MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw4 genomic sequence

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020266	AGA	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020266	ATTAT	2	10	374	383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020266	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020266	TAT	2	6	1339	1344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020266	AAT	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020266	AAG	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020266	ATA	2	6	3516	3521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020266	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020266	TAA	2	6	3563	3568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020266	TTA	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020266	TCTT	2	8	3627	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020266	TA	3	6	3661	3666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020266	AT	3	6	3739	3744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020266	T	6	6	3744	3749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020266	ACC	2	6	4313	4318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_020266	TACT	2	8	4339	4346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020266	TC	3	6	4380	4385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020266	TTAAG	2	10	4478	4487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020266	CCT	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020266	TA	3	6	5541	5546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020266	ATC	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020266	TAT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020266	AT	3	6	5586	5591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020266	AT	3	6	5594	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020266	AT	3	6	5604	5609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020266	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020266	AAT	2	6	5638	5643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020266	AAG	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020266	TTA	2	6	5755	5760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020266	AAGT	2	8	5772	5779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020266	GAT	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020266	TAA	2	6	5855	5860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020266	AGG	2	6	5863	5868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020266	ATT	2	6	6828	6833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020266	AAT	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020266	TC	3	6	7146	7151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020266	AT	3	6	7169	7174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020266	TATAAA	2	12	7175	7186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020266	A	7	7	7197	7203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020266	TTTATT	2	12	7226	7237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020266	TA	4	8	7252	7259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020266	TAC	2	6	7294	7299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020266	TTCC	2	8	8023	8030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020266	TCT	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020266	ATT	2	6	8101	8106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020266	CAC	2	6	8675	8680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020266	A	6	6	8739	8744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020266	TAT	2	6	8750	8755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020266	AAC	2	6	8841	8846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020266	GAT	2	6	8885	8890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020266	GC	3	6	8919	8924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020266	ATG	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020266	TAT	2	6	9253	9258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020266	A	7	7	9266	9272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020266	CATT	2	8	9311	9318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020266	AAG	2	6	9326	9331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020266	TCT	2	6	9376	9381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020266	T	6	6	9386	9391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020266	ACTA	2	8	9397	9404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020266	TTA	2	6	9413	9418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020266	CTTT	2	8	9447	9454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020266	TAA	2	6	9459	9464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020266	T	7	7	9467	9473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020266	T	6	6	12820	12825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020266	TTTA	2	8	12856	12863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020266	ATTT	2	8	12871	12878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020266	ATT	2	6	12881	12886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020266	AAG	2	6	12896	12901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020266	T	6	6	12928	12933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020266	TA	3	6	13086	13091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020266	ATAAAA	2	12	13096	13107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020266	AAT	2	6	13113	13118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020266	ATTT	2	8	13127	13134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020266	AATTA	2	10	13181	13190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020266	CAA	2	6	13235	13240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020266	ACC	2	6	13272	13277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020266	T	6	6	13290	13295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020266	CGTTAA	2	12	13299	13310	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020266	TTTAC	2	10	13361	13370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020266	TGAA	2	8	13415	13422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020266	T	6	6	13497	13502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020266	TTA	2	6	14659	14664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020266	AAT	2	6	14996	15001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020266	TCTT	2	8	15009	15016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020266	CT	3	6	15055	15060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020266	TTG	2	6	15072	15077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020266	TATT	2	8	15101	15108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020266	TA	3	6	15428	15433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020266	TA	3	6	15451	15456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020266	TTG	2	6	15467	15472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020266	TA	3	6	15528	15533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020266	TA	3	6	15563	15568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020266	TAT	2	6	15571	15576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020266	TGCT	2	8	15587	15594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020266	CTT	2	6	15658	15663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020266	TA	3	6	15686	15691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020266	AT	4	8	15728	15735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020266	TAA	2	6	15775	15780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020266	TTTG	2	8	15790	15797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020266	TA	3	6	15800	15805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020266	GTT	2	6	15806	15811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020266	TTA	2	6	15818	15823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020266	TA	4	8	15822	15829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020266	ATT	2	6	15836	15841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020266	ACTT	2	8	15864	15871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020266	T	6	6	15877	15882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020266	AAC	2	6	16900	16905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020266	ATT	2	6	17054	17059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020266	TTA	2	6	17144	17149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020266	ATT	2	6	17176	17181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020266	TAA	2	6	17317	17322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020266	ATT	2	6	17352	17357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020266	A	6	6	17363	17368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020266	ATA	2	6	17373	17378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020266	TTA	2	6	17381	17386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020266	TA	3	6	17393	17398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020266	T	6	6	17477	17482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020266	A	6	6	17489	17494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020266	TAA	2	6	17503	17508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020266	T	7	7	17798	17804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020266	TGAA	2	8	17820	17827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020266	AT	3	6	17883	17888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020266	TTG	2	6	17941	17946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020266	ATTA	2	8	17983	17990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020266	ATT	2	6	18677	18682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020266	TCT	2	6	18756	18761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020266	T	6	6	19475	19480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.