MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019680	CTG	2	6	1447934	1447939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_019680	GGA	2	6	1447944	1447949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_019680	ATG	2	6	1448090	1448095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_019680	TCA	2	6	1448168	1448173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_019680	GA	3	6	1448261	1448266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019680	GTCG	2	8	1448316	1448323	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3507	NC_019680	AGT	2	6	1448355	1448360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_019680	TA	3	6	1448423	1448428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_019680	ATG	2	6	1448458	1448463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_019680	A	6	6	1448484	1448489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_019680	TCA	2	6	1448547	1448552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_019680	TTA	2	6	1448575	1448580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_019680	CTGG	2	8	1448582	1448589	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3514	NC_019680	TTA	2	6	1448913	1448918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_019680	ATCTA	2	10	1448998	1449007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3516	NC_019680	GA	3	6	1449012	1449017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_019680	GAGT	2	8	1449040	1449047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_019680	CTA	2	6	1449057	1449062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_019680	AAT	2	6	1449123	1449128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019680	ATTC	2	8	1449144	1449151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_019680	TGTT	2	8	1449170	1449177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_019680	CT	3	6	1449222	1449227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_019680	AGC	2	6	1450573	1450578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_019680	AAT	2	6	1450689	1450694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_019680	T	6	6	1450730	1450735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_019680	GATG	2	8	1450818	1450825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_019680	CA	3	6	1450838	1450843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_019680	ATC	2	6	1450986	1450991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_019680	CT	3	6	1451295	1451300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_019680	GAA	2	6	1451329	1451334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_019680	GA	3	6	1451362	1451367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_019680	T	7	7	1451394	1451400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_019680	ACA	2	6	1451448	1451453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_019680	AAGG	2	8	1451458	1451465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_019680	TTA	2	6	1452800	1452805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_019680	GAAC	2	8	1452835	1452842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_019680	T	6	6	1452890	1452895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_019680	CCTGG	2	10	1454945	1454954	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3539	NC_019680	AAC	2	6	1456419	1456424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_019680	CAG	2	6	1456452	1456457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3542	NC_019680	GCT	2	6	1458422	1458427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_019680	TTAA	2	8	1458435	1458442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_019680	G	6	6	1458966	1458971	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_019680	CCG	2	6	1459002	1459007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_019680	C	6	6	1459021	1459026	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3547	NC_019680	TA	3	6	1459030	1459035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_019680	ACT	2	6	1459066	1459071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_019680	CTC	2	6	1462097	1462102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_019680	TAAT	2	8	1467564	1467571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_019680	ATA	2	6	1467697	1467702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_019680	AG	3	6	1467707	1467712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_019680	AGTT	2	8	1467731	1467738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_019680	TTA	2	6	1467805	1467810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3556	NC_019680	CCG	2	6	1467858	1467863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_019680	T	6	6	1468499	1468504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_019680	A	6	6	1468521	1468526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_019680	TTG	2	6	1468547	1468552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3561	NC_019680	GT	3	6	1468563	1468568	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_019680	CAT	2	6	1468575	1468580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_019680	CAA	2	6	1468583	1468588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_019680	TGA	2	6	1469072	1469077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_019680	TCA	2	6	1469129	1469134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_019680	CCAGC	2	10	1469163	1469172	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3567	NC_019680	AAGA	2	8	1471324	1471331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_019680	CAAA	2	8	1471351	1471358	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_019680	A	6	6	1471364	1471369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_019680	TAAA	2	8	1471411	1471418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_019680	TGG	2	6	1474398	1474403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3575	NC_019680	C	7	7	1474560	1474566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3576	NC_019680	CTT	2	6	1474676	1474681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_019680	TCTT	2	8	1474695	1474702	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3578	NC_019680	T	6	6	1474754	1474759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_019680	GT	3	6	1474792	1474797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_019680	T	6	6	1474797	1474802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3583	NC_019680	AAT	2	6	1482544	1482549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_019680	TAG	2	6	1482660	1482665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3586	NC_019680	TTG	2	6	1482742	1482747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_019680	GGC	2	6	1482894	1482899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_019680	TAG	2	6	1482927	1482932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_019680	AAC	2	6	1483018	1483023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_019680	GAT	2	6	1483155	1483160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3594	NC_019680	TGA	2	6	1483234	1483239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_019680	TTTC	2	8	1483259	1483266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_019680	TTATT	2	10	1484639	1484648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_019680	GGGCT	2	10	1485236	1485245	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3598	NC_019680	CTTG	2	8	1485270	1485277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_019680	GCA	2	6	1485344	1485349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3601	NC_019680	G	6	6	1487721	1487726	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_019680	TGAA	2	8	1487732	1487739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_019680	TGA	2	6	1489876	1489881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_019680	AT	3	6	1489922	1489927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_019680	TC	3	6	1489996	1490001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_019680	GGAG	2	8	1490015	1490022	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_019680	AGA	2	6	1490036	1490041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_019680	GCT	2	6	1490045	1490050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_019680	TGAT	2	8	1491542	1491549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_019680	TAT	2	6	1491564	1491569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_019680	ATG	2	6	1495854	1495859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_019680	GAC	2	6	1499818	1499823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_019680	GAG	2	6	1499838	1499843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_019680	CAT	2	6	1499860	1499865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_019680	CGG	2	6	1500048	1500053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_019680	GA	3	6	1500917	1500922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_019680	GAG	2	6	1500949	1500954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_019680	ACC	2	6	1500962	1500967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_019680	ATC	2	6	1501042	1501047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3622	NC_019680	GAT	2	6	1503205	1503210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_019680	AT	3	6	1504507	1504512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_019680	GCA	2	6	1505564	1505569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_019680	AATCC	2	10	1506723	1506732	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3626	NC_019680	TCTG	2	8	1506740	1506747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_019680	CAG	2	6	1506769	1506774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_019680	ACGA	2	8	1506794	1506801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_019680	A	6	6	1506801	1506806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_019680	GAC	2	6	1506813	1506818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_019680	CGG	2	6	1506851	1506856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3633	NC_019680	CAC	2	6	1506900	1506905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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