MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_019680	CTAGT	2	10	2613055	2613064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6502	NC_019680	CTC	2	6	2613081	2613086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_019680	T	6	6	2613100	2613105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_019680	GTT	2	6	2613158	2613163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_019680	GCA	3	9	2615312	2615320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_019680	TCA	2	6	2615443	2615448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_019680	ATAC	2	8	2615585	2615592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6508	NC_019680	TAACGG	2	12	2615682	2615693	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6509	NC_019680	AGC	2	6	2615826	2615831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_019680	ATG	3	9	2615894	2615902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_019680	AAG	2	6	2616860	2616865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_019680	GAG	2	6	2616874	2616879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_019680	G	6	6	2616890	2616895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_019680	GAT	2	6	2617944	2617949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_019680	TGC	2	6	2617992	2617997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_019680	GACA	2	8	2619878	2619885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6517	NC_019680	TAT	2	6	2622644	2622649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_019680	TGC	2	6	2622720	2622725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_019680	TGT	2	6	2623783	2623788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_019680	TGG	2	6	2624689	2624694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_019680	TAGTT	2	10	2624771	2624780	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_019680	TAA	2	6	2624785	2624790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_019680	TC	3	6	2624922	2624927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6524	NC_019680	GA	3	6	2624940	2624945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_019680	ATCA	2	8	2625028	2625035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6526	NC_019680	ACA	2	6	2625099	2625104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_019680	CGC	2	6	2625122	2625127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_019680	GTA	2	6	2625151	2625156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_019680	T	7	7	2625160	2625166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_019680	ATTAAA	2	12	2625169	2625180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_019680	GTA	2	6	2625181	2625186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_019680	TGC	2	6	2625239	2625244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_019680	GCTC	2	8	2625275	2625282	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_019680	TTAT	2	8	2625323	2625330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_019680	CTA	2	6	2625359	2625364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_019680	TCT	2	6	2625369	2625374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_019680	ATG	2	6	2625417	2625422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_019680	ACC	2	6	2625425	2625430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_019680	TTG	2	6	2626895	2626900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_019680	TTA	2	6	2626914	2626919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_019680	CTG	2	6	2626968	2626973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_019680	GAC	2	6	2626986	2626991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_019680	CAT	2	6	2628155	2628160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_019680	GAG	2	6	2630993	2630998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_019680	AAT	2	6	2631016	2631021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_019680	TGT	2	6	2631022	2631027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_019680	TTTA	2	8	2631251	2631258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_019680	CAA	2	6	2631264	2631269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_019680	GA	3	6	2631277	2631282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_019680	TAA	2	6	2631703	2631708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_019680	GAG	2	6	2641749	2641754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_019680	A	6	6	2641826	2641831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_019680	TTA	2	6	2643006	2643011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_019680	CTA	2	6	2643034	2643039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_019680	TGGG	2	8	2643044	2643051	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_019680	TGT	2	6	2643063	2643068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_019680	A	7	7	2643149	2643155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_019680	TC	3	6	2645544	2645549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6559	NC_019680	GTT	2	6	2645704	2645709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_019680	GA	4	8	2645732	2645739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_019680	CAAA	2	8	2646386	2646393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6562	NC_019680	CCG	2	6	2647024	2647029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6563	NC_019680	TAA	2	6	2647657	2647662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_019680	GCC	3	9	2647698	2647706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_019680	AAGT	2	8	2647751	2647758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_019680	ATA	2	6	2647782	2647787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_019680	A	6	6	2647793	2647798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_019680	A	7	7	2647843	2647849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_019680	TCTA	2	8	2648654	2648661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_019680	GTA	2	6	2648696	2648701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_019680	ATT	2	6	2648705	2648710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_019680	GTC	2	6	2648736	2648741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_019680	GTT	2	6	2648745	2648750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_019680	GGA	2	6	2648774	2648779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6577	NC_019680	TGGAT	2	10	2649885	2649894	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_019680	CTG	2	6	2652180	2652185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6580	NC_019680	TTG	2	6	2652348	2652353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6582	NC_019680	TTTAAG	2	12	2653875	2653886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6584	NC_019680	TGG	2	6	2653961	2653966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6588	NC_019680	TTA	2	6	2659535	2659540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6591	NC_019680	GAGT	2	8	2659625	2659632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_019680	TCG	2	6	2667243	2667248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6601	NC_019680	T	6	6	2667353	2667358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_019680	TA	3	6	2667415	2667420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_019680	TGA	2	6	2668875	2668880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_019680	T	6	6	2670831	2670836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_019680	TCA	2	6	2670842	2670847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6609	NC_019680	ATT	2	6	2672417	2672422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_019680	ATT	2	6	2672495	2672500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_019680	TGC	2	6	2672668	2672673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6619	NC_019680	TCAAA	2	10	2673515	2673524	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6620	NC_019680	A	6	6	2673635	2673640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_019680	CAG	2	6	2673644	2673649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6623	NC_019680	AGA	2	6	2673728	2673733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_019680	CCT	2	6	2673762	2673767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_019680	ATGG	2	8	2673794	2673801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_019680	ATA	2	6	2673837	2673842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_019680	A	6	6	2673842	2673847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_019680	TAA	3	9	2673911	2673919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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