MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC03

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019895	GGGC	2	8	14	21	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019895	GCCC	2	8	28	35	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_019895	TTG	2	6	2289	2294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019895	GGGC	2	8	2308	2315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_019895	GCCC	2	8	2322	2329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_019895	TTTCC	2	10	2617	2626	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_019895	TTCA	2	8	2746	2753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019895	TGAT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019895	GCG	2	6	2792	2797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019895	GGC	2	6	2798	2803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019895	GCCG	2	8	2901	2908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019895	CGG	2	6	2956	2961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019895	GGA	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019895	GGCT	2	8	3027	3034	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019895	C	6	6	3045	3050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_019895	CGG	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019895	GACAA	2	10	3146	3155	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019895	ATC	2	6	3174	3179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019895	CTC	2	6	4217	4222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_019895	CCG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_019895	TAC	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019895	G	8	8	4363	4370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019895	CAG	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019895	CGC	2	6	4470	4475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_019895	GC	4	8	4485	4492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019895	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019895	CCGC	2	8	5687	5694	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_019895	CCG	2	6	5707	5712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019895	CGC	2	6	5731	5736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_019895	CTGC	2	8	5745	5752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019895	CGG	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019895	CGC	2	6	5806	5811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_019895	CGC	2	6	6635	6640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_019895	GCC	2	6	6650	6655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_019895	GC	3	6	6666	6671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019895	CCGG	2	8	9118	9125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019895	CCT	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_019895	CGGG	2	8	11097	11104	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019895	CGG	2	6	11145	11150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019895	CCA	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019895	GGA	2	6	11178	11183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019895	GCC	2	6	11654	11659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_019895	GGC	2	6	11678	11683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019895	AC	3	6	12182	12187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_019895	C	6	6	12191	12196	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_019895	CCA	2	6	12245	12250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019895	TCC	2	6	13483	13488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019895	CGGGG	2	10	13516	13525	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_019895	CAAA	2	8	13917	13924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019895	TGG	2	6	13964	13969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019895	CCG	2	6	14094	14099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019895	CGG	2	6	14105	14110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019895	ATC	2	6	14223	14228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019895	GCG	2	6	14233	14238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019895	GCC	2	6	14241	14246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_019895	C	6	6	14274	14279	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_019895	GTC	2	6	14318	14323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019895	CGC	2	6	14396	14401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019895	CGAAG	2	10	14455	14464	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_019895	GCA	2	6	14474	14479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019895	AG	3	6	14504	14509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019895	GA	3	6	14514	14519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019895	T	8	8	14576	14583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019895	GAAA	2	8	14593	14600	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019895	A	7	7	16228	16234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019895	GTT	2	6	16253	16258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019895	AGT	2	6	16317	16322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019895	A	7	7	16340	16346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019895	AGG	2	6	16543	16548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019895	ACA	2	6	16617	16622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019895	GTC	2	6	16735	16740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019895	ACC	2	6	16791	16796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019895	GGC	2	6	16859	16864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019895	GGGT	2	8	16904	16911	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019895	GAT	3	9	17010	17018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019895	TCG	2	6	17243	17248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019895	TGGC	2	8	17259	17266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019895	TGG	2	6	17348	17353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019895	TCG	2	6	17357	17362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019895	CCGC	2	8	17429	17436	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_019895	CGG	2	6	17452	17457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019895	AAT	2	6	17489	17494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019895	AATCA	2	10	17575	17584	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019895	GGC	2	6	17600	17605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019895	AT	3	6	18220	18225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019895	GCC	2	6	18243	18248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_019895	GAT	2	6	18333	18338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019895	GCC	2	6	18350	18355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_019895	TAG	2	6	18379	18384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019895	TGG	2	6	20086	20091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019895	TGG	2	6	20111	20116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019895	AAT	2	6	20123	20128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019895	CCA	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019895	GTT	2	6	20218	20223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019895	ACC	2	6	20250	20255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019895	GGC	2	6	20308	20313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019895	ATCG	2	8	20397	20404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_019895	GCAC	2	8	20456	20463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019895	GTC	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019895	CGT	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019895	GCG	2	6	21542	21547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019895	GA	3	6	21610	21615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019895	TGC	2	6	21664	21669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019895	TCCC	2	8	21688	21695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_019895	GC	3	6	21739	21744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_019895	GC	3	6	21781	21786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019895	GCT	2	6	21831	21836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019895	CGC	2	6	21863	21868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019895	GCG	2	6	21884	21889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_019895	TTTGC	2	10	22114	22123	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_019895	TGA	2	6	22141	22146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019895	GAT	2	6	22259	22264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019895	GAT	2	6	22310	22315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019895	CTGT	2	8	22396	22403	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_019895	TTC	2	6	22437	22442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019895	GCC	2	6	22466	22471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_019895	CGC	2	6	22510	22515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_019895	GTT	2	6	22549	22554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019895	GTC	2	6	22568	22573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019895	TGA	2	6	22642	22647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019895	TGA	2	6	22699	22704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019895	CGGG	2	8	22743	22750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019895	TCC	2	6	22808	22813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_019895	TCAT	2	8	22987	22994	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019895	TCC	2	6	22997	23002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_019895	TCCT	2	8	23011	23018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019895	TCG	2	6	23021	23026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019895	AAC	2	6	23068	23073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019895	ATC	2	6	23095	23100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019895	AAG	2	6	23119	23124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019895	CAAC	2	8	23130	23137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019895	GCT	2	6	23164	23169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019895	CGG	2	6	23198	23203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019895	AGC	3	9	23261	23269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019895	ACC	2	6	23298	23303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_019895	CAA	2	6	23319	23324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019895	ATG	2	6	23341	23346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019895	CGA	2	6	23395	23400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_019895	GGC	2	6	23415	23420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019895	TTC	2	6	23426	23431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019895	ATC	2	6	23503	23508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019895	GGA	2	6	23573	23578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019895	A	6	6	23672	23677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019895	CGG	2	6	23751	23756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019895	TC	3	6	23808	23813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019895	CT	3	6	23820	23825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019895	GAA	2	6	23844	23849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019895	TCC	2	6	23930	23935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_019895	CGA	2	6	23976	23981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019895	CGA	2	6	24000	24005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019895	TTC	2	6	24035	24040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_019895	AGT	2	6	24050	24055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019895	GCG	2	6	24138	24143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019895	CGG	2	6	24170	24175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_019895	GAC	2	6	24325	24330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019895	TTC	2	6	24361	24366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_019895	AT	3	6	24508	24513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019895	TCT	2	6	24536	24541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_019895	TTG	2	6	24710	24715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019895	AAC	2	6	24730	24735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_019895	ATA	2	6	24757	24762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019895	TGA	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019895	GGC	2	6	24949	24954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_019895	GCCA	2	8	25019	25026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NC_019895	GTTC	2	8	25041	25048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_019895	A	6	6	25070	25075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019895	CT	3	6	25096	25101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_019895	CGG	2	6	25103	25108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_019895	TTC	2	6	25239	25244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_019895	GTC	2	6	25282	25287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_019895	GAT	2	6	26173	26178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_019895	AAT	2	6	26211	26216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019895	CCT	2	6	26217	26222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_019895	GTTG	2	8	26267	26274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_019895	TTCC	2	8	26295	26302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
176	NC_019895	CTA	2	6	26320	26325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_019895	TAGC	2	8	26360	26367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_019895	ATT	2	6	26375	26380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_019895	AAAG	2	8	27203	27210	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
180	NC_019895	GAG	2	6	27270	27275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_019895	CA	3	6	27289	27294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
182	NC_019895	GCA	2	6	27328	27333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_019895	T	6	6	27534	27539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019895	CT	3	6	27568	27573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
185	NC_019895	ACC	2	6	27622	27627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_019895	CGG	2	6	31040	31045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.