MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 10292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019702	A	6	6	1421431	1421436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_019702	ATC	2	6	1421441	1421446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_019702	TCA	2	6	1421511	1421516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_019702	CTA	2	6	1421589	1421594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_019702	TA	3	6	1421623	1421628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019702	CT	3	6	1421672	1421677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_019702	TAT	2	6	1421737	1421742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_019702	TC	3	6	1422207	1422212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_019702	CAGA	2	8	1422296	1422303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_019702	AT	3	6	1422375	1422380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_019702	AAAG	2	8	1422543	1422550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_019702	ATG	2	6	1422667	1422672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_019702	T	8	8	1422693	1422700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_019702	GTA	2	6	1422772	1422777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_019702	TGG	2	6	1422796	1422801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_019702	ATA	2	6	1423001	1423006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_019702	T	6	6	1423039	1423044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_019702	A	6	6	1423108	1423113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_019702	AAT	2	6	1423256	1423261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019702	ATAG	2	8	1423268	1423275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_019702	TCG	2	6	1423411	1423416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_019702	CCTT	2	8	1423429	1423436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_019702	ACCT	2	8	1423494	1423501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_019702	CTTC	2	8	1423535	1423542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_019702	ACAA	2	8	1423555	1423562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_019702	C	6	6	1423582	1423587	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3527	NC_019702	GAT	2	6	1423629	1423634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_019702	CTA	2	6	1423637	1423642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_019702	A	6	6	1423668	1423673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_019702	C	6	6	1423678	1423683	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3531	NC_019702	AGTC	2	8	1423754	1423761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3532	NC_019702	TGC	2	6	1423772	1423777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_019702	CTT	2	6	1423782	1423787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_019702	GTT	2	6	1423806	1423811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_019702	ATT	2	6	1423842	1423847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_019702	CTT	2	6	1424030	1424035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_019702	AGCGT	2	10	1424058	1424067	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3538	NC_019702	TGA	2	6	1424103	1424108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_019702	TTTAG	2	10	1424110	1424119	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_019702	CTG	2	6	1424138	1424143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_019702	AGC	2	6	1424178	1424183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_019702	ATAA	2	8	1424197	1424204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_019702	ATT	2	6	1424293	1424298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_019702	T	6	6	1424334	1424339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_019702	ACTTTT	2	12	1424361	1424372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3546	NC_019702	CTT	2	6	1424401	1424406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_019702	AAT	2	6	1424469	1424474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_019702	A	6	6	1424478	1424483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_019702	ATGT	2	8	1424535	1424542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_019702	ATG	2	6	1424569	1424574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_019702	A	7	7	1425138	1425144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_019702	ATCT	2	8	1425159	1425166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_019702	CTT	2	6	1425229	1425234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_019702	GAG	2	6	1425256	1425261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_019702	CTCAT	2	10	1425316	1425325	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3556	NC_019702	TAG	2	6	1426076	1426081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_019702	ACCT	2	8	1426233	1426240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_019702	T	9	9	1426240	1426248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_019702	GAAC	2	8	1426257	1426264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_019702	CTT	2	6	1426275	1426280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_019702	GT	3	6	1426344	1426349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_019702	ATA	2	6	1426355	1426360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_019702	GTTT	2	8	1426747	1426754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_019702	TTA	2	6	1426779	1426784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_019702	CGG	2	6	1426820	1426825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_019702	TTA	2	6	1426861	1426866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_019702	TATT	2	8	1426908	1426915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_019702	ATA	2	6	1426934	1426939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_019702	ATT	2	6	1426953	1426958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_019702	GTAG	2	8	1429820	1429827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_019702	GAT	2	6	1431863	1431868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_019702	GGTTA	2	10	1431901	1431910	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_019702	TAA	2	6	1431951	1431956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_019702	ATA	2	6	1432634	1432639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_019702	TAT	2	6	1432674	1432679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_019702	A	6	6	1433156	1433161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_019702	ATAA	2	8	1433236	1433243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_019702	TTGG	2	8	1433286	1433293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_019702	ATA	2	6	1433295	1433300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_019702	ACTA	2	8	1433305	1433312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_019702	TAAA	2	8	1433315	1433322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_019702	TGAT	2	8	1434980	1434987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_019702	CAAT	2	8	1436428	1436435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_019702	TCA	2	6	1436440	1436445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_019702	ATT	2	6	1436452	1436457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_019702	TTC	2	6	1439516	1439521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_019702	TAA	2	6	1439579	1439584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_019702	T	7	7	1439685	1439691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_019702	TAAG	2	8	1439729	1439736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_019702	AGA	2	6	1439831	1439836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_019702	GC	3	6	1439926	1439931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3592	NC_019702	TGT	2	6	1439975	1439980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_019702	A	6	6	1439991	1439996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_019702	GAGT	2	8	1440043	1440050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_019702	TCAC	2	8	1442484	1442491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_019702	AC	3	6	1442490	1442495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_019702	TAA	2	6	1442561	1442566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_019702	ATTA	2	8	1442602	1442609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_019702	A	6	6	1442809	1442814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_019702	AGA	2	6	1442879	1442884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_019702	TACT	2	8	1442910	1442917	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_019702	TAC	2	6	1442981	1442986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_019702	AAT	2	6	1443075	1443080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_019702	A	6	6	1443099	1443104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_019702	TTAAT	2	10	1443146	1443155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_019702	T	6	6	1443167	1443172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_019702	ATTA	2	8	1443176	1443183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_019702	ATT	2	6	1443557	1443562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_019702	GAT	2	6	1443584	1443589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_019702	TAT	2	6	1443653	1443658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_019702	AG	3	6	1445104	1445109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_019702	AAT	2	6	1445132	1445137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_019702	TTA	2	6	1446080	1446085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_019702	AT	3	6	1446143	1446148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_019702	ATG	2	6	1446159	1446164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_019702	ATCAG	2	10	1446775	1446784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3617	NC_019702	TAAA	2	8	1446858	1446865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_019702	ATT	2	6	1446951	1446956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_019702	CT	3	6	1446963	1446968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_019702	AG	3	6	1451183	1451188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_019702	ATG	2	6	1451189	1451194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_019702	AAT	2	6	1451208	1451213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_019702	TAG	2	6	1451267	1451272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_019702	TTA	2	6	1452101	1452106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_019702	A	6	6	1452118	1452123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_019702	TGC	2	6	1452181	1452186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_019702	TAA	2	6	1452244	1452249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_019702	A	6	6	1452259	1452264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_019702	TAAT	2	8	1455659	1455666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_019702	TAA	2	6	1455723	1455728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_019702	CTG	2	6	1455788	1455793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_019702	T	7	7	1455808	1455814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3634	NC_019702	AAAG	2	8	1455948	1455955	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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