MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019893	CGAGC	2	10	42	51	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_019893	GAA	2	6	65	70	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019893	CAT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019893	GAC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019893	AC	3	6	203	208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019893	TG	3	6	271	276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019893	TTC	2	6	369	374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019893	TCG	2	6	384	389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019893	CAC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_019893	GAC	2	6	441	446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019893	GAA	2	6	464	469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019893	GTG	2	6	529	534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019893	T	6	6	555	560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019893	CTG	2	6	610	615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019893	CAC	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_019893	TTCA	2	8	692	699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019893	ACA	2	6	850	855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019893	CGAA	2	8	898	905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019893	CAT	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019893	ACA	2	6	1046	1051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019893	AAAT	2	8	1081	1088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019893	AGG	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019893	TCA	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019893	CAAG	2	8	4613	4620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019893	ATT	2	6	4672	4677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019893	T	6	6	4768	4773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019893	CAAA	2	8	4808	4815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019893	TCC	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_019893	AC	4	8	4897	4904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_019893	A	7	7	4905	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019893	TAA	2	6	4928	4933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019893	CTT	2	6	4948	4953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019893	T	6	6	4952	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019893	CGA	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019893	GAG	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019893	AATTC	2	10	5128	5137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_019893	TGAA	2	8	5164	5171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019893	GGGT	2	8	5177	5184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019893	A	6	6	6555	6560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019893	AAGT	2	8	6618	6625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019893	TGGG	2	8	6631	6638	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019893	CCGA	2	8	6713	6720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019893	ACG	2	6	6753	6758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019893	ATC	2	6	6760	6765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019893	TCC	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019893	CGC	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_019893	CCGA	2	8	7010	7017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019893	CCG	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019893	CGC	2	6	7074	7079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_019893	CGC	2	6	7109	7114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019893	GCCA	2	8	7171	7178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019893	T	6	6	7272	7277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019893	GCT	2	6	10512	10517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019893	TTC	2	6	10555	10560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019893	GAAA	2	8	10578	10585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019893	A	6	6	10583	10588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019893	TGT	3	9	10611	10619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019893	TCT	2	6	10625	10630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019893	CAA	2	6	10631	10636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019893	GAG	2	6	11080	11085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019893	AGGGG	2	10	11118	11127	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019893	A	8	8	11320	11327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019893	GGGA	2	8	11436	11443	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019893	CGA	2	6	11444	11449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_019893	AGG	2	6	11455	11460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019893	GAT	2	6	11539	11544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019893	CGA	2	6	11550	11555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019893	G	6	6	11596	11601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019893	CGT	2	6	11702	11707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019893	CGC	2	6	11770	11775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019893	CCG	2	6	11796	11801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_019893	CGTC	2	8	11923	11930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_019893	ATCA	2	8	11938	11945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_019893	GCA	2	6	11949	11954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019893	GAC	2	6	11968	11973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019893	C	6	6	11997	12002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_019893	TTC	2	6	12023	12028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019893	ATT	2	6	12034	12039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019893	ATG	2	6	12139	12144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019893	TGG	2	6	12145	12150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019893	GATT	2	8	14508	14515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019893	T	10	10	14658	14667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019893	C	6	6	15793	15798	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_019893	TTG	2	6	15822	15827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019893	GCCGTA	2	12	15882	15893	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019893	TCA	2	6	15942	15947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019893	CTT	2	6	15955	15960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019893	CG	3	6	16111	16116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_019893	CGAG	2	8	16142	16149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019893	GCC	2	6	16184	16189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019893	CAT	2	6	16265	16270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019893	TTG	2	6	17226	17231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019893	TTG	2	6	17262	17267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019893	ATA	2	6	18962	18967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019893	CAC	2	6	20116	20121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_019893	GCA	2	6	20151	20156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019893	CCGC	2	8	20219	20226	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_019893	CATT	2	8	20229	20236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_019893	GGC	2	6	21402	21407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019893	CGT	2	6	21476	21481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019893	AAT	2	6	22718	22723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019893	AGA	2	6	22890	22895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019893	GCG	2	6	22917	22922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019893	ATC	2	6	22988	22993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019893	CGA	2	6	27009	27014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019893	CGG	2	6	31589	31594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019893	TCGGA	2	10	31606	31615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_019893	CCCG	2	8	31707	31714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_019893	ATTA	2	8	31723	31730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019893	ATT	2	6	31733	31738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019893	TCT	2	6	31817	31822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019893	CGCC	2	8	31832	31839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_019893	GA	3	6	31883	31888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019893	GTT	2	6	32546	32551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019893	TGT	2	6	32592	32597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019893	GAA	2	6	32622	32627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019893	AGG	2	6	34544	34549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019893	C	7	7	37419	37425	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_019893	CGG	2	6	37433	37438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019893	TCG	2	6	37538	37543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019893	CTC	2	6	37774	37779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_019893	GTT	2	6	37781	37786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019893	TTTA	2	8	37791	37798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019893	ACA	2	6	39208	39213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019893	T	7	7	39271	39277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019893	A	7	7	39278	39284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019893	T	8	8	39298	39305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019893	AC	3	6	39312	39317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019893	CTC	2	6	42048	42053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019893	CTG	2	6	42061	42066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019893	GCG	2	6	42082	42087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019893	TGC	2	6	42106	42111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019893	GGC	2	6	42147	42152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019893	GGA	2	6	42997	43002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019893	CCTCA	2	10	44178	44187	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_019893	AGTCA	2	10	44236	44245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_019893	AGT	2	6	44251	44256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019893	T	6	6	44336	44341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.