MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019680	AAT	2	6	651814	651819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_019680	GGC	2	6	651952	651957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_019680	CTT	2	6	652000	652005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_019680	GTA	2	6	652018	652023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_019680	ATT	2	6	652033	652038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_019680	AAT	2	6	652937	652942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_019680	TAA	2	6	654108	654113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_019680	AAAT	2	8	654132	654139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_019680	CAG	2	6	654409	654414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_019680	TTA	2	6	654419	654424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_019680	TAAA	2	8	654584	654591	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_019680	TGA	2	6	654699	654704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_019680	CGG	2	6	654715	654720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_019680	CTCAAG	2	12	654769	654780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_019680	TAA	2	6	654932	654937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_019680	G	6	6	655922	655927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_019680	GCC	2	6	655943	655948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_019680	TCAA	2	8	656552	656559	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_019680	A	7	7	656582	656588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_019680	AGT	2	6	656596	656601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_019680	AAAC	2	8	656630	656637	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_019680	ACA	2	6	656671	656676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_019680	A	6	6	656766	656771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_019680	AC	3	6	656865	656870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_019680	ACA	2	6	656954	656959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_019680	TC	3	6	657019	657024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_019680	AAG	2	6	657139	657144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_019680	GGT	2	6	658353	658358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_019680	GCC	2	6	658392	658397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_019680	AG	3	6	658504	658509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_019680	GAA	2	6	658511	658516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_019680	AGCT	2	8	659616	659623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_019680	GAC	2	6	659625	659630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_019680	ATG	2	6	660646	660651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_019680	CAA	2	6	660656	660661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_019680	ATTG	2	8	661068	661075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019680	TCGA	2	8	661085	661092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_019680	TAA	2	6	661154	661159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_019680	GAT	2	6	661172	661177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_019680	GAAA	2	8	662302	662309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_019680	GA	4	8	662334	662341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_019680	TTG	2	6	662397	662402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_019680	CTT	2	6	662440	662445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_019680	AAC	2	6	665631	665636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_019680	GAT	2	6	666983	666988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_019680	TAGGT	2	10	667726	667735	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_019680	AT	3	6	667757	667762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_019680	TCTTT	2	10	669038	669047	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1549	NC_019680	GA	3	6	669102	669107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_019680	AACTTT	2	12	669183	669194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1551	NC_019680	AG	4	8	669556	669563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_019680	CG	3	6	673277	673282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_019680	GAT	2	6	673303	673308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_019680	TAA	2	6	673323	673328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019680	CAA	2	6	674233	674238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_019680	TATT	2	8	674253	674260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_019680	GTC	2	6	674298	674303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_019680	GGGA	2	8	674311	674318	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_019680	GCCA	2	8	674341	674348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_019680	G	6	6	674433	674438	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_019680	TCCAG	2	10	675101	675110	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_019680	ATT	2	6	675125	675130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_019680	TCTG	2	8	675272	675279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_019680	GGC	2	6	675976	675981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_019680	TGTC	2	8	675994	676001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_019680	CCT	2	6	676011	676016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_019680	CTA	2	6	676058	676063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_019680	CAA	2	6	676120	676125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_019680	TCT	2	6	676134	676139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_019680	CT	3	6	676138	676143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_019680	AAG	2	6	676148	676153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_019680	TTC	2	6	676192	676197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_019680	CAT	2	6	676439	676444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_019680	TGA	2	6	676471	676476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_019680	T	7	7	676486	676492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_019680	ATTA	2	8	676514	676521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_019680	CCT	2	6	676586	676591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1581	NC_019680	AAC	2	6	679289	679294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_019680	CAG	2	6	679380	679385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_019680	G	6	6	679499	679504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_019680	T	6	6	682268	682273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_019680	ATT	2	6	682742	682747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_019680	CTC	2	6	689336	689341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_019680	GTT	2	6	689342	689347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019680	T	6	6	689449	689454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_019680	GGC	2	6	689519	689524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_019680	GGT	2	6	689621	689626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_019680	GGT	2	6	689708	689713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_019680	TGG	2	6	690256	690261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_019680	AGG	2	6	690271	690276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_019680	AACT	2	8	690456	690463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_019680	A	6	6	690515	690520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_019680	ATG	2	6	692638	692643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_019680	ACC	2	6	692696	692701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_019680	AGA	2	6	694031	694036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_019680	TC	3	6	696543	696548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_019680	GCC	2	6	697959	697964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_019680	TCA	2	6	699201	699206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_019680	TCT	2	6	699247	699252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_019680	AAT	2	6	699265	699270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_019680	ATC	2	6	699305	699310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_019680	TCC	2	6	699342	699347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_019680	CGG	2	6	699348	699353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_019680	TA	3	6	699748	699753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_019680	T	7	7	699809	699815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_019680	TAG	2	6	700484	700489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1615	NC_019680	A	6	6	700545	700550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_019680	GAT	2	6	700617	700622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_019680	AGTC	2	8	701413	701420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_019680	CT	3	6	701495	701500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_019680	ATT	2	6	701783	701788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_019680	TC	3	6	701854	701859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_019680	A	6	6	701894	701899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_019680	ATT	3	9	701925	701933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_019680	CAGC	2	8	701967	701974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_019680	C	6	6	701983	701988	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1626	NC_019680	TTG	2	6	702033	702038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019680	TGC	3	9	703618	703626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_019680	TAT	2	6	703652	703657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_019680	CAT	2	6	703682	703687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_019680	AAGT	2	8	703689	703696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_019680	T	6	6	703786	703791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_019680	ACT	2	6	703866	703871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_019680	GGA	2	6	706152	706157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_019680	T	7	7	706247	706253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_019680	A	6	6	706257	706262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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