MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 10292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019702	TTA	2	6	2253077	2253082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_019702	TTAG	2	8	2253090	2253097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_019702	AGTT	2	8	2253195	2253202	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_019702	ATC	2	6	2253254	2253259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_019702	AGAT	2	8	2253278	2253285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019702	GCA	2	6	2253330	2253335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_019702	TCCC	2	8	2253377	2253384	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6008	NC_019702	GGC	2	6	2253481	2253486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_019702	AAT	2	6	2253563	2253568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_019702	TAAG	2	8	2253582	2253589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_019702	CA	3	6	2253592	2253597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_019702	CTT	2	6	2253636	2253641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_019702	A	6	6	2253698	2253703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_019702	GA	4	8	2253727	2253734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_019702	CT	3	6	2258275	2258280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_019702	TGT	2	6	2258305	2258310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019702	CTT	2	6	2258341	2258346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_019702	ATC	2	6	2258415	2258420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_019702	T	6	6	2258506	2258511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_019702	GTA	2	6	2258523	2258528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_019702	A	6	6	2258590	2258595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_019702	GA	3	6	2258625	2258630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_019702	GAG	2	6	2258691	2258696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_019702	TTG	2	6	2258697	2258702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_019702	TTTC	2	8	2258767	2258774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_019702	TCG	2	6	2258783	2258788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_019702	TGA	2	6	2258845	2258850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6029	NC_019702	TATT	2	8	2258875	2258882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019702	TAA	2	6	2258974	2258979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_019702	TTC	2	6	2259001	2259006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_019702	AAT	2	6	2259048	2259053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_019702	CAC	2	6	2259248	2259253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_019702	T	7	7	2259273	2259279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_019702	CCA	2	6	2259310	2259315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_019702	TGA	2	6	2259370	2259375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_019702	TC	3	6	2259401	2259406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_019702	TGA	2	6	2259486	2259491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_019702	TCATT	2	10	2259555	2259564	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_019702	TCAT	2	8	2259592	2259599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_019702	T	6	6	2259599	2259604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_019702	TTAA	2	8	2261151	2261158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019702	ACC	2	6	2261230	2261235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_019702	TGA	2	6	2261251	2261256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_019702	TAAAG	2	10	2261276	2261285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_019702	ATT	2	6	2261299	2261304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_019702	AAT	2	6	2261940	2261945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_019702	AT	3	6	2262887	2262892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_019702	A	6	6	2262911	2262916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_019702	AAAT	2	8	2262971	2262978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_019702	TTAAA	2	10	2263031	2263040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_019702	TTTG	2	8	2266306	2266313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_019702	ACT	2	6	2266320	2266325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_019702	ATGA	2	8	2268167	2268174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_019702	TA	4	8	2269715	2269722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_019702	TG	3	6	2269790	2269795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_019702	TAA	2	6	2271472	2271477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_019702	AAT	2	6	2271529	2271534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_019702	GTG	2	6	2271578	2271583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_019702	GACA	2	8	2271605	2271612	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_019702	CAA	2	6	2271668	2271673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_019702	TA	3	6	2273595	2273600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_019702	TAA	2	6	2273660	2273665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_019702	TTG	2	6	2273818	2273823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_019702	TGA	2	6	2273932	2273937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_019702	ATT	2	6	2273941	2273946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_019702	TGAT	2	8	2274019	2274026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_019702	TTA	2	6	2274041	2274046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_019702	TTTG	2	8	2274272	2274279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_019702	ATA	2	6	2274289	2274294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_019702	CCA	2	6	2275360	2275365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_019702	ATAG	2	8	2275453	2275460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_019702	TA	3	6	2276863	2276868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_019702	TTTA	2	8	2276873	2276880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6079	NC_019702	TATTT	2	10	2276909	2276918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_019702	TTTA	2	8	2277353	2277360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_019702	ACT	2	6	2277364	2277369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6083	NC_019702	TAGT	2	8	2278651	2278658	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_019702	TA	3	6	2278683	2278688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_019702	AG	3	6	2278743	2278748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_019702	GTTT	2	8	2278772	2278779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_019702	ACT	2	6	2278848	2278853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_019702	TGAG	2	8	2280616	2280623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_019702	T	6	6	2280743	2280748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_019702	AGT	2	6	2280852	2280857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6096	NC_019702	T	6	6	2284643	2284648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_019702	GTT	2	6	2284651	2284656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6099	NC_019702	AGT	2	6	2284741	2284746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_019702	TTG	2	6	2285665	2285670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_019702	TGA	2	6	2285884	2285889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6103	NC_019702	TAA	2	6	2285958	2285963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_019702	AAT	2	6	2286031	2286036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_019702	ATC	2	6	2286046	2286051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_019702	TAG	2	6	2286140	2286145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_019702	GTA	2	6	2286303	2286308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_019702	CT	3	6	2286344	2286349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_019702	GCA	2	6	2286374	2286379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_019702	TACC	2	8	2286443	2286450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_019702	TA	3	6	2286496	2286501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_019702	GCT	2	6	2286617	2286622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_019702	TTG	2	6	2286811	2286816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_019702	GAAT	2	8	2286818	2286825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_019702	T	6	6	2287005	2287010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_019702	T	7	7	2287048	2287054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_019702	AG	3	6	2287055	2287060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_019702	ATT	2	6	2288097	2288102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_019702	A	6	6	2288129	2288134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_019702	TAG	2	6	2288202	2288207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_019702	AAAC	2	8	2288215	2288222	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6123	NC_019702	TTA	2	6	2290821	2290826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_019702	T	6	6	2290846	2290851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_019702	CTG	2	6	2290853	2290858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_019702	TTAA	2	8	2290943	2290950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_019702	TAGA	2	8	2291001	2291008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_019702	GTCT	2	8	2291021	2291028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_019702	AGT	2	6	2291044	2291049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_019702	AGC	2	6	2291051	2291056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6132	NC_019702	CGC	2	6	2291149	2291154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6133	NC_019702	CTT	2	6	2291904	2291909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_019702	CTTC	2	8	2291928	2291935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6135	NC_019702	A	6	6	2291983	2291988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_019702	AT	3	6	2292104	2292109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_019702	GTTG	2	8	2292144	2292151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6140	NC_019702	GGA	2	6	2292199	2292204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_019702	T	6	6	2292243	2292248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_019702	AT	3	6	2292263	2292268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_019702	GATT	2	8	2292278	2292285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6164	NC_019702	TAATT	2	10	2300643	2300652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_019702	AG	3	6	2300671	2300676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6166	NC_019702	TAA	2	6	2300801	2300806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6167	NC_019702	GTA	2	6	2300831	2300836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6168	NC_019702	TGT	2	6	2300861	2300866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6246	NC_019702	ACTTT	2	10	2332035	2332044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6248	NC_019702	TC	3	6	2332082	2332087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6249	NC_019702	TAA	2	6	2332109	2332114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6251	NC_019702	TTA	2	6	2332143	2332148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_019702	T	6	6	2332312	2332317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_019702	GATA	2	8	2332406	2332413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_019702	A	7	7	2332413	2332419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_019702	A	6	6	2332508	2332513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_019702	AATTA	2	10	2332588	2332597	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_019702	CTG	2	6	2332607	2332612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_019702	A	8	8	2332730	2332737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_019702	A	6	6	2332786	2332791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_019702	TTG	2	6	2332838	2332843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_019702	TTG	2	6	2332850	2332855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_019702	AAG	2	6	2332868	2332873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_019702	TGTT	2	8	2332923	2332930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6264	NC_019702	A	6	6	2332969	2332974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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