MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ST228 complete genome

Total Repeats: 16144

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020529	CTA	2	6	2020120	2020125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_020529	TCC	2	6	2020157	2020162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11503	NC_020529	T	6	6	2020171	2020176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_020529	AAT	2	6	2020236	2020241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_020529	TTC	2	6	2020372	2020377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_020529	TGG	2	6	2020402	2020407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_020529	CTTTC	2	10	2020432	2020441	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11508	NC_020529	TGT	2	6	2020450	2020455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_020529	CGA	2	6	2020492	2020497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_020529	TGT	2	6	2020544	2020549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_020529	CTA	2	6	2020573	2020578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_020529	TGA	2	6	2020640	2020645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_020529	GTT	2	6	2020651	2020656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_020529	TCC	2	6	2020680	2020685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_020529	A	6	6	2020688	2020693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_020529	ACC	2	6	2020775	2020780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11517	NC_020529	ACT	2	6	2020818	2020823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_020529	TGA	2	6	2020888	2020893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_020529	TTG	2	6	2020920	2020925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_020529	T	6	6	2020929	2020934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_020529	CTCAT	2	10	2020944	2020953	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11522	NC_020529	T	7	7	2020957	2020963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_020529	TGT	2	6	2021022	2021027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_020529	CTT	2	6	2021708	2021713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_020529	AAC	2	6	2021715	2021720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_020529	GTT	3	9	2021747	2021755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_020529	ATTT	2	8	2021800	2021807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_020529	CTTT	2	8	2021808	2021815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_020529	CCT	2	6	2021849	2021854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11530	NC_020529	TGTT	2	8	2021862	2021869	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_020529	TTA	2	6	2021884	2021889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_020529	TTG	2	6	2021898	2021903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_020529	CCA	2	6	2021909	2021914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_020529	GAA	2	6	2021923	2021928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_020529	A	6	6	2021989	2021994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_020529	T	6	6	2022011	2022016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_020529	T	6	6	2022018	2022023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_020529	ATTT	2	8	2022024	2022031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_020529	TTAA	2	8	2022057	2022064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_020529	AAACT	2	10	2022103	2022112	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11541	NC_020529	ACC	2	6	2022173	2022178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11542	NC_020529	TCAT	2	8	2022201	2022208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11543	NC_020529	A	6	6	2022332	2022337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_020529	TTAAA	2	10	2022377	2022386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_020529	ATTT	2	8	2022407	2022414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_020529	TAGT	2	8	2022449	2022456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_020529	AATTT	2	10	2024152	2024161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_020529	TAT	2	6	2024164	2024169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_020529	TCT	2	6	2024188	2024193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_020529	TTG	2	6	2024247	2024252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_020529	ACACG	2	10	2024255	2024264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11552	NC_020529	CTT	2	6	2024270	2024275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_020529	CAT	2	6	2024300	2024305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_020529	GTT	2	6	2024392	2024397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_020529	TGTTCT	2	12	2024398	2024409	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11556	NC_020529	T	6	6	2024409	2024414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_020529	AAT	2	6	2024418	2024423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_020529	TCC	2	6	2024457	2024462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_020529	A	6	6	2024465	2024470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_020529	ACAT	2	8	2024505	2024512	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11561	NC_020529	TAA	2	6	2024516	2024521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_020529	TTAA	2	8	2024555	2024562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_020529	ATAAA	2	10	2024588	2024597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_020529	GGA	2	6	2024614	2024619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_020529	A	6	6	2025372	2025377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_020529	CA	3	6	2025383	2025388	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_020529	TAA	2	6	2026646	2026651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_020529	AATATT	2	12	2026693	2026704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_020529	AAG	2	6	2026781	2026786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_020529	AAT	2	6	2026791	2026796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_020529	AT	3	6	2027428	2027433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_020529	GTA	2	6	2027482	2027487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_020529	GCT	2	6	2027505	2027510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_020529	ACT	2	6	2027665	2027670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_020529	T	6	6	2027722	2027727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_020529	TA	4	8	2027754	2027761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_020529	ATA	2	6	2028583	2028588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_020529	GA	3	6	2028622	2028627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_020529	T	7	7	2028649	2028655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_020529	ATA	2	6	2028656	2028661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_020529	ATGA	2	8	2028697	2028704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_020529	TTAA	2	8	2028710	2028717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_020529	T	6	6	2028727	2028732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_020529	AT	3	6	2028759	2028764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_020529	CTT	2	6	2028802	2028807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11587	NC_020529	TTA	3	9	2028856	2028864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_020529	T	6	6	2028884	2028889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_020529	TTA	2	6	2028909	2028914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_020529	A	7	7	2028921	2028927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_020529	TTTA	2	8	2028929	2028936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_020529	AAT	2	6	2028940	2028945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_020529	TGT	2	6	2028956	2028961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_020529	AAT	2	6	2028984	2028989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_020529	CTA	2	6	2029045	2029050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_020529	TTA	2	6	2029083	2029088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_020529	TAA	2	6	2029102	2029107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_020529	TAAT	2	8	2029154	2029161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_020529	T	6	6	2029173	2029178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_020529	TTG	2	6	2029226	2029231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_020529	TCCT	2	8	2029260	2029267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11602	NC_020529	TCA	2	6	2029301	2029306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_020529	ATTT	2	8	2029360	2029367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_020529	T	6	6	2029390	2029395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_020529	T	7	7	2029411	2029417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_020529	TATT	2	8	2029458	2029465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_020529	T	6	6	2030127	2030132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_020529	AATTA	2	10	2030141	2030150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_020529	GCA	2	6	2030188	2030193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_020529	TGA	2	6	2030201	2030206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_020529	GT	3	6	2030268	2030273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_020529	ATA	2	6	2032302	2032307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_020529	TTG	2	6	2032340	2032345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_020529	TAA	2	6	2032399	2032404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_020529	A	6	6	2032430	2032435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_020529	CCTATT	2	12	2032458	2032469	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_020529	ATAA	2	8	2032559	2032566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_020529	A	6	6	2032607	2032612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_020529	TTG	2	6	2033476	2033481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_020529	GC	3	6	2033517	2033522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11621	NC_020529	TCC	2	6	2035120	2035125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11622	NC_020529	TAT	2	6	2035159	2035164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_020529	A	6	6	2035241	2035246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_020529	ATT	2	6	2036221	2036226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_020529	ATA	2	6	2036270	2036275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_020529	CTT	2	6	2036282	2036287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_020529	AT	3	6	2036381	2036386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_020529	ATA	2	6	2037660	2037665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_020529	TTA	2	6	2037703	2037708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11631	NC_020529	TA	3	6	2037736	2037741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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