MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 10292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_019702	A	6	6	2549329	2549334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_019702	CTATTT	2	12	2549393	2549404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7003	NC_019702	A	6	6	2549422	2549427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_019702	ATTT	2	8	2549463	2549470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_019702	TCT	2	6	2549507	2549512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_019702	T	6	6	2550383	2550388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_019702	AAGT	2	8	2553278	2553285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_019702	TTA	2	6	2553317	2553322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_019702	TAGC	2	8	2553330	2553337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7010	NC_019702	CTTGA	2	10	2553367	2553376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7011	NC_019702	AAT	2	6	2553384	2553389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_019702	A	6	6	2553393	2553398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_019702	AGT	2	6	2553404	2553409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_019702	TACT	2	8	2553629	2553636	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7015	NC_019702	GCA	2	6	2553641	2553646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_019702	CAATC	2	10	2554124	2554133	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7017	NC_019702	AGTT	2	8	2554141	2554148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_019702	T	6	6	2558077	2558082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_019702	GTC	2	6	2558137	2558142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_019702	GGT	2	6	2558672	2558677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_019702	AT	3	6	2558705	2558710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_019702	TCC	2	6	2558779	2558784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_019702	TGA	2	6	2559684	2559689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_019702	TAA	2	6	2560166	2560171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_019702	ATT	2	6	2561948	2561953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_019702	ATT	2	6	2564019	2564024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_019702	AGG	2	6	2564031	2564036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_019702	TAATAT	2	12	2564043	2564054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_019702	ATCA	2	8	2564816	2564823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7030	NC_019702	TAT	2	6	2564851	2564856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_019702	TTA	2	6	2570187	2570192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_019702	TGA	2	6	2570351	2570356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_019702	TAC	2	6	2570454	2570459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_019702	TAG	2	6	2570513	2570518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_019702	CAT	2	6	2570554	2570559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_019702	CCTTGA	2	12	2570604	2570615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_019702	GTTAT	2	10	2570914	2570923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_019702	TTA	2	6	2570935	2570940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_019702	TTG	4	12	2572749	2572760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_019702	A	6	6	2572806	2572811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_019702	CAT	2	6	2572879	2572884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_019702	AATTCC	2	12	2572924	2572935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_019702	TTAA	2	8	2572987	2572994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_019702	TTG	2	6	2573004	2573009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_019702	GTG	2	6	2573515	2573520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_019702	T	6	6	2577762	2577767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_019702	AGA	2	6	2577809	2577814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_019702	TA	3	6	2581793	2581798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_019702	ATA	2	6	2583753	2583758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_019702	TAGA	2	8	2583802	2583809	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_019702	TGA	2	6	2583819	2583824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_019702	TCA	2	6	2587160	2587165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_019702	ATA	2	6	2587192	2587197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_019702	TTGG	2	8	2587242	2587249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_019702	A	7	7	2588419	2588425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_019702	A	7	7	2588435	2588441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_019702	A	6	6	2589516	2589521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_019702	AGTC	2	8	2590832	2590839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7059	NC_019702	CAA	2	6	2590996	2591001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_019702	TGA	2	6	2591044	2591049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_019702	AAGT	2	8	2591073	2591080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_019702	GATTT	2	10	2591538	2591547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_019702	TAT	2	6	2592282	2592287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_019702	T	6	6	2592291	2592296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_019702	TTA	2	6	2592298	2592303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_019702	T	8	8	2592321	2592328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_019702	T	6	6	2593135	2593140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_019702	TGATCT	2	12	2593228	2593239	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7069	NC_019702	ACA	2	6	2596198	2596203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_019702	AAT	2	6	2596287	2596292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_019702	CAC	2	6	2596342	2596347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7072	NC_019702	ATC	2	6	2596349	2596354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_019702	TC	3	6	2596382	2596387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_019702	TTC	2	6	2596394	2596399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_019702	TGC	2	6	2596439	2596444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_019702	AGT	2	6	2596448	2596453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_019702	CTTA	2	8	2596487	2596494	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7078	NC_019702	TCAT	2	8	2596500	2596507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7079	NC_019702	AAT	2	6	2596562	2596567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_019702	TAC	2	6	2596568	2596573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_019702	GCG	2	6	2596577	2596582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_019702	TTG	2	6	2596719	2596724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_019702	TTAATA	2	12	2596809	2596820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_019702	GATT	2	8	2596974	2596981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_019702	TCA	3	9	2596990	2596998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_019702	TTC	2	6	2597050	2597055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_019702	CATC	2	8	2597056	2597063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_019702	CCA	2	6	2597212	2597217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_019702	TGC	2	6	2597283	2597288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_019702	TGAA	2	8	2597305	2597312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_019702	AGT	2	6	2597315	2597320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_019702	CTT	2	6	2597329	2597334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_019702	CAT	2	6	2597360	2597365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_019702	GTG	2	6	2597421	2597426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_019702	AAC	2	6	2597454	2597459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_019702	ATTA	2	8	2597603	2597610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_019702	CTT	2	6	2597656	2597661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7098	NC_019702	AAT	2	6	2597666	2597671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_019702	ATTA	2	8	2597810	2597817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_019702	TGG	2	6	2597884	2597889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_019702	AGT	2	6	2597895	2597900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_019702	TGG	2	6	2597950	2597955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_019702	GGA	2	6	2598028	2598033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_019702	TTGC	2	8	2598047	2598054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7105	NC_019702	TTG	2	6	2598092	2598097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_019702	CCGAT	2	10	2598128	2598137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7107	NC_019702	TGCT	2	8	2598206	2598213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7108	NC_019702	TAA	2	6	2598331	2598336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_019702	ATA	2	6	2598375	2598380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_019702	CGC	2	6	2598458	2598463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7111	NC_019702	TAA	2	6	2598466	2598471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_019702	GTT	2	6	2598858	2598863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_019702	CCG	2	6	2598892	2598897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_019702	CCG	2	6	2598926	2598931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_019702	GAT	2	6	2599066	2599071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7118	NC_019702	GAG	2	6	2599286	2599291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_019702	GA	3	6	2599406	2599411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7123	NC_019702	GAA	2	6	2600894	2600899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_019702	AAT	2	6	2600908	2600913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_019702	CTA	3	9	2600941	2600949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7127	NC_019702	CTGG	2	8	2602697	2602704	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7128	NC_019702	AT	3	6	2603865	2603870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_019702	GAAT	2	8	2603872	2603879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7131	NC_019702	TAA	2	6	2605440	2605445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_019702	ATT	2	6	2606014	2606019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7133	NC_019702	GGC	2	6	2606075	2606080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7134	NC_019702	ACT	2	6	2606085	2606090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7136	NC_019702	AGA	2	6	2606157	2606162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7139	NC_019702	TA	3	6	2606563	2606568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7140	NC_019702	TAA	2	6	2606621	2606626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7142	NC_019702	GATA	2	8	2609349	2609356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7143	NC_019702	AAC	2	6	2609360	2609365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7153	NC_019702	ATTT	2	8	2611445	2611452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7164	NC_019702	TAA	2	6	2614842	2614847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7165	NC_019702	GTA	2	6	2614855	2614860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7167	NC_019702	A	6	6	2614927	2614932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7259	NC_019702	ATTG	2	8	2640134	2640141	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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