MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.02

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019749	ATC	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019749	CGAG	2	8	31	38	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019749	TTA	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019749	A	7	7	2234	2240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019749	AGA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019749	GA	3	6	2291	2296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019749	TA	3	6	2570	2575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019749	CT	3	6	2576	2581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019749	AGCG	2	8	2605	2612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019749	T	6	6	3431	3436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019749	TC	3	6	3440	3445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019749	A	6	6	3500	3505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019749	AAAC	2	8	3536	3543	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_019749	ATA	2	6	3549	3554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019749	AGA	2	6	3565	3570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019749	GAC	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019749	TA	3	6	7939	7944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019749	A	6	6	7944	7949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019749	GGTT	2	8	7978	7985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019749	T	6	6	8112	8117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019749	AAT	2	6	8136	8141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019749	ACA	2	6	8213	8218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_019749	ATGA	2	8	8244	8251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019749	ATTG	2	8	8253	8260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019749	TA	3	6	8322	8327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019749	A	6	6	8347	8352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019749	TATT	2	8	8423	8430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019749	T	6	6	8483	8488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019749	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019749	ATT	2	6	8509	8514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019749	T	6	6	8513	8518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019749	TA	3	6	8607	8612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019749	CT	3	6	8653	8658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019749	TTG	2	6	8665	8670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019749	TCT	2	6	8675	8680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019749	TC	3	6	8722	8727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019749	TTG	2	6	8745	8750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019749	TGT	4	12	8775	8786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019749	TGC	2	6	9441	9446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019749	ATT	2	6	9521	9526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019749	TGA	2	6	9563	9568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019749	ATTA	2	8	9581	9588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019749	GAC	2	6	9644	9649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019749	TCG	2	6	9693	9698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_019749	TGT	2	6	10010	10015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019749	TG	3	6	10060	10065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019749	GGA	2	6	10098	10103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019749	CCT	2	6	10110	10115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_019749	CAATA	2	10	10634	10643	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_019749	TTAA	2	8	10708	10715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019749	GAA	2	6	11004	11009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019749	A	6	6	11042	11047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019749	GA	3	6	11077	11082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019749	A	6	6	11122	11127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019749	GAA	2	6	11204	11209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019749	ACC	2	6	11301	11306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_019749	TAT	2	6	11312	11317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019749	TCA	2	6	11342	11347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019749	TAA	2	6	11379	11384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019749	GCA	2	6	11440	11445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019749	AGT	2	6	11465	11470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019749	TA	3	6	11487	11492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019749	GTTT	2	8	11501	11508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019749	TAT	2	6	11533	11538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019749	T	7	7	11644	11650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019749	ATCG	2	8	11670	11677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019749	AGC	2	6	11791	11796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019749	ATG	2	6	11801	11806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019749	AG	4	8	11823	11830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019749	A	8	8	11837	11844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019749	TGC	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019749	TTAAT	2	10	11875	11884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019749	CTA	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019749	CTTT	2	8	12278	12285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019749	ATTA	2	8	12322	12329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019749	GATA	2	8	12332	12339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019749	AGG	2	6	12344	12349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019749	CTG	2	6	12905	12910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019749	TTAATT	2	12	12928	12939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019749	AAAC	2	8	12957	12964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_019749	GCA	2	6	13029	13034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019749	AGCA	2	8	13097	13104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019749	TGG	2	6	13140	13145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019749	CTT	2	6	13187	13192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019749	AATA	2	8	13211	13218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019749	CGT	2	6	13237	13242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019749	AAT	2	6	13298	13303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019749	TAA	2	6	13336	13341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019749	AGG	2	6	13358	13363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019749	TTC	2	6	13370	13375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019749	CAT	2	6	13400	13405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019749	T	6	6	13460	13465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019749	GAG	2	6	13473	13478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019749	ATAGT	2	10	13519	13528	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019749	A	6	6	14719	14724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019749	GGTAAA	2	12	14792	14803	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019749	A	6	6	14836	14841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019749	TACC	2	8	14874	14881	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019749	AT	3	6	14906	14911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019749	TC	3	6	14913	14918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019749	TCG	2	6	14947	14952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019749	GTTCT	2	10	14977	14986	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_019749	ATC	2	6	15001	15006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019749	TCG	2	6	17076	17081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019749	CAA	2	6	17126	17131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019749	ATT	2	6	17202	17207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019749	CAG	2	6	17211	17216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019749	A	7	7	17277	17283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019749	A	6	6	17306	17311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019749	TAA	2	6	17426	17431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019749	ATT	2	6	17447	17452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019749	AACGA	2	10	17463	17472	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_019749	T	7	7	17476	17482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019749	TTC	2	6	17492	17497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019749	TTAA	2	8	18874	18881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019749	T	8	8	18891	18898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019749	GAT	2	6	21907	21912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019749	TCTA	2	8	21943	21950	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_019749	AGT	2	6	21976	21981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019749	CAG	2	6	22003	22008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019749	ATA	2	6	22009	22014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019749	ACC	2	6	22020	22025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_019749	ATATC	2	10	22158	22167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019749	ACTTTG	2	12	22178	22189	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019749	TGG	2	6	22332	22337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019749	TAT	2	6	22347	22352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019749	T	6	6	22474	22479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019749	ATTT	2	8	22619	22626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019749	TCGT	2	8	23011	23018	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_019749	AGA	2	6	23086	23091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019749	AT	3	6	23546	23551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019749	A	7	7	25267	25273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019749	CATT	2	8	25274	25281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019749	TAA	3	9	25302	25310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019749	TTTTA	3	15	25315	25329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019749	TATT	2	8	25334	25341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019749	TA	3	6	25354	25359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019749	T	6	6	25362	25367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019749	TCTAA	2	10	25374	25383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_019749	ATT	2	6	25421	25426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019749	AT	3	6	25439	25444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019749	T	8	8	25469	25476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019749	GA	3	6	25482	25487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019749	ATA	2	6	25488	25493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019749	TCTA	2	8	25599	25606	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_019749	TAAAT	2	10	25662	25671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019749	TG	3	6	26059	26064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019749	TTCC	2	8	26068	26075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_019749	TGA	2	6	26090	26095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019749	CTG	2	6	26582	26587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_019749	TTA	2	6	102614	102619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_019749	T	6	6	102725	102730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_019749	AG	3	6	103210	103215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
444	NC_019749	TTA	2	6	103590	103595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_019749	TA	3	6	103594	103599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_019749	AAG	2	6	104661	104666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
447	NC_019749	AGA	2	6	104714	104719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
448	NC_019749	AAT	2	6	104744	104749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_019749	CTC	2	6	105622	105627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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453	NC_019749	TCC	2	6	105674	105679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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455	NC_019749	TCCCA	2	10	105707	105716	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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472	NC_019749	GTT	2	6	106458	106463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_019749	GTTT	2	8	108510	108517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_019749	TAA	2	6	108557	108562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.