T	6	6	2101334	2101339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12039	NC_020529	T	6	6	2101348	2101353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_020529	GAC	2	6	2101408	2101413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_020529	ACA	2	6	2101418	2101423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12042	NC_020529	A	6	6	2101480	2101485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_020529	GGAT	2	8	2101490	2101497	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_020529	TAA	2	6	2101542	2101547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_020529	GA	3	6	2101594	2101599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_020529	ATT	2	6	2101605	2101610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_020529	GT	3	6	2101665	2101670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_020529	ACCA	2	8	2101716	2101723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12049	NC_020529	TCC	2	6	2101864	2101869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12050	NC_020529	TTTA	2	8	2101917	2101924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_020529	GT	3	6	2101932	2101937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_020529	CCT	2	6	2101944	2101949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12053	NC_020529	TA	3	6	2101999	2102004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_020529	A	6	6	2102566	2102571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_020529	T	8	8	2102610	2102617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_020529	TTTTA	2	10	2102619	2102628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_020529	CAAG	2	8	2102661	2102668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12058	NC_020529	TAC	2	6	2102759	2102764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12060	NC_020529	TAAT	2	8	2102872	2102879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_020529	CA	3	6	2102954	2102959	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12062	NC_020529	CTT	2	6	2102968	2102973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_020529	ACT	2	6	2102982	2102987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12064	NC_020529	TAA	2	6	2102996	2103001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_020529	CTGT	2	8	2103008	2103015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12066	NC_020529	TCC	2	6	2103070	2103075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12067	NC_020529	TCC	2	6	2104367	2104372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12068	NC_020529	ATT	2	6	2104412	2104417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_020529	ATT	2	6	2104425	2104430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_020529	TTATT	2	10	2104471	2104480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12071	NC_020529	TAA	2	6	2104543	2104548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_020529	CAA	2	6	2104554	2104559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12073	NC_020529	AC	3	6	2104567	2104572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12074	NC_020529	T	6	6	2104594	2104599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_020529	A	6	6	2104600	2104605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_020529	ATCTA	2	10	2104609	2104618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12077	NC_020529	ATTG	2	8	2104619	2104626	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_020529	AATACA	2	12	2104642	2104653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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12080	NC_020529	AAT	2	6	2104753	2104758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12081	NC_020529	TA	3	6	2104806	2104811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12082	NC_020529	A	6	6	2104856	2104861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12083	NC_020529	A	6	6	2104875	2104880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12084	NC_020529	GTG	2	6	2104901	2104906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12085	NC_020529	A	6	6	2104944	2104949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12089	NC_020529	C	6	6	2105180	2105185	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12090	NC_020529	A	6	6	2105220	2105225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_020529	TTTA	2	8	2105258	2105265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12092	NC_020529	CT	4	8	2105301	2105308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12093	NC_020529	GTC	2	6	2105341	2105346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12095	NC_020529	AT	3	6	2105486	2105491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12096	NC_020529	AGC	2	6	2105536	2105541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12098	NC_020529	AAC	2	6	2105596	2105601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_020529	TCC	2	6	2105678	2105683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12100	NC_020529	TCC	2	6	2107110	2107115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12101	NC_020529	CAC	2	6	2107996	2108001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12102	NC_020529	CTC	2	6	2109538	2109543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12103	NC_020529	AAT	2	6	2110637	2110642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_020529	TA	3	6	2110652	2110657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_020529	A	7	7	2110659	2110665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12106	NC_020529	CGA	2	6	2110666	2110671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12107	NC_020529	TAA	2	6	2110728	2110733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_020529	TA	3	6	2110750	2110755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_020529	CAT	2	6	2110758	2110763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_020529	TAC	2	6	2110836	2110841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_020529	GAT	2	6	2110845	2110850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_020529	TGC	3	9	2111001	2111009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_020529	TAATT	2	10	2111021	2111030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12114	NC_020529	TCC	2	6	2111031	2111036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12115	NC_020529	TA	3	6	2111045	2111050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12116	NC_020529	ATT	2	6	2111051	2111056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_020529	ATTT	2	8	2111811	2111818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12119	NC_020529	AAT	2	6	2111873	2111878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12120	NC_020529	GAT	2	6	2111885	2111890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12122	NC_020529	AAT	2	6	2111930	2111935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_020529	TTTAGC	2	12	2111990	2112001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12124	NC_020529	GT	3	6	2112077	2112082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_020529	TCC	2	6	2112095	2112100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12126	NC_020529	ATT	3	9	2112105	2112113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12127	NC_020529	ATA	2	6	2112122	2112127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12128	NC_020529	TGAA	2	8	2112129	2112136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12130	NC_020529	ATCA	2	8	2112191	2112198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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12372	NC_020529	CAAT	2	8	2147059	2147066	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12373	NC_020529	AAGC	2	8	2147107	2147114	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12393	NC_020529	ATT	2	6	2149952	2149957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12394	NC_020529	GAA	2	6	2149960	2149965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12395	NC_020529	GAT	2	6	2150026	2150031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12398	NC_020529	TTC	2	6	2150915	2150920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12401	NC_020529	TAA	2	6	2151922	2151927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12402	NC_020529	TAT	2	6	2151936	2151941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12425	NC_020529	TA	3	6	2156199	2156204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12432	NC_020529	AAC	2	6	2156581	2156586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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