MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	AACT	2	8	21	28	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019691	CGAT	2	8	38	45	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019691	AAT	2	6	52	57	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019691	TAA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019691	T	6	6	141	146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019691	ATCG	2	8	153	160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019691	AGG	2	6	317	322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019691	AAGC	2	8	344	351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019691	TGG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019691	TTTG	2	8	514	521	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019691	GGAT	2	8	612	619	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019691	ATG	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019691	GCA	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_019691	ATTT	2	8	750	757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019691	TGG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019691	GAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019691	TCA	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019691	ATT	2	6	967	972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019691	GTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019691	ATT	2	6	1237	1242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019691	T	6	6	2295	2300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019691	TGT	2	6	5962	5967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019691	T	8	8	6075	6082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019691	GGGGT	2	10	6120	6129	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019691	GGGGT	2	10	6153	6162	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019691	T	6	6	6177	6182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019691	GGGGT	2	10	6195	6204	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019691	GGGGT	2	10	6299	6308	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019691	GGGGT	2	10	6336	6345	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019691	AAT	2	6	6365	6370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019691	TA	3	6	6380	6385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019691	GT	3	6	6432	6437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019691	TCAG	2	8	6445	6452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_019691	AGC	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019691	TGA	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019691	GGGGT	2	10	6529	6538	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019691	GT	3	6	6543	6548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019691	TAT	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019691	CTA	2	6	8116	8121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019691	TAAA	2	8	11095	11102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019691	TGG	2	6	11289	11294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019691	GTTAG	2	10	11328	11337	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019691	GGC	2	6	11346	11351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019691	AATT	2	8	11357	11364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019691	CCTG	2	8	11394	11401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_019691	T	6	6	11416	11421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019691	GCA	2	6	11549	11554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019691	GTC	2	6	11633	11638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019691	AAT	2	6	11665	11670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019691	AGT	3	9	11700	11708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019691	TGCCC	2	10	11766	11775	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_019691	C	6	6	11840	11845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_019691	A	6	6	12154	12159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019691	GCC	2	6	12249	12254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_019691	TAGT	2	8	12308	12315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019691	TAC	2	6	13743	13748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019691	TGT	2	6	13907	13912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019691	TCC	2	6	14287	14292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_019691	TCGC	2	8	14303	14310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019691	TCTT	2	8	14339	14346	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019691	ATA	2	6	14366	14371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019691	TATT	2	8	14385	14392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019691	ATT	2	6	14399	14404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019691	TTA	2	6	14446	14451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019691	AC	4	8	15202	15209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_019691	AATT	2	8	15213	15220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019691	GACT	2	8	15598	15605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019691	GAG	2	6	15715	15720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019691	TTC	2	6	15788	15793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019691	GGT	2	6	15812	15817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019691	TGA	2	6	15818	15823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019691	GCC	2	6	15896	15901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019691	CCG	2	6	15978	15983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019691	AGA	2	6	16443	16448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019691	TC	3	6	16570	16575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019691	CAGA	2	8	16659	16666	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019691	CTGC	2	8	16674	16681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_019691	GTC	2	6	16757	16762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019691	AAAG	2	8	16906	16913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019691	ATG	2	6	17030	17035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019691	T	8	8	17056	17063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019691	TGCA	2	8	17081	17088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019691	GTA	2	6	17135	17140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019691	TGG	2	6	17159	17164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019691	CAT	2	6	17347	17352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019691	ATA	2	6	17364	17369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019691	TA	3	6	17386	17391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019691	ATA	2	6	17449	17454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019691	TTAC	2	8	17467	17474	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019691	AT	3	6	18196	18201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019691	CTA	2	6	18303	18308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019691	GCAA	2	8	18357	18364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_019691	A	6	6	18403	18408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019691	TAC	2	6	18411	18416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019691	ATA	2	6	18497	18502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019691	TTC	2	6	18546	18551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019691	AAT	2	6	18577	18582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019691	ACC	2	6	19360	19365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019691	CG	3	6	19521	19526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019691	ACG	2	6	19559	19564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019691	ATGCC	2	10	19654	19663	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_019691	CA	3	6	19664	19669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_019691	CCA	2	6	19683	19688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019691	TGA	2	6	19776	19781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019691	TAC	2	6	19802	19807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019691	ATTGAT	2	12	19836	19847	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019691	TAAT	2	8	20009	20016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019691	AT	3	6	20020	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019691	AGT	2	6	20047	20052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019691	TCA	2	6	20076	20081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019691	TCA	2	6	20198	20203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019691	GAA	2	6	20286	20291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019691	AGC	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019691	T	6	6	20418	20423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019691	TC	3	6	20448	20453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_019691	TTG	2	6	20488	20493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019691	TGAT	2	8	20621	20628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019691	TTG	2	6	20671	20676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019691	AAT	2	6	20772	20777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019691	CAA	2	6	20787	20792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019691	ATT	2	6	20894	20899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019691	A	8	8	20922	20929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019691	GAT	2	6	20932	20937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019691	A	6	6	20970	20975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019691	AAT	2	6	21024	21029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019691	AAC	2	6	21034	21039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019691	AAC	2	6	21164	21169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019691	GCT	2	6	21211	21216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019691	GAT	2	6	21305	21310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019691	TG	3	6	21326	21331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019691	AGCA	2	8	21341	21348	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019691	TGG	2	6	21462	21467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019691	T	6	6	21469	21474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019691	AGC	2	6	21537	21542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019691	GAA	2	6	21634	21639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019691	CTG	2	6	21673	21678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019691	GTGG	2	8	21703	21710	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019691	TGG	4	12	21708	21719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019691	AGA	2	6	21726	21731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019691	TTG	2	6	21836	21841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019691	CCG	4	12	21866	21877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_019691	AAG	2	6	21973	21978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019691	TAAT	2	8	21995	22002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019691	AACTA	2	10	22113	22122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_019691	ATT	2	6	22207	22212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019691	CCG	2	6	22272	22277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_019691	A	6	6	23306	23311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019691	A	6	6	24782	24787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019691	TCA	2	6	24995	25000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_019691	ATT	2	6	25098	25103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019691	ATG	2	6	26240	26245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019691	ACC	2	6	26427	26432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_019691	TAC	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019691	A	8	8	26529	26536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019691	ATC	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019691	CTTT	2	8	26679	26686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_019691	GAC	2	6	26830	26835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019691	GTCT	2	8	26925	26932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_019691	GA	3	6	27001	27006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019691	GGT	2	6	27308	27313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019691	TAA	2	6	27332	27337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019691	AGG	2	6	30065	30070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019691	TAT	2	6	30654	30659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_019691	TC	3	6	31595	31600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_019691	CAGA	2	8	31684	31691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
166	NC_019691	CTGC	2	8	31699	31706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
167	NC_019691	GTC	2	6	31782	31787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_019691	ATG	2	6	32055	32060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019691	T	8	8	32081	32088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019691	TGCA	2	8	32106	32113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_019691	GTA	2	6	32160	32165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_019691	TGG	2	6	32184	32189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_019691	CAT	2	6	32372	32377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_019691	ATA	2	6	32389	32394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_019691	TAAT	2	8	32926	32933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_019691	AG	3	6	32945	32950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_019691	AACT	2	8	34287	34294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_019691	T	6	6	34491	34496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_019691	CAG	2	6	34519	34524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_019691	AGC	3	9	34553	34561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_019691	AACTA	3	15	34567	34581	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_019691	A	9	9	35228	35236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_019691	TTC	2	6	39112	39117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_019691	TAATT	2	10	39132	39141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019691	CAA	2	6	39150	39155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_019691	TTG	2	6	39162	39167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_019691	CTA	2	6	39277	39282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_019691	GTT	2	6	39338	39343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_019691	TA	3	6	39369	39374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_019691	A	6	6	40164	40169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_019691	AT	3	6	40216	40221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_019691	AGA	2	6	40224	40229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_019691	TAAT	2	8	40308	40315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_019691	TAA	3	9	40350	40358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_019691	ATA	2	6	40369	40374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_019691	T	6	6	40803	40808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_019691	TTA	2	6	40831	40836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_019691	CTG	2	6	58627	58632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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277	NC_019691	A	8	8	58909	58916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_019691	TAA	2	6	58924	58929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_019691	A	6	6	58928	58933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019691	CTA	2	6	58938	58943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_019691	T	6	6	58953	58958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019691	GAG	2	6	59055	59060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.