MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.04

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020052	TG	3	6	11	16	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020052	TG	3	6	32	37	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020052	TG	3	6	53	58	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020052	TG	3	6	74	79	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020052	TG	3	6	95	100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020052	TG	3	6	137	142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020052	TG	3	6	158	163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020052	A	8	8	196	203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020052	T	8	8	204	211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020052	T	6	6	224	229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020052	CAA	2	6	237	242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020052	TA	4	8	247	254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020052	TGT	2	6	267	272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020052	TTA	3	9	302	310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020052	GC	3	6	314	319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020052	AGTA	2	8	347	354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020052	TA	3	6	406	411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020052	TTG	2	6	439	444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020052	ATT	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020052	CGATCT	2	12	514	525	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020052	CAA	2	6	547	552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020052	G	8	8	635	642	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020052	C	7	7	685	691	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24	NC_020052	CAAA	2	8	711	718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020052	AAC	2	6	723	728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020052	T	10	10	825	834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020052	CTAT	2	8	863	870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020052	GTT	2	6	874	879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020052	ATA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020052	AAAT	2	8	990	997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020052	TAC	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020052	A	7	7	1024	1030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020052	T	7	7	1092	1098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020052	TAT	2	6	1100	1105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020052	TAT	2	6	1110	1115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020052	TTAA	2	8	1136	1143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020052	AGT	2	6	1472	1477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020052	TTA	2	6	2134	2139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020052	AT	3	6	2158	2163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020052	TA	3	6	2932	2937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020052	AT	3	6	2952	2957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020052	TAATAT	2	12	2977	2988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020052	TA	3	6	3033	3038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020052	AGTA	2	8	3041	3048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020052	TA	3	6	8112	8117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020052	TTG	2	6	8171	8176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020052	A	6	6	8197	8202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020052	GAA	2	6	8247	8252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020052	TCT	2	6	8253	8258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020052	TAA	2	6	8349	8354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020052	T	7	7	12102	12108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020052	GTA	2	6	12109	12114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020052	TAC	2	6	12127	12132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020052	T	6	6	12139	12144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020052	A	10	10	12298	12307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.