MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_019680	TAG	2	6	3023612	3023617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_019680	TGA	2	6	3024593	3024598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_019680	CAT	2	6	3024618	3024623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_019680	ATC	2	6	3024655	3024660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_019680	TTA	2	6	3026279	3026284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_019680	GATT	2	8	3026309	3026316	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_019680	GCA	2	6	3027545	3027550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_019680	G	6	6	3027666	3027671	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_019680	ATC	2	6	3027688	3027693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_019680	AAC	2	6	3032138	3032143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_019680	TGA	2	6	3032152	3032157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_019680	CCACA	2	10	3032230	3032239	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8013	NC_019680	CT	3	6	3032434	3032439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_019680	A	6	6	3032465	3032470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_019680	AC	3	6	3033105	3033110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_019680	ACA	2	6	3033126	3033131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_019680	TAT	2	6	3033459	3033464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_019680	GCCAG	2	10	3033481	3033490	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8019	NC_019680	TGGG	2	8	3033709	3033716	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_019680	TTA	2	6	3033760	3033765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_019680	GGAT	2	8	3034428	3034435	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_019680	GGAT	2	8	3034463	3034470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_019680	G	6	6	3034497	3034502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_019680	GCTG	3	12	3034527	3034538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8025	NC_019680	TGT	2	6	3034540	3034545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_019680	AATA	3	12	3034553	3034564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_019680	GA	3	6	3034633	3034638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_019680	A	6	6	3034763	3034768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_019680	CCAG	2	8	3034772	3034779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_019680	ATT	2	6	3034851	3034856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_019680	AG	3	6	3034888	3034893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_019680	GGCT	2	8	3034909	3034916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8033	NC_019680	ATCC	2	8	3034967	3034974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_019680	GTT	2	6	3035014	3035019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_019680	GAG	2	6	3035104	3035109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_019680	GTG	2	6	3037417	3037422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_019680	AAT	2	6	3039623	3039628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_019680	AAG	2	6	3039696	3039701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_019680	AT	3	6	3039711	3039716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_019680	CCGG	2	8	3039780	3039787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_019680	GAC	2	6	3039826	3039831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_019680	ATG	2	6	3045816	3045821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_019680	A	6	6	3045865	3045870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_019680	AGC	2	6	3045884	3045889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_019680	AAAG	2	8	3046451	3046458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_019680	AAT	2	6	3046918	3046923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_019680	TTC	2	6	3046957	3046962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_019680	ATA	2	6	3048323	3048328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_019680	TTG	2	6	3048386	3048391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_019680	TTAA	2	8	3048561	3048568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_019680	ATG	2	6	3048586	3048591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_019680	TAAT	2	8	3048620	3048627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_019680	ACC	2	6	3049612	3049617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8054	NC_019680	TCT	2	6	3050174	3050179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_019680	TAA	2	6	3050211	3050216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_019680	TTGT	2	8	3050230	3050237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_019680	TAT	2	6	3050246	3050251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_019680	GGA	2	6	3050265	3050270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_019680	ATG	2	6	3050316	3050321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_019680	CT	3	6	3051127	3051132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8061	NC_019680	AGA	2	6	3053274	3053279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_019680	AG	3	6	3053285	3053290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_019680	TAGC	2	8	3053303	3053310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8064	NC_019680	ATC	2	6	3053324	3053329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8066	NC_019680	GA	3	6	3053456	3053461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_019680	CTG	2	6	3053687	3053692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_019680	TAA	2	6	3053707	3053712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_019680	A	6	6	3053876	3053881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8074	NC_019680	TGG	2	6	3054248	3054253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_019680	TCT	2	6	3058186	3058191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_019680	A	7	7	3058221	3058227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_019680	TCT	2	6	3058458	3058463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8086	NC_019680	CTC	2	6	3059866	3059871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_019680	GTAT	2	8	3059912	3059919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_019680	GACT	2	8	3073260	3073267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8099	NC_019680	TCC	2	6	3073368	3073373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8105	NC_019680	GCG	2	6	3075778	3075783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_019680	CT	3	6	3075867	3075872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8114	NC_019680	CCT	2	6	3082251	3082256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_019680	A	6	6	3082267	3082272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8125	NC_019680	TAGGG	2	10	3084219	3084228	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_019680	AT	3	6	3085025	3085030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_019680	GGA	2	6	3085404	3085409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_019680	A	6	6	3085459	3085464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_019680	ATC	2	6	3085498	3085503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_019680	AAG	2	6	3085554	3085559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8398	NC_019680	TAG	2	6	3225012	3225017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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