MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 7178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020246	T	6	6	1584481	1584486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020246	GAAA	2	8	1584523	1584530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020246	TTA	2	6	1584582	1584587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020246	TTC	2	6	1585236	1585241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_020246	TAA	2	6	1585255	1585260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020246	A	6	6	1585287	1585292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020246	TTAT	2	8	1585293	1585300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020246	TA	3	6	1585406	1585411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020246	ACC	2	6	1585469	1585474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_020246	CT	3	6	1585500	1585505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_020246	ATG	2	6	1585528	1585533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020246	TG	3	6	1585536	1585541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020246	TAC	2	6	1585608	1585613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_020246	A	6	6	1588865	1588870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_020246	AT	3	6	1588880	1588885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_020246	AAG	2	6	1588903	1588908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_020246	CTTTT	2	10	1588917	1588926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4018	NC_020246	T	6	6	1589519	1589524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_020246	ACTAG	2	10	1589540	1589549	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4020	NC_020246	A	6	6	1589556	1589561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_020246	TCA	2	6	1589637	1589642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_020246	AT	3	6	1589661	1589666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020246	GAA	2	6	1589694	1589699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_020246	TTG	2	6	1590533	1590538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020246	GGA	2	6	1590563	1590568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020246	GATA	2	8	1590585	1590592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020246	TC	3	6	1591262	1591267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_020246	CTA	2	6	1591270	1591275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_020246	GTC	2	6	1591296	1591301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_020246	GAT	2	6	1591313	1591318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020246	TAAA	2	8	1591345	1591352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020246	TC	3	6	1591401	1591406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_020246	TAAA	2	8	1591427	1591434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020246	T	6	6	1591444	1591449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020246	GTA	2	6	1591468	1591473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020246	CTAA	2	8	1592023	1592030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_020246	CTT	2	6	1592033	1592038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_020246	ACG	2	6	1592048	1592053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_020246	ACA	2	6	1592157	1592162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_020246	TAT	2	6	1592165	1592170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020246	TTA	2	6	1595483	1595488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020246	ATG	2	6	1595503	1595508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020246	AAC	2	6	1595532	1595537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_020246	CTAA	2	8	1595543	1595550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_020246	TCT	2	6	1595595	1595600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_020246	AC	3	6	1595626	1595631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_020246	GAT	2	6	1596023	1596028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_020246	TAC	2	6	1596034	1596039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_020246	AG	3	6	1596049	1596054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_020246	ATT	2	6	1596164	1596169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_020246	AAT	2	6	1598339	1598344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_020246	TTCTC	2	10	1598934	1598943	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4053	NC_020246	T	6	6	1598945	1598950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_020246	AAC	2	6	1598951	1598956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_020246	AC	4	8	1599405	1599412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_020246	ACT	2	6	1599423	1599428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_020246	TAA	2	6	1599433	1599438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_020246	CAT	2	6	1599470	1599475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_020246	AT	3	6	1599554	1599559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_020246	TAA	2	6	1599566	1599571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_020246	TA	3	6	1599597	1599602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020246	TAT	2	6	1599640	1599645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020246	ATA	2	6	1599655	1599660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020246	TAAA	2	8	1599680	1599687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020246	TA	3	6	1599689	1599694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_020246	AGG	2	6	1602250	1602255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_020246	AAT	2	6	1602279	1602284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020246	T	7	7	1602284	1602290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_020246	A	6	6	1602302	1602307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_020246	TAT	2	6	1602312	1602317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_020246	TCAT	2	8	1602318	1602325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_020246	A	6	6	1603476	1603481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_020246	TAT	2	6	1603490	1603495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020246	GTTT	2	8	1603536	1603543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_020246	A	6	6	1603562	1603567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_020246	TAA	2	6	1605654	1605659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_020246	TAACG	2	10	1605681	1605690	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4078	NC_020246	GAA	2	6	1605711	1605716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_020246	AAC	2	6	1605722	1605727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_020246	GA	3	6	1605784	1605789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_020246	TCT	2	6	1605844	1605849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_020246	ATTATA	2	12	1605882	1605893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_020246	TGTT	2	8	1605896	1605903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_020246	CATA	2	8	1607587	1607594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4085	NC_020246	GTT	2	6	1607595	1607600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_020246	CCT	2	6	1607681	1607686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_020246	CAA	2	6	1607732	1607737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_020246	A	6	6	1607831	1607836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_020246	T	6	6	1607848	1607853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_020246	AATA	2	8	1607881	1607888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_020246	AAT	2	6	1608509	1608514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_020246	AAT	2	6	1608530	1608535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_020246	TA	3	6	1608558	1608563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_020246	TTAC	2	8	1608575	1608582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_020246	A	6	6	1610167	1610172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020246	TAT	2	6	1610176	1610181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_020246	TTA	2	6	1610194	1610199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_020246	TAG	2	6	1610208	1610213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_020246	TA	3	6	1610228	1610233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_020246	ATTA	2	8	1610278	1610285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_020246	AC	3	6	1611130	1611135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_020246	TC	3	6	1611226	1611231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_020246	TGTCC	2	10	1611597	1611606	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4104	NC_020246	A	6	6	1611615	1611620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_020246	ATC	2	6	1611659	1611664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_020246	CTC	2	6	1611668	1611673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4107	NC_020246	CAAT	2	8	1612235	1612242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_020246	TCT	2	6	1612271	1612276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_020246	AAGA	2	8	1612289	1612296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_020246	CTC	2	6	1612395	1612400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_020246	CGT	2	6	1612485	1612490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_020246	AG	3	6	1612493	1612498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_020246	TTAT	2	8	1612506	1612513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020246	AT	3	6	1612512	1612517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020246	T	6	6	1616372	1616377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020246	TA	3	6	1616387	1616392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020246	GAAAAA	2	12	1616421	1616432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020246	AATAA	2	10	1616442	1616451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020246	GAC	2	6	1616532	1616537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_020246	GAT	2	6	1617351	1617356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020246	AT	3	6	1617376	1617381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020246	TTCATA	2	12	1618728	1618739	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4123	NC_020246	TTA	2	6	1618753	1618758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020246	TTGA	2	8	1618829	1618836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020246	ATA	2	6	1618924	1618929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020246	TA	4	8	1620438	1620445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020246	AT	3	6	1621955	1621960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_020246	CTA	2	6	1621989	1621994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_020246	TAA	2	6	1622034	1622039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_020246	ATAA	2	8	1622045	1622052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_020246	GTTTA	2	10	1622107	1622116	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_020246	TG	3	6	1622142	1622147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_020246	TCC	2	6	1622164	1622169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_020246	GAT	2	6	1622551	1622556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_020246	ATTA	2	8	1622587	1622594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_020246	T	6	6	1622682	1622687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_020246	AT	3	6	1623721	1623726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_020246	ATA	2	6	1623824	1623829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_020246	TAA	2	6	1623841	1623846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_020246	AAAG	2	8	1623874	1623881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_020246	ATG	2	6	1627962	1627967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_020246	T	6	6	1629143	1629148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_020246	T	6	6	1629177	1629182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4144	NC_020246	AT	3	6	1629183	1629188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_020246	T	6	6	1629222	1629227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_020246	TAA	2	6	1629232	1629237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_020246	AAG	2	6	1629246	1629251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4149	NC_020246	TGA	2	6	1630917	1630922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4151	NC_020246	AT	3	6	1631080	1631085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4152	NC_020246	ATA	2	6	1631105	1631110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_020246	CT	3	6	1631111	1631116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4154	NC_020246	A	6	6	1631194	1631199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4156	NC_020246	ACA	2	6	1631232	1631237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_020246	AT	3	6	1632687	1632692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4158	NC_020246	AG	4	8	1632719	1632726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4162	NC_020246	CTT	2	6	1632838	1632843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4164	NC_020246	TAA	2	6	1632988	1632993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4166	NC_020246	A	6	6	1633038	1633043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4167	NC_020246	T	6	6	1635387	1635392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4168	NC_020246	TTG	2	6	1638399	1638404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4172	NC_020246	AATT	2	8	1639162	1639169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4173	NC_020246	AG	3	6	1639296	1639301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4174	NC_020246	CATA	2	8	1639315	1639322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4175	NC_020246	CT	3	6	1639367	1639372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4176	NC_020246	ATA	2	6	1640250	1640255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4177	NC_020246	ATA	2	6	1640277	1640282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4180	NC_020246	GTG	2	6	1640423	1640428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4210	NC_020246	TTCA	2	8	1643902	1643909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4232	NC_020246	TC	3	6	1649484	1649489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4233	NC_020246	CAA	2	6	1649503	1649508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4252	NC_020246	CAT	2	6	1651114	1651119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4256	NC_020246	TTA	2	6	1651288	1651293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4258	NC_020246	TTA	2	6	1651347	1651352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_020246	GA	4	8	1651369	1651376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_020246	GT	3	6	1651385	1651390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_020246	TTA	2	6	1651406	1651411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_020246	TGTT	2	8	1651415	1651422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_020246	TTA	2	6	1651467	1651472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_020246	CA	3	6	1651473	1651478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4265	NC_020246	TTA	2	6	1651527	1651532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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