MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 9496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019680	TTC	2	6	2411270	2411275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_019680	GTCCT	2	10	2411303	2411312	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6003	NC_019680	CAG	2	6	2413318	2413323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_019680	TGC	2	6	2417147	2417152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_019680	A	7	7	2417183	2417189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_019680	TGG	2	6	2417201	2417206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019680	ATA	2	6	2417222	2417227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_019680	TAA	2	6	2417820	2417825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019680	TTTAAT	2	12	2417831	2417842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_019680	TTA	2	6	2417844	2417849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_019680	A	7	7	2417849	2417855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_019680	CAA	2	6	2418382	2418387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_019680	CCTC	2	8	2418469	2418476	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6014	NC_019680	TCA	2	6	2418526	2418531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_019680	GA	3	6	2420920	2420925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_019680	ATTT	2	8	2422913	2422920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019680	TAAT	2	8	2422980	2422987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019680	TTG	2	6	2423050	2423055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_019680	T	6	6	2423062	2423067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_019680	GCT	2	6	2423077	2423082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_019680	A	6	6	2423106	2423111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_019680	ATT	2	6	2424043	2424048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_019680	AT	4	8	2424061	2424068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_019680	A	6	6	2424105	2424110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_019680	TAAA	2	8	2424111	2424118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_019680	AGT	2	6	2424188	2424193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019680	CAA	2	6	2424246	2424251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_019680	A	7	7	2424250	2424256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019680	ATG	2	6	2424289	2424294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019680	TGC	2	6	2426799	2426804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_019680	TGG	2	6	2426824	2426829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_019680	GAA	2	6	2426891	2426896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_019680	ACC	2	6	2426902	2426907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_019680	AGT	2	6	2426910	2426915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_019680	CCA	2	6	2427207	2427212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_019680	GTA	2	6	2427220	2427225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_019680	T	7	7	2427258	2427264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_019680	T	6	6	2429411	2429416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_019680	GTA	2	6	2429707	2429712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_019680	CTAC	2	8	2429724	2429731	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_019680	T	6	6	2429757	2429762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_019680	TAAT	2	8	2429861	2429868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019680	TATT	2	8	2429869	2429876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019680	TAA	2	6	2429907	2429912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_019680	AAT	2	6	2429920	2429925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_019680	A	7	7	2429991	2429997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_019680	CCT	2	6	2431261	2431266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_019680	CT	3	6	2431265	2431270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_019680	GATCA	2	10	2431320	2431329	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_019680	ACT	2	6	2431336	2431341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_019680	GCC	2	6	2431351	2431356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_019680	GCCCC	2	10	2431362	2431371	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6053	NC_019680	TATCAA	2	12	2431383	2431394	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6054	NC_019680	TAT	2	6	2432593	2432598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_019680	TGG	2	6	2432629	2432634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_019680	AAG	2	6	2432673	2432678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_019680	CCAG	2	8	2432714	2432721	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_019680	TCG	2	6	2432803	2432808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_019680	GA	4	8	2432818	2432825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_019680	GTGG	2	8	2433471	2433478	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_019680	T	6	6	2433564	2433569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_019680	GCT	2	6	2433603	2433608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_019680	TAC	3	9	2433609	2433617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_019680	AC	3	6	2433616	2433621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_019680	CCT	2	6	2434008	2434013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6066	NC_019680	TCC	2	6	2434107	2434112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_019680	T	7	7	2434155	2434161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_019680	TCC	2	6	2434169	2434174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_019680	TAATT	2	10	2436682	2436691	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_019680	AGC	2	6	2437959	2437964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_019680	AGA	2	6	2437970	2437975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_019680	ATG	2	6	2438151	2438156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_019680	ATGA	2	8	2438227	2438234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_019680	ATCT	2	8	2439012	2439019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_019680	TGA	2	6	2439029	2439034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_019680	GGC	2	6	2439866	2439871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_019680	GTCAA	2	10	2439897	2439906	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6078	NC_019680	TGAAT	2	10	2439944	2439953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_019680	TTG	2	6	2439970	2439975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_019680	GGT	2	6	2441806	2441811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_019680	G	6	6	2441894	2441899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_019680	TGC	2	6	2441917	2441922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_019680	T	6	6	2444462	2444467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_019680	AAT	2	6	2444546	2444551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_019680	TTAA	2	8	2444566	2444573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_019680	TGT	2	6	2449467	2449472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_019680	TGA	2	6	2449486	2449491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_019680	CTGAG	2	10	2449503	2449512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6089	NC_019680	GTT	2	6	2450175	2450180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_019680	ATT	2	6	2450191	2450196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_019680	CTTA	2	8	2450234	2450241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_019680	TCA	2	6	2450396	2450401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_019680	AG	4	8	2450465	2450472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_019680	AGC	2	6	2450505	2450510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_019680	AAT	2	6	2450576	2450581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_019680	ATT	2	6	2450626	2450631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_019680	AAC	2	6	2450662	2450667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_019680	CAAAG	2	10	2450722	2450731	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6099	NC_019680	TGAC	2	8	2451722	2451729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_019680	TGAAT	2	10	2451776	2451785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_019680	GTC	2	6	2453239	2453244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_019680	GAG	2	6	2453274	2453279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_019680	AAC	2	6	2453369	2453374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_019680	TAAC	2	8	2453381	2453388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_019680	CT	3	6	2453497	2453502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6106	NC_019680	CAA	2	6	2457791	2457796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_019680	GAG	2	6	2457812	2457817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_019680	CAA	2	6	2458752	2458757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_019680	ATC	2	6	2458779	2458784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_019680	ACC	2	6	2458790	2458795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_019680	TAA	2	6	2459333	2459338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_019680	AAG	2	6	2459930	2459935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_019680	AG	3	6	2459959	2459964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_019680	GTTT	2	8	2459994	2460001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_019680	TGC	2	6	2460117	2460122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_019680	TGC	2	6	2460216	2460221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_019680	AAT	2	6	2460299	2460304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_019680	TA	3	6	2460323	2460328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_019680	TCTT	2	8	2460340	2460347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_019680	ATG	2	6	2460427	2460432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_019680	GAG	2	6	2460512	2460517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_019680	GAA	2	6	2460538	2460543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_019680	AC	3	6	2460570	2460575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_019680	CTGAA	2	10	2460579	2460588	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6125	NC_019680	GATG	2	8	2460658	2460665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_019680	TCCTT	2	10	2460728	2460737	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6127	NC_019680	TGA	2	6	2460797	2460802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_019680	GCA	2	6	2460829	2460834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_019680	GCC	2	6	2461952	2461957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_019680	TGGGT	2	10	2463216	2463225	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_019680	CCAA	2	8	2463240	2463247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_019680	GA	3	6	2463248	2463253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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