MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_019680	CAT	2	6	2774976	2774981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_019680	GTG	2	6	2774993	2774998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_019680	GTG	2	6	2775014	2775019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_019680	GGT	2	6	2775049	2775054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_019680	ACG	2	6	2775088	2775093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_019680	CATAGC	2	12	2775168	2775179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_019680	CTG	2	6	2775187	2775192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_019680	TCAC	2	8	2775200	2775207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_019680	C	6	6	2775282	2775287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7010	NC_019680	CGT	2	6	2775300	2775305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_019680	GAG	2	6	2775346	2775351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_019680	GCGGTT	2	12	2775415	2775426	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7013	NC_019680	TCA	2	6	2775551	2775556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_019680	CCA	2	6	2775597	2775602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7015	NC_019680	GGT	2	6	2775754	2775759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_019680	GGT	2	6	2775880	2775885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_019680	TTC	2	6	2775886	2775891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_019680	CGC	2	6	2775988	2775993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7019	NC_019680	TGAG	2	8	2776061	2776068	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_019680	TGA	2	6	2776125	2776130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_019680	GCCG	2	8	2776135	2776142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_019680	TGC	2	6	2776157	2776162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_019680	GTCATA	2	12	2776219	2776230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7024	NC_019680	CCGA	2	8	2776240	2776247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_019680	CAT	2	6	2776305	2776310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_019680	CAC	2	6	2776330	2776335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7027	NC_019680	GA	3	6	2776346	2776351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_019680	GGT	2	6	2776360	2776365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_019680	GCT	2	6	2776481	2776486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_019680	TG	3	6	2776487	2776492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_019680	GGT	2	6	2776564	2776569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_019680	C	6	6	2776652	2776657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7033	NC_019680	TGG	2	6	2776761	2776766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_019680	CTCCC	2	10	2776772	2776781	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
7035	NC_019680	TGGG	2	8	2776832	2776839	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_019680	CAGGGT	2	12	2776840	2776851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7037	NC_019680	GCT	2	6	2776855	2776860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_019680	TAA	2	6	2776892	2776897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_019680	T	6	6	2776944	2776949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_019680	ACC	2	6	2777717	2777722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7041	NC_019680	GAG	2	6	2780004	2780009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_019680	ATC	2	6	2780411	2780416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_019680	TG	3	6	2780475	2780480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_019680	GTA	2	6	2780509	2780514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_019680	ACT	2	6	2780522	2780527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_019680	GAT	2	6	2780538	2780543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_019680	CGA	2	6	2780545	2780550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_019680	AGG	2	6	2780552	2780557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_019680	CTG	2	6	2780569	2780574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_019680	GCGGTA	2	12	2780599	2780610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7051	NC_019680	GCA	2	6	2780649	2780654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_019680	CGT	2	6	2780766	2780771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_019680	GTG	2	6	2780855	2780860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_019680	AAT	2	6	2780884	2780889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_019680	CCA	2	6	2781454	2781459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7056	NC_019680	TAG	2	6	2781485	2781490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_019680	GCT	2	6	2781646	2781651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_019680	TC	3	6	2781693	2781698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7059	NC_019680	ATT	2	6	2781750	2781755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_019680	AGG	2	6	2781774	2781779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_019680	GCGGTA	2	12	2781821	2781832	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7062	NC_019680	GGT	2	6	2781922	2781927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_019680	GTTG	2	8	2782005	2782012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_019680	TGA	2	6	2782063	2782068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_019680	GTA	2	6	2782206	2782211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_019680	GTT	2	6	2782212	2782217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_019680	TCAA	2	8	2782252	2782259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7068	NC_019680	AG	4	8	2782266	2782273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_019680	CTA	2	6	2782277	2782282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_019680	GTC	2	6	2782320	2782325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_019680	AGC	2	6	2782329	2782334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_019680	GCAA	2	8	2782381	2782388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7073	NC_019680	CT	3	6	2782765	2782770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_019680	CTC	2	6	2782842	2782847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7075	NC_019680	CAA	2	6	2798575	2798580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_019680	TTAAG	2	10	2798624	2798633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_019680	A	7	7	2799518	2799524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_019680	CAT	2	6	2799582	2799587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_019680	TAAA	2	8	2799729	2799736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_019680	ACC	2	6	2799848	2799853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7081	NC_019680	TTA	2	6	2799888	2799893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_019680	AAT	2	6	2800039	2800044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_019680	TGA	2	6	2800249	2800254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_019680	TGA	2	6	2800354	2800359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_019680	CA	3	6	2800366	2800371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_019680	TAT	2	6	2800440	2800445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_019680	CT	3	6	2800531	2800536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_019680	AGG	2	6	2800597	2800602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_019680	TA	4	8	2800607	2800614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NC_019680	GAGT	2	8	2800625	2800632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_019680	AGCC	2	8	2800665	2800672	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7092	NC_019680	AGAC	2	8	2800681	2800688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7093	NC_019680	AAG	2	6	2800739	2800744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_019680	CAG	2	6	2800751	2800756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_019680	T	6	6	2800832	2800837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_019680	AGTC	2	8	2800910	2800917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7097	NC_019680	GTT	2	6	2800974	2800979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_019680	TA	4	8	2801736	2801743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_019680	TTA	2	6	2801745	2801750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_019680	TTA	2	6	2801813	2801818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_019680	TCA	2	6	2802327	2802332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_019680	TGA	2	6	2802361	2802366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_019680	CAT	2	6	2802437	2802442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_019680	GAAT	2	8	2802485	2802492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_019680	GTC	2	6	2802493	2802498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_019680	GGT	2	6	2802500	2802505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_019680	GTT	2	6	2802523	2802528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_019680	TTC	2	6	2802533	2802538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_019680	TCC	2	6	2802573	2802578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_019680	GTT	2	6	2802631	2802636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_019680	TTTG	2	8	2802661	2802668	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_019680	TCCA	2	8	2802683	2802690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_019680	AATG	2	8	2802779	2802786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_019680	TGT	2	6	2802787	2802792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_019680	GAT	2	6	2802896	2802901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_019680	GGC	2	6	2802905	2802910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_019680	TCT	2	6	2802912	2802917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_019680	GAT	2	6	2802941	2802946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_019680	GGAT	2	8	2802964	2802971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_019680	TGA	2	6	2803003	2803008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_019680	TGC	2	6	2803020	2803025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_019680	AGG	2	6	2803071	2803076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_019680	GGC	2	6	2803081	2803086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_019680	AT	3	6	2803177	2803182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_019680	CGG	2	6	2803186	2803191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_019680	TGT	2	6	2803295	2803300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_019680	T	6	6	2803322	2803327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_019680	GTGCG	2	10	2803345	2803354	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7129	NC_019680	GCC	2	6	2803381	2803386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7130	NC_019680	GCT	2	6	2803420	2803425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_019680	GAT	2	6	2803463	2803468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_019680	CCTCG	2	10	2803477	2803486	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7133	NC_019680	GATTTG	2	12	2803532	2803543	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7134	NC_019680	AGA	2	6	2803612	2803617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7139	NC_019680	TGGCTG	2	12	2804229	2804240	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7140	NC_019680	CTG	2	6	2804294	2804299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7250	NC_019680	CTA	2	6	2813981	2813986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7253	NC_019680	GA	3	6	2814264	2814269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7254	NC_019680	GCT	2	6	2814280	2814285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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