MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 13205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_020307	TCT	2	6	2668377	2668382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_020307	AC	3	6	2668467	2668472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_020307	CGT	3	9	2668485	2668493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_020307	AGC	2	6	2668666	2668671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_020307	C	6	6	2668671	2668676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8006	NC_020307	ACG	2	6	2668720	2668725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_020307	TGA	2	6	2668800	2668805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_020307	CCG	2	6	2668828	2668833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_020307	ACC	2	6	2668915	2668920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_020307	CCT	2	6	2668997	2669002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_020307	CTC	2	6	2669034	2669039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_020307	AGG	2	6	2669051	2669056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_020307	CCA	2	6	2669078	2669083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_020307	GGT	2	6	2669138	2669143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_020307	CAT	2	6	2669333	2669338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_020307	GCC	2	6	2669408	2669413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_020307	TAA	2	6	2669533	2669538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_020307	CAGC	2	8	2669546	2669553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_020307	GACT	2	8	2669564	2669571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_020307	TC	3	6	2669662	2669667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_020307	ACC	2	6	2669692	2669697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_020307	TTG	2	6	2669764	2669769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_020307	TCA	2	6	2669791	2669796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_020307	AC	4	8	2669832	2669839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_020307	C	6	6	2669892	2669897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8026	NC_020307	CAA	2	6	2670133	2670138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_020307	CTTT	2	8	2670227	2670234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8030	NC_020307	GTT	2	6	2670333	2670338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_020307	ACG	2	6	2670348	2670353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8033	NC_020307	TCGGT	2	10	2670579	2670588	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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8035	NC_020307	GTCA	2	8	2670874	2670881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8036	NC_020307	GGA	2	6	2670897	2670902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_020307	C	6	6	2670907	2670912	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8038	NC_020307	CG	3	6	2670999	2671004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8039	NC_020307	AC	3	6	2671026	2671031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_020307	CTC	2	6	2671052	2671057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_020307	TCGC	2	8	2671063	2671070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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8043	NC_020307	GA	3	6	2671368	2671373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_020307	AAC	2	6	2671380	2671385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_020307	GTT	2	6	2671390	2671395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8049	NC_020307	ACC	2	6	2671709	2671714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_020307	ACC	2	6	2671744	2671749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_020307	TCA	2	6	2671787	2671792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_020307	TG	3	6	2671800	2671805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_020307	TAAGG	2	10	2671828	2671837	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_020307	CTAC	2	8	2671933	2671940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8055	NC_020307	GT	3	6	2671976	2671981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8057	NC_020307	GT	3	6	2672145	2672150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_020307	ATG	2	6	2672170	2672175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8060	NC_020307	CCGG	2	8	2672232	2672239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8061	NC_020307	CAA	2	6	2672248	2672253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_020307	GAC	2	6	2672309	2672314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_020307	GCA	2	6	2672321	2672326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_020307	TTC	2	6	2672397	2672402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8066	NC_020307	TCC	2	6	2672660	2672665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_020307	C	6	6	2672704	2672709	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8068	NC_020307	TGCG	2	8	2672792	2672799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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8096	NC_020307	A	6	6	2679039	2679044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8103	NC_020307	T	8	8	2681630	2681637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_020307	A	6	6	2681642	2681647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8108	NC_020307	GT	3	6	2685068	2685073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_020307	AGCGC	2	10	2686289	2686298	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8110	NC_020307	TAA	2	6	2686363	2686368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_020307	T	6	6	2686379	2686384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_020307	GGC	2	6	2686487	2686492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_020307	GCC	2	6	2686540	2686545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8115	NC_020307	GGC	2	6	2689287	2689292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8118	NC_020307	AT	3	6	2689327	2689332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_020307	TCTT	2	8	2689361	2689368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8120	NC_020307	TAACGC	2	12	2691211	2691222	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8122	NC_020307	TC	3	6	2691242	2691247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_020307	AAT	2	6	2691286	2691291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8125	NC_020307	GGC	2	6	2695720	2695725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_020307	TACAT	2	10	2697412	2697421	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8127	NC_020307	CCT	2	6	2697466	2697471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_020307	GA	3	6	2697485	2697490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_020307	GA	3	6	2697501	2697506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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