MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4d

Total Repeats: 4306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019849	TC	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019849	CGT	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019849	GAA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019849	GAC	2	6	2378	2383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019849	GCG	2	6	2393	2398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019849	GTCG	2	8	3727	3734	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019849	GCC	2	6	3835	3840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019849	A	6	6	3888	3893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019849	CAA	2	6	3975	3980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019849	TGC	2	6	4003	4008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019849	GCC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019849	CAA	2	6	4112	4117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019849	GTG	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019849	GC	3	6	5209	5214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_019849	CGT	2	6	5218	5223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019849	CGC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019849	CGG	2	6	7146	7151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019849	GC	3	6	7208	7213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019849	GCTG	2	8	8146	8153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019849	GGT	2	6	9681	9686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019849	G	6	6	9693	9698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019849	GCT	2	6	9754	9759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019849	CGATC	2	10	9781	9790	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019849	CAG	2	6	9793	9798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019849	GAG	2	6	9885	9890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019849	GCG	2	6	9896	9901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019849	GCC	2	6	9904	9909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_019849	GAA	2	6	9935	9940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019849	TGC	2	6	9962	9967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019849	GGGGC	2	10	9988	9997	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019849	GAA	2	6	10017	10022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019849	GGC	2	6	10028	10033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019849	TTC	2	6	10083	10088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019849	CGG	2	6	10262	10267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019849	CGA	3	9	10332	10340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019849	GTC	2	6	10394	10399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019849	GTTTCG	2	12	11304	11315	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019849	GC	3	6	11323	11328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019849	GCGG	2	8	11342	11349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019849	TCC	2	6	12388	12393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_019849	TTG	2	6	12420	12425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019849	CG	3	6	12438	12443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019849	CTC	2	6	14302	14307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_019849	AGCG	2	8	14318	14325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019849	TCC	2	6	14358	14363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_019849	CCAG	2	8	14364	14371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_019849	CTC	2	6	14399	14404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_019849	ACTA	2	8	14437	14444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_019849	AATC	2	8	14453	14460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019849	GAT	2	6	14486	14491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019849	GCC	2	6	14531	14536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019849	TTA	2	6	15357	15362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019849	CGTC	2	8	15363	15370	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019849	GTAAT	2	10	15373	15382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019849	AAAG	2	8	15474	15481	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019849	C	6	6	15484	15489	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
57	NC_019849	GC	3	6	16733	16738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_019849	GGTC	2	8	18083	18090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019849	TTG	2	6	18096	18101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019849	GCC	2	6	18127	18132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019849	T	6	6	18152	18157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019849	GAG	2	6	18222	18227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019849	TCCC	2	8	18488	18495	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_019849	AGT	2	6	18501	18506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019849	TA	3	6	18517	18522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019849	GGT	2	6	18590	18595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019849	GTTGC	2	10	18654	18663	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_019849	CTC	2	6	18688	18693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019849	TCG	2	6	18712	18717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019849	TGC	2	6	18761	18766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019849	CGGG	2	8	18797	18804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_019849	GAT	2	6	18909	18914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019849	G	6	6	19684	19689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019849	ATT	2	6	21711	21716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019849	CTG	2	6	21786	21791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019849	CG	3	6	21901	21906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019849	TCC	2	6	22890	22895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_019849	TCC	2	6	22926	22931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019849	TCG	2	6	23055	23060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019849	TGC	2	6	23102	23107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019849	TGG	2	6	24018	24023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019849	CTT	2	6	24031	24036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019849	TGCC	2	8	24041	24048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019849	GTC	2	6	24050	24055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019849	GCG	2	6	24084	24089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019849	GCA	2	6	24091	24096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019849	GGA	2	6	24101	24106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019849	C	6	6	27760	27765	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
89	NC_019849	GC	3	6	27767	27772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_019849	GAA	2	6	28466	28471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019849	GGC	2	6	28476	28481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019849	GAGG	2	8	28488	28495	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019849	GCC	2	6	28505	28510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_019849	GTCG	2	8	28512	28519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_019849	GAGGG	2	10	28530	28539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019849	CGG	2	6	28608	28613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019849	TGGGGC	2	12	28713	28724	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019849	CG	3	6	28744	28749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019849	GGC	2	6	28754	28759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019849	GGTCG	2	10	28884	28893	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_019849	AAG	2	6	28922	28927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019849	GCGG	2	8	28942	28949	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_019849	CA	3	6	28957	28962	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_019849	CGAAAC	2	12	29497	29508	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019849	TCA	2	6	29513	29518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019849	GCG	2	6	29565	29570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_019849	GGA	2	6	29592	29597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019849	TCCAC	2	10	32823	32832	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_019849	GGA	2	6	32904	32909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019849	TGG	2	6	33970	33975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019849	GCG	2	6	33993	33998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019849	CATT	2	8	34013	34020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_019849	CAG	2	6	34052	34057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019849	CGC	2	6	34058	34063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_019849	CGG	2	6	34066	34071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019849	GCTG	2	8	34104	34111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_019849	GAG	2	6	34145	34150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019849	CCG	2	6	37641	37646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_019849	GCGG	2	8	38660	38667	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_019849	GGA	2	6	38695	38700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019849	ACGG	2	8	42549	42556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019849	CTC	2	6	42560	42565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_019849	TCA	2	6	43375	43380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019849	G	6	6	43383	43388	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019849	GGC	2	6	43425	43430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019849	AC	3	6	43446	43451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019849	GGC	2	6	43537	43542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019849	TCAA	2	8	43565	43572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_019849	CGC	2	6	44677	44682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_019849	GCCC	2	8	44691	44698	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_019849	GAT	2	6	44712	44717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019849	ATC	2	6	44737	44742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019849	GCA	2	6	48877	48882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019849	GAGG	2	8	48920	48927	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019849	TAC	2	6	48937	48942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_019849	CCG	3	9	48968	48976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_019849	CGG	2	6	49986	49991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_019849	CCG	2	6	49998	50003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019849	CCTC	2	8	50013	50020	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_019849	GAT	2	6	50782	50787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019849	TGA	2	6	50813	50818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019849	AAT	2	6	50845	50850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019849	CCT	2	6	57671	57676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_019849	CGG	2	6	57727	57732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019849	CGC	2	6	57742	57747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019849	TCCC	2	8	59037	59044	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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148	NC_019849	CGG	2	6	59079	59084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019849	ATT	2	6	59114	59119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_019849	CT	3	6	61987	61992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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172	NC_019849	CGG	2	6	73466	73471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_019849	GAG	3	9	141432	141440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_019849	TA	3	6	141456	141461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019849	TGC	2	6	141466	141471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_019849	GCA	2	6	141475	141480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_019849	GCC	2	6	141569	141574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
278	NC_019849	GAAAGG	2	12	141590	141601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_019849	CTC	2	6	141922	141927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_019849	GGGGA	2	10	142076	142085	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019849	CGC	2	6	142092	142097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_019849	TCC	2	6	144966	144971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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287	NC_019849	GCGG	2	8	145917	145924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
288	NC_019849	CGCA	2	8	145930	145937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
289	NC_019849	TCC	2	6	147719	147724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_019849	CT	3	6	147861	147866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
291	NC_019849	CA	3	6	147895	147900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
292	NC_019849	GCA	2	6	148644	148649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_019849	CGG	2	6	148715	148720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_019849	GGA	2	6	148748	148753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
296	NC_019849	CG	3	6	149935	149940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
297	NC_019849	AGGG	2	8	150011	150018	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
298	NC_019849	GGA	2	6	150955	150960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
299	NC_019849	A	6	6	150964	150969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_019849	GAG	2	6	151076	151081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_019849	TCC	2	6	165399	165404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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322	NC_019849	GCCG	2	8	165528	165535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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402	NC_019849	GC	3	6	212657	212662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
403	NC_019849	TCC	2	6	212748	212753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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406	NC_019849	CAAG	2	8	213974	213981	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
407	NC_019849	CGG	3	9	216113	216121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_019849	CTGCC	2	10	216143	216152	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
409	NC_019849	G	6	6	216169	216174	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
410	NC_019849	GGCAG	2	10	216303	216312	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
411	NC_019849	GCCC	2	8	216347	216354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
412	NC_019849	CAGG	2	8	216366	216373	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
413	NC_019849	TCC	2	6	217359	217364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
414	NC_019849	AAT	2	6	217366	217371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_019849	TGCC	2	8	218477	218484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
416	NC_019849	CGC	2	6	218487	218492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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418	NC_019849	CCG	2	6	220170	220175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
419	NC_019849	CG	3	6	220186	220191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
420	NC_019849	GCA	2	6	220215	220220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_019849	GCT	2	6	220231	220236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_019849	CGGA	2	8	223394	223401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
423	NC_019849	TGC	2	6	223577	223582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_019849	AGCC	2	8	223607	223614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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426	NC_019849	A	6	6	223695	223700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_019849	ATC	2	6	245557	245562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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489	NC_019849	GGC	2	6	245699	245704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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