MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 10292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019702	TGAG	2	8	1542362	1542369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_019702	ATT	2	6	1542904	1542909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_019702	TTA	2	6	1542936	1542941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_019702	AAGG	2	8	1542946	1542953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_019702	T	6	6	1543715	1543720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_019702	CTG	2	6	1543768	1543773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_019702	AGG	2	6	1543854	1543859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_019702	ATTA	2	8	1544424	1544431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_019702	T	6	6	1544920	1544925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_019702	T	6	6	1544930	1544935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_019702	ATA	2	6	1545045	1545050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019702	A	7	7	1545059	1545065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_019702	GAA	2	6	1545071	1545076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_019702	GTA	2	6	1545086	1545091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_019702	T	6	6	1545144	1545149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019702	AAGT	2	8	1545180	1545187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_019702	AAC	2	6	1545213	1545218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_019702	ATT	2	6	1545258	1545263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_019702	ATTTA	2	10	1550326	1550335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_019702	TCT	2	6	1550357	1550362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_019702	AGC	2	6	1551515	1551520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_019702	TCG	2	6	1551529	1551534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_019702	T	6	6	1551579	1551584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_019702	T	6	6	1551658	1551663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_019702	GGT	2	6	1551666	1551671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_019702	TAA	2	6	1551703	1551708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_019702	AT	4	8	1552078	1552085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_019702	GAATT	2	10	1555778	1555787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_019702	AAT	2	6	1555811	1555816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_019702	A	6	6	1555949	1555954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_019702	TAA	2	6	1555963	1555968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019702	TAT	2	6	1555996	1556001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_019702	ACA	2	6	1556014	1556019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_019702	GTCT	2	8	1556037	1556044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_019702	TAA	2	6	1557735	1557740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_019702	TAAAAC	2	12	1557837	1557848	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4037	NC_019702	AACT	2	8	1559517	1559524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_019702	ACTA	2	8	1559532	1559539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_019702	GCT	2	6	1559560	1559565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_019702	T	6	6	1559565	1559570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019702	AC	3	6	1561250	1561255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_019702	GTA	2	6	1562625	1562630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_019702	TA	3	6	1562629	1562634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019702	AGTT	2	8	1565421	1565428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_019702	TAAT	2	8	1565440	1565447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019702	TTG	2	6	1565454	1565459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019702	ATT	2	6	1565506	1565511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_019702	TATT	2	8	1565520	1565527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_019702	TC	3	6	1566316	1566321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_019702	CAGA	2	8	1566389	1566396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4051	NC_019702	CTGC	2	8	1566404	1566411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_019702	T	7	7	1567026	1567032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_019702	ACTG	2	8	1567066	1567073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_019702	GAT	2	6	1567116	1567121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_019702	TTTGA	2	10	1567136	1567145	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_019702	CTT	2	6	1567203	1567208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_019702	T	6	6	1567214	1567219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_019702	CTA	2	6	1567280	1567285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_019702	TGCT	2	8	1567367	1567374	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4060	NC_019702	TGTTT	2	10	1567375	1567384	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_019702	TTCT	2	8	1567406	1567413	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_019702	CTT	2	6	1567457	1567462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_019702	TAT	2	6	1567506	1567511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_019702	ATG	2	6	1567523	1567528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_019702	ACC	2	6	1567710	1567715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4066	NC_019702	TAC	2	6	1567735	1567740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_019702	A	8	8	1567812	1567819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_019702	ATC	2	6	1567838	1567843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_019702	CTTT	2	8	1567962	1567969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_019702	GAC	2	6	1568113	1568118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_019702	GTCT	2	8	1568208	1568215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_019702	GA	3	6	1568300	1568305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019702	GCA	2	6	1569609	1569614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4075	NC_019702	GTT	2	6	1569711	1569716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019702	ACTGTT	2	12	1570584	1570595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4077	NC_019702	A	7	7	1570631	1570637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_019702	TTG	2	6	1571146	1571151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_019702	CAAT	2	8	1571234	1571241	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_019702	TAG	2	6	1571242	1571247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_019702	TTG	2	6	1571479	1571484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_019702	GTA	2	6	1571487	1571492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_019702	TC	3	6	1571497	1571502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4084	NC_019702	A	6	6	1571542	1571547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_019702	TGAA	2	8	1572836	1572843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_019702	GCAA	2	8	1572989	1572996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_019702	AT	3	6	1573108	1573113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_019702	AC	3	6	1573764	1573769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_019702	TAA	2	6	1573803	1573808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_019702	GAT	2	6	1573880	1573885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_019702	GCTA	2	8	1575053	1575060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_019702	AAT	2	6	1575107	1575112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_019702	GATT	2	8	1575178	1575185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_019702	ATTA	2	8	1576635	1576642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_019702	TTAGA	2	10	1576655	1576664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019702	TA	4	8	1576711	1576718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_019702	TTAAT	2	10	1579275	1579284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_019702	TTA	2	6	1579302	1579307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_019702	TTTA	2	8	1579408	1579415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_019702	ATT	2	6	1579454	1579459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019702	GGTTC	2	10	1580799	1580808	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_019702	T	6	6	1583136	1583141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019702	ATT	2	6	1584555	1584560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019702	T	6	6	1585053	1585058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_019702	T	6	6	1585066	1585071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019702	AATT	2	8	1585377	1585384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_019702	AAT	2	6	1585415	1585420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_019702	T	7	7	1585430	1585436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019702	TATT	2	8	1585473	1585480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_019702	AAT	2	6	1585515	1585520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_019702	AT	3	6	1585519	1585524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_019702	TATT	2	8	1585567	1585574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_019702	AAC	2	6	1586393	1586398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_019702	ATTA	2	8	1586439	1586446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_019702	GAA	2	6	1586447	1586452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4118	NC_019702	CAG	2	6	1588575	1588580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_019702	A	6	6	1589872	1589877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_019702	T	6	6	1589940	1589945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_019702	TAC	2	6	1591013	1591018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_019702	ATT	2	6	1591058	1591063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_019702	A	6	6	1591067	1591072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019702	T	7	7	1591074	1591080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_019702	TAT	2	6	1592358	1592363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_019702	AT	3	6	1592377	1592382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019702	TTC	2	6	1592472	1592477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_019702	TA	3	6	1592556	1592561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_019702	T	6	6	1595514	1595519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_019702	GAATT	2	10	1595536	1595545	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_019702	ATTAA	2	10	1595566	1595575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_019702	ATT	2	6	1597310	1597315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4134	NC_019702	ATA	2	6	1597671	1597676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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